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„FMRIB Software Library“ – Versionsunterschied

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'''FSL''' (Akronym für ''FMRIB Software Library'') ist eines der am häufigsten verwendeten Softwarepakete zur Anzeige (FSLview), Bearbeitung und Auswertung von [[Funktionelle Magnetresonanztomographie|funktionellen Magnetresonanztomografie]]-Bilddaten. Es wird am [[Oxford Centre for Functional MRI of the Brain]] der [[University of Oxford]] entwickelt und unter einer selbstgewählten [[Open-Source]]-Lizenz veröffentlicht ([[Halbfreie Software]]) - außer FSLview, dass unter der [[GNU General Public License|GPLv2]] steht.<ref>[http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/Licence FslWiki - License]</ref> Es läuft unter dem Betriebssystem [[GNU/Linux]] und dort sowohl in der [[Kommandozeile]] als auch als grafische Anwendungen in vielen Fällen. Durch die Kompatibilität der textbasierten und grafischen Programme und dadurch, dass letztere die Befehlsstruktur ausgeben oder [[Logdatei|protokollieren]] sind Auswertungen mit FSL sehr leicht zu [[Stapelverarbeitung|automatisieren]]. Auch gibt es eine FSL-Schnittstelle in der [[Software Pipelining|Software-Pipeline]] Nipype<ref>[http://nipy.sourceforge.net/nipype/ Neuroimaging in Python - Pipelines and Interfaces — nipy pipeline and interfaces package]</ref>, die durch Python-Skripte eine kontrollierte, strukturierte und [[Parallele Programmierung|parallelisierte]] Verwendung von verschiedenen Software-Paketen zur Auswertung von MRT-Daten bietet.
'''FSL''' (Akronym für ''FMRIB Software Library'') ist ein Softwarepakete zur Anzeige (FSLview), Bearbeitung und Auswertung von [[Funktionelle Magnetresonanztomographie|funktionellen Magnetresonanztomografie]]-Bilddaten. Es wird am [[Oxford Centre for Functional MRI of the Brain]] der [[University of Oxford]] entwickelt und unter einer selbstgewählten [[Open-Source]]-Lizenz veröffentlicht ([[Halbfreie Software]]) - außer FSLview, dass unter der [[GNU General Public License|GPLv2]] steht.<ref>[http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/Licence FslWiki - License]</ref> Es läuft unter dem Betriebssystem [[GNU/Linux]] und dort sowohl in der [[Kommandozeile]] als auch als grafische Anwendungen in vielen Fällen. Durch die Kompatibilität der textbasierten und grafischen Programme und dadurch, dass letztere die Befehlsstruktur ausgeben oder [[Logdatei|protokollieren]] sind Auswertungen mit FSL [[Stapelverarbeitung|automatisierbar]]. Auch gibt es eine FSL-Schnittstelle in der [[Software Pipelining|Software-Pipeline]] Nipype<ref>[http://nipy.sourceforge.net/nipype/ Neuroimaging in Python - Pipelines and Interfaces — nipy pipeline and interfaces package]</ref>, die durch Python-Skripte eine kontrollierte, strukturierte und [[Parallele Programmierung|parallelisierte]] Verwendung von verschiedenen Software-Paketen zur Auswertung von MRT-Daten bietet.


Die Stärke von FSL liegt allgemein in ihrer Komplexität und Aktualität und speziell in der [[Unabhängigkeitsanalyse]] (Independent component analysis) durch Melodic für die Artefakt-Suche und die Analyse von [[Resting state fMRI|Resting-State-Netzwerk]]en und weiterhin FSLview und den Tools zur Auswertung von [[Diffusions-Tensor-Bildgebung|diffusionsgewichteten Magnetresonanztomografien]]. <ref>Russell A. Poldrack, Jeanette A. Mumford, Thomas E. Nichols: ''Handbook of Functional MRI Data Analysis'', Cambridge University Press 2011, ISBN 978-0521517669</ref>
Die Stärke von FSL liegt allgemein in ihrer Komplexität und Aktualität und speziell in der [[Unabhängigkeitsanalyse]] (Independent component analysis) durch Melodic für die Artefakt-Suche und die Analyse von [[Resting state fMRI|Resting-State-Netzwerk]]en und weiterhin FSLview und den Tools zur Auswertung von [[Diffusions-Tensor-Bildgebung|diffusionsgewichteten Magnetresonanztomografien]]. <ref>Russell A. Poldrack, Jeanette A. Mumford, Thomas E. Nichols: ''Handbook of Functional MRI Data Analysis'', Cambridge University Press 2011, ISBN 978-0521517669</ref>

Version vom 23. April 2014, 10:47 Uhr

FSL (Akronym für FMRIB Software Library) ist ein Softwarepakete zur Anzeige (FSLview), Bearbeitung und Auswertung von funktionellen Magnetresonanztomografie-Bilddaten. Es wird am Oxford Centre for Functional MRI of the Brain der University of Oxford entwickelt und unter einer selbstgewählten Open-Source-Lizenz veröffentlicht (Halbfreie Software) - außer FSLview, dass unter der GPLv2 steht.[1] Es läuft unter dem Betriebssystem GNU/Linux und dort sowohl in der Kommandozeile als auch als grafische Anwendungen in vielen Fällen. Durch die Kompatibilität der textbasierten und grafischen Programme und dadurch, dass letztere die Befehlsstruktur ausgeben oder protokollieren sind Auswertungen mit FSL automatisierbar. Auch gibt es eine FSL-Schnittstelle in der Software-Pipeline Nipype[2], die durch Python-Skripte eine kontrollierte, strukturierte und parallelisierte Verwendung von verschiedenen Software-Paketen zur Auswertung von MRT-Daten bietet.

Die Stärke von FSL liegt allgemein in ihrer Komplexität und Aktualität und speziell in der Unabhängigkeitsanalyse (Independent component analysis) durch Melodic für die Artefakt-Suche und die Analyse von Resting-State-Netzwerken und weiterhin FSLview und den Tools zur Auswertung von diffusionsgewichteten Magnetresonanztomografien. [3]

Siehe auch

Einzelnachweise

  1. ↑ FslWiki - License
  2. ↑ Neuroimaging in Python - Pipelines and Interfaces — nipy pipeline and interfaces package
  3. ↑ Russell A. Poldrack, Jeanette A. Mumford, Thomas E. Nichols: Handbook of Functional MRI Data Analysis, Cambridge University Press 2011, ISBN 978-0521517669
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