Quelltext der Seite Multilocus Sequence Analysis

'''Multi-Locus Sequence Analysis''' (zu deutsch ''Multi-[[Genlocus|Locus]]-Sequenzanalyse'', MLSA) ist eine [[Biochemie|biochemische]] und [[Bioinformatik|bioinformatische]] Methode der [[Phylogenomik]] zur Bestimmung von [[Verwandtschaftsgrad]]en zwischen [[Art (Biologie)|Arten]] und Unterarten, insbesondere von [[Prokaryoten]].<ref name="books-UfexAwAAQBAJ-221">Michael Goodfellow, Iain Sutcliffe, Jongsik Chun: ''New Approaches to Prokaryotic Systematics.'' ISBN 0128001763. S. 221.</ref>

== Eigenschaften ==
Um ein eindeutigeres Ergebnis zu erhalten, wird meistens ein [[Klonen|Klon]] per [[Ausstrich (Mikrobiologie)|Ausstrich]] isoliert. Mit dem Klon wird eine [[DNA-Extraktion]] durchgeführt. Die MLSA verwendet die [[Polymerase-Kettenreaktion]] (PCR) zur Vermehrung von mindestens fünf bis sieben [[Haushaltsgen]]en, gefolgt von einer [[DNA-Sequenzierung]] der Haushaltsgene.<ref name="books-UfexAwAAQBAJ-221" /> Die dadurch ermittelten [[DNA-Sequenz]]en werden ''[[in silico]]'' aneinandergehängt („concateniert“) und dann einer [[DNA-Sequenzanalyse]] unterzogen.<ref name="books-7ksrDwAAQBAJ-PT186">Rainer Kurmayer, Kaarina Sivonen, Annick Wilmotte, Nico Salmaso: ''Molecular Tools for the Detection and Quantification of Toxigenic Cyanobacteria.'' ISBN 978-1-119-33210-7 ({{Google Buch|BuchID=7ksrDwAAQBAJ|SeitenID=PT186}}).</ref>

Die MLSA kann auch mit dem [[Multilocus Sequence Typing]] (MLST) kombiniert werden, in dem nur die sich unterscheidenden Haushaltsgene aus einem vorher durchgeführten MLST untersucht werden.<ref name="books-7ksrDwAAQBAJ-PT186" /> Oftmals wird die MLSA zusätzlich zu einer Sequenzierung der 16S-[[Ribosomale DNA|rDNA]] verwendet.<ref name="books-7ksrDwAAQBAJ-PT186" />

== Literatur ==
* S. P. Glaeser, P. Kämpfer: ''Multilocus sequence analysis (MLSA) in prokaryotic taxonomy.'' In: ''Systematic and applied microbiology.'' Band 38, Nummer 4, Juni 2015, S.&nbsp;237–245, {{DOI|10.1016/j.syapm.2015.03.007}}, PMID 25959541.

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Nukleinsäure-Methode]]
[[Kategorie:Bioinformatik]]
[[Kategorie:Mikrobiologie]]