„Transporter Classification Database“ – Versionsunterschied
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Version vom 3. April 2013, 08:06 Uhr
Die Transporter Classification Database (TCDB) ist die von der International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) anerkannte Klassifizierung für Membrantransport-Proteine. Das Klassifizierungssystem wurde analog zu dem EC-Nummer-System zur Klassifizierung von Enzymen konzipiert.
Die Kurzform der Einordnung hat die Form a.B.c.d.e, wobei Kleinbuchstaben Zahlen darstellen. Von links nach rechts handelt es sich um Transporter-Klasse, -Subklasse und -Familie, sowie -Subfamilie und -Substrat(bereich). Die Einordnung von Orthologen und Paralogen erfolgt also unter dieselbe Nummer.
Literatur
- Saier MH, Tran CV, Barabote RD: TCDB: the Transporter Classification Database for membrane transport protein analyses and information. In: Nucleic Acids Res. 34. Jahrgang, Database issue, Januar 2006, S. D181–D186, doi:10.1093/nar/gkj001, PMID 16381841, PMC 1334385 (freier Volltext).
- Busch W, Saier MH: The transporter classification (TC) system, 2002. In: Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 37. Jahrgang, Nr. 5, 2002, S. 287–337, PMID 12449427.