Tchériba und Interaktom: Unterschied zwischen den Seiten
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Als '''Interaktom''' [{{IPA|ɪntɐʔakˈtoːm, ɪntərakˈtoːm}}] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt. Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt '''Interaktomik''' (''Interactomics''). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. |
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! colspan="2" bgcolor="#e3e3e3" | Tchériba |
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| Status: || ''commune rurale'' |
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| Region: || [[Boucle du Mouhoun]] |
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| Provinz: || [[Mouhoun (Provinz)|Mouhoun]] |
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| Fläche: || |
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| Einwohner: || 39.778<ref>[http://www.insd.bf/Documents/Publications/INSD/Publications/Resultats_enquetes/Autres%20enq/Rapport_preliminaire_RGPH06.pdf Vorläufige Ergebnisse des Zensus 2006]</ref> |
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| Bevölkerungsdichte: || |
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| Gliederung: || 30 Dörfer |
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| Bürgermeister: || Biékoi Romain Ko |
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| Präfekt: || |
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! colspan="2" bgcolor="#e3e3e3" | Lage |
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| colspan="2" align="center" |{{Positionskarte|Burkina Faso |
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== Geschichte == |
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'''Tchériba''' ist sowohl eine Gemeinde ({{frS|''commune rurale''}}) als auch ein dasselbe Gebiet umfassendes Departement im [[Westafrika|westafrikanischen]] Staat [[Burkina Faso]], in der Region [[Boucle du Mouhoun]] und der Provinz [[Mouhoun (Provinz)|Mouhoun]]. Die Gemeinde hat in 30 Dörfern 39.778 Einwohner. |
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Auch nach der vollständige Sequenzierung verschiedener [[Genom]]e, darunter der des menschlichen Genoms im [[Humangenomprojekt]], blieben viele Fragen in Bezug auf das Verständnis der Funktionsweise von Organismen offen. Als einer der nächsten Schritte (vgl. [[-omik]]) gilt das Aufdecken der Wechselwirkungen innerhalb des [[Proteom]]s. Beispielsweise ist das Verständnis der komplexen [[Protein-Protein-Interaktion|Protein-Protein-Wechselwirkungen]] in [[Signaltransduktionsweg]]en ein Ansatz zur Therapie verschiedener Krankheiten wie [[Krebs (Medizin)|Krebs]]. |
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Besonders weit fortgeschritten ist die Erforschung des Interaktoms des Modellorganismus Backhefe (''[[Saccharomyces cerevisiae]]''), dessen Proteom und Interaktom zu großen Teilen bekannt sind. Beim Menschen ist der Wissensstand diesbezüglich weit geringer: Eine auf netzwerkanalytischen Methoden beruhende Arbeit von Stunpf et al. kam zum geschätzten Ergebnis <ref> Stumpf M, Thorne T, et al. (2008) [http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/105/19/6959?etoc Estimating the size of the human interactome]. [[PNAS]], 105(19): 6959 </ref>, dass das menschliche Interaktom ungefähr 650.000 Protein-Wechselwirkungen enthält, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind <ref>L.A. Amaral [http://www.pnas.org/cgi/content/full/105/19/6795 A truer measure of our ignorance]. [[PNAS]], 105(19):6795</ref>. Die Autoren schlugen außerdem die Größe des Interaktom-Netzwerks als Maß für die Komplexität eines Organismus vor. Aus den Schätzwerten folgt, dass im Gegensatz zum Genom (das Genom von [[Kohl]] enthält mehr Gene als das des Menschen, siehe [[Genom#Genomgrößen]]) das Interaktom des Menschen deutlich größer ist als das von anderen Organismen die wir als weniger komplex bezeichnen würden. So könnte die Größe des Interaktoms unserem intuitiven Verständnis eines Komplexitätsmaßes besser entsprechen. |
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== Einzelnachweise == |
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== Methoden zur Erforschung von Interaktomen == |
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{{Vorlage:Navigationsleiste Departements/Gemeinden in der Provinz Mouhoun}} |
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Es gibt verschiedene Methoden zur Analyse von Protein-Protein-Wechselwirkungen, darunter [[Yeast Two-Hybrid System]] oder TAP (''Tandem Affinity Purification''). Allerdings sind viele der gegenwärtigen Techniken noch fehleranfällig. |
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Es existieren verschiedene Datenbanken für Interaktom-Netzwerke, beispielsweise: |
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* [[Reactome]] |
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* Database of Interacting Proteins (DIP)<ref>[http://bioinfow.dep.usal.es/apid/ APID (Agile Protein Interaction DataAnalizer)]</ref> |
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* IntAct – The Molecular Interaction Database<ref>[http://www.ebi.ac.uk/intact IntAct]</ref> |
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* PSIMAP<ref>[http://psimap.com/index.php/Main_Page PSIMAP]</ref> |
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* BioGRID<ref>[http://www.thebiogrid.org/ BioGRID - Database of Protein and Genetic Interactions]</ref> |
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== Belege == |
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== Weblinks == |
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[[Kategorie:Ort in Burkina Faso|Tcheriba]] |
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* heise.de: [http://www.heise.de/tp/r4/artikel/27/27905/1.html Menschen sind komplizierter als Fadenwürmer], 14. Mai 2008 |
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[[en:Tchériba Department]] |
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[[Kategorie:Biochemie]] |
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[[fr:Tchériba (département)]] |
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[[Kategorie:Bioinformatik]] |
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[[it:Tchériba]] |
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[[pt:Tchériba (departamento)]] |
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[[vi:Tchériba]] |
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Version vom 17. Juli 2013, 11:47 Uhr
Als Interaktom [] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt. Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt Interaktomik (Interactomics). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen.
Geschichte
Auch nach der vollständige Sequenzierung verschiedener Genome, darunter der des menschlichen Genoms im Humangenomprojekt, blieben viele Fragen in Bezug auf das Verständnis der Funktionsweise von Organismen offen. Als einer der nächsten Schritte (vgl. -omik) gilt das Aufdecken der Wechselwirkungen innerhalb des Proteoms. Beispielsweise ist das Verständnis der komplexen Protein-Protein-Wechselwirkungen in Signaltransduktionswegen ein Ansatz zur Therapie verschiedener Krankheiten wie Krebs.
Besonders weit fortgeschritten ist die Erforschung des Interaktoms des Modellorganismus Backhefe (Saccharomyces cerevisiae), dessen Proteom und Interaktom zu großen Teilen bekannt sind. Beim Menschen ist der Wissensstand diesbezüglich weit geringer: Eine auf netzwerkanalytischen Methoden beruhende Arbeit von Stunpf et al. kam zum geschätzten Ergebnis [1], dass das menschliche Interaktom ungefähr 650.000 Protein-Wechselwirkungen enthält, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind [2]. Die Autoren schlugen außerdem die Größe des Interaktom-Netzwerks als Maß für die Komplexität eines Organismus vor. Aus den Schätzwerten folgt, dass im Gegensatz zum Genom (das Genom von Kohl enthält mehr Gene als das des Menschen, siehe Genom#Genomgrößen) das Interaktom des Menschen deutlich größer ist als das von anderen Organismen die wir als weniger komplex bezeichnen würden. So könnte die Größe des Interaktoms unserem intuitiven Verständnis eines Komplexitätsmaßes besser entsprechen.
Methoden zur Erforschung von Interaktomen
Es gibt verschiedene Methoden zur Analyse von Protein-Protein-Wechselwirkungen, darunter Yeast Two-Hybrid System oder TAP (Tandem Affinity Purification). Allerdings sind viele der gegenwärtigen Techniken noch fehleranfällig.
Es existieren verschiedene Datenbanken für Interaktom-Netzwerke, beispielsweise:
- Reactome
- Database of Interacting Proteins (DIP)[3]
- IntAct – The Molecular Interaction Database[4]
- PSIMAP[5]
- BioGRID[6]
Belege
- ↑ Stumpf M, Thorne T, et al. (2008) Estimating the size of the human interactome. PNAS, 105(19): 6959
- ↑ L.A. Amaral A truer measure of our ignorance. PNAS, 105(19):6795
- ↑ APID (Agile Protein Interaction DataAnalizer)
- ↑ IntAct
- ↑ PSIMAP
- ↑ BioGRID - Database of Protein and Genetic Interactions
Weblinks
- heise.de: Menschen sind komplizierter als Fadenwürmer, 14. Mai 2008