Simplified Molecular Input Line Entry System - Versionsgeschichte

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	== Weblinks ==		== Weblinks ==
	* [~~http~~://daylight.com/smiles/ SMILES-Website]		* [https://daylight.com/smiles/ SMILES-Website]
	* {{Webarchiv \|url=http://esc.syrres.com/esc/docsmile.htm \|archive-is=20130630092713 \|text=Beschreibung der Sprache}}		* {{Webarchiv \|url=http://esc.syrres.com/esc/docsmile.htm \|archive-is=20130630092713 \|text=Beschreibung der Sprache}}
	* [~~http~~://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [~~http~~://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]		* [https://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [https://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]
	* [~~http~~://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html „SMARTS – SMILES Extension“] Einführung in SMARTS		* [https://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html „SMARTS – SMILES Extension“] Einführung in SMARTS
	* [http://opensmiles.org/opensmiles.html OpenSMILES-Spezifikation]		* [http://opensmiles.org/opensmiles.html OpenSMILES-Spezifikation]

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	== Erweiterung ==		== Erweiterung ==
	SMARTS ist eine Erweiterung von SMILES, die das Suchen nach molekularen Substrukturen ermöglicht. Hierzu wurde SMILES, um [[Wildcard (Informatik)\|Wildcards]] oder spezifische Bindungen (z. B. aromatische) anzugeben, modifiziert. Es gilt, dass jeder gültige SMILES-Ausdruck ebenfalls als SMARTS verwendet werden darf. Diese Regel gilt andersherum nicht. SMARTS werden vor allem für Suchanwendungen bei chemischen Datenbanken verwendet.		SMARTS ist eine Erweiterung von SMILES, die das Suchen nach molekularen Substrukturen ermöglicht. Hierzu wurde SMILES, um [[Wildcard (Informatik)\|Wildcards]] oder spezifische Bindungen (z. B. aromatische) anzugeben, modifiziert. Es gilt, dass jeder gültige SMILES-Ausdruck ebenfalls als SMARTS verwendet werden darf. Diese Regel gilt andersherum nicht. SMARTS werden vor allem für Suchanwendungen bei chemischen Datenbanken verwendet.

	== Siehe auch ==
	* [[Wiswesser Line Notation]] (WLN)
	* [[Chemische Formel]]
	* [[Konstitutionsformel]]
	* [[International Chemical Identifier]]

	== Weblinks ==		== Weblinks ==

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	'''Simplified Molecular Input Line Entry System''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.		'''Simplified Molecular Input Line Entry System''' ('''SMILES''', zuweilen auch für '''Simplified Molecular Line Entry Specification''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.

	Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt.<ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=28 \|Nummer=1 \|Datum=1988 \|DOI=10.1021/ci00057a005 \|Seiten=31–36}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger, Arthur Weininger, Joseph L. Weininger \|Titel=SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=29 \|Nummer=2 \|Datum=1989 \|DOI=10.1021/ci00062a008 \|Seiten=97–101}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=30 \|Nummer=3 \|Datum=1990 \|DOI=10.1021/ci00067a005 \|Seiten=237–243}}</ref> Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.		Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt.<ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=28 \|Nummer=1 \|Datum=1988 \|DOI=10.1021/ci00057a005 \|Seiten=31–36}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger, Arthur Weininger, Joseph L. Weininger \|Titel=SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=29 \|Nummer=2 \|Datum=1989 \|DOI=10.1021/ci00062a008 \|Seiten=97–101}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=30 \|Nummer=3 \|Datum=1990 \|DOI=10.1021/ci00067a005 \|Seiten=237–243}}</ref> Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.

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	'''Simplified Molecular Input Line Entry ~~Specification~~''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.		'''Simplified Molecular Input Line Entry System''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.

	Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt.<ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=28 \|Nummer=1 \|Datum=1988 \|DOI=10.1021/ci00057a005 \|Seiten=31–36}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger, Arthur Weininger, Joseph L. Weininger \|Titel=SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=29 \|Nummer=2 \|Datum=1989 \|DOI=10.1021/ci00062a008 \|Seiten=97–101}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=30 \|Nummer=3 \|Datum=1990 \|DOI=10.1021/ci00067a005 \|Seiten=237–243}}</ref> Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.		Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt.<ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=28 \|Nummer=1 \|Datum=1988 \|DOI=10.1021/ci00057a005 \|Seiten=31–36}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger, Arthur Weininger, Joseph L. Weininger \|Titel=SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=29 \|Nummer=2 \|Datum=1989 \|DOI=10.1021/ci00062a008 \|Seiten=97–101}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=30 \|Nummer=3 \|Datum=1990 \|DOI=10.1021/ci00067a005 \|Seiten=237–243}}</ref> Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.

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Einzelnachweise

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	'''Simplified Molecular Input Line Entry Specification''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.		'''Simplified Molecular Input Line Entry Specification''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.

	Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt. Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.		Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt.<ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES, a chemical language and information system. 1. Introduction to methodology and encoding rules \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=28 \|Nummer=1 \|Datum=1988 \|DOI=10.1021/ci00057a005 \|Seiten=31–36}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger, Arthur Weininger, Joseph L. Weininger \|Titel=SMILES. 2. Algorithm for generation of unique SMILES notation \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=29 \|Nummer=2 \|Datum=1989 \|DOI=10.1021/ci00062a008 \|Seiten=97–101}}</ref><ref>{{Literatur \|Autor=David Weininger \|Titel=SMILES. 3. DEPICT. Graphical depiction of chemical structures \|Sammelwerk=Journal of Chemical Information and Computer Sciences \|Band=30 \|Nummer=3 \|Datum=1990 \|DOI=10.1021/ci00067a005 \|Seiten=237–243}}</ref> Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.

	Da die SMILES-Sprache durch die Firma Daylight kontrolliert wird und einige Probleme mit der [[Stereochemie]] und [[Tautomerie]] hat, hat die [[IUPAC]] eine eigene lineare Molekülrepresentation, [[INCHI\|InChI]], entwickelt, die frei verfügbar ist.		Da die SMILES-Sprache durch die Firma Daylight kontrolliert wird und einige Probleme mit der [[Stereochemie]] und [[Tautomerie]] hat, hat die [[IUPAC]] eine eigene lineare Molekülrepresentation, [[INCHI\|InChI]], entwickelt, die frei verfügbar ist.

Elrond: Änderung 244324716 von 188.22.44.23 rückgängig gemacht; Dann müsste das Lemma auch umbenannt werden

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Änderung 244324716 von 188.22.44.23 rückgängig gemacht; Dann müsste das Lemma auch umbenannt werden

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	'''Simplified Molecular Input Line Entry ~~System~~''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.		'''Simplified Molecular Input Line Entry Specification''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.

	Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt. Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.		Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt. Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.

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https://daylight.com/smiles/

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	'''Simplified Molecular Input Line Entry ~~Specification~~''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.		'''Simplified Molecular Input Line Entry System''' ('''SMILES''') ist ein [[Chemie\|chemischer]] Strukturcode, bei dem die Strukturen beliebiger [[Molekül]]e stark vereinfacht als ([[ASCII]]-)[[Zeichenkette]] wiedergegeben werden. Mehrere Molekül-Editoren können SMILES-Strings importieren und so zweidimensionale und dreidimensionale Modelle erzeugen.

	Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt. Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.		Die ursprüngliche SMILES-Spezifikation wurde von [[Arthur Weininger]] und [[David Weininger]] in den späten 1980ern entwickelt. Insbesondere die [[Daylight Chemical Information Systems Inc.]] betrieb in den folgenden Jahren die Weiterentwicklung und Modifikation der Spezifikation. Im Jahr 2007 wurde schließlich ein [[offener Standard]] namens ''OpenSMILES'' von ''Blue Obelisk'', einer chemisch orientierten Open-Source-Community, entwickelt.

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	Um die Notation zu vereinfachen, können die eckigen Klammern bei Elementen der sogenannten „organischen Teilmenge“ weggelassen werden.		Um die Notation zu vereinfachen, können die eckigen Klammern bei Elementen der sogenannten „organischen Teilmenge“ weggelassen werden.
	Wenn die Klammern weggelassen werden, dann werden die [[Wertigkeit (Chemie)\|freien Valenzen]] des Atoms auf die niedrigste Standardvalenz nach der abgebildeten Tabelle mit Wasserstoffatomen aufgefüllt.		Wenn die Klammern weggelassen werden, dann werden die [[Wertigkeit (Chemie)\|freien Valenzen]] des Atoms auf die niedrigste Standardvalenz nach der abgebildeten Tabelle mit Wasserstoffatomen aufgefüllt.
	So reicht zum Beispiel für die Eingabe von [[Wasser]] ein <code>O</code>, und für [[Methan]] ein <code>C</code>.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.1 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.1 ~~\|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot~~ }}</ref>		So reicht zum Beispiel für die Eingabe von [[Wasser]] ein <code>O</code>, und für [[Methan]] ein <code>C</code>.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.1 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.1}}</ref>

	{\| class="wikitable"		{\| class="wikitable"
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	Bindungen in [[Aromaten\|aromatischen Systemen]] können statt durch abwechselnde Doppel- und Einfachbindungen durch einen Doppelpunkt symbolisiert werden.		Bindungen in [[Aromaten\|aromatischen Systemen]] können statt durch abwechselnde Doppel- und Einfachbindungen durch einen Doppelpunkt symbolisiert werden.

	Um die Schreibweise noch weiter zu vereinfachen, dürfen die Symbole für Einfachbindungen und aromatische Bindungen weggelassen werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.2 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.2 ~~\|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot~~ }}</ref>		Um die Schreibweise noch weiter zu vereinfachen, dürfen die Symbole für Einfachbindungen und aromatische Bindungen weggelassen werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.2 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.2}}</ref>

	=== Verzweigungen ===		=== Verzweigungen ===

	Atome mit drei oder mehr Bindungen sind Ausgangspunkt von Verzweigungen. Dabei wird nach dem entsprechenden Atom erst die Seitenkette in runden Klammern gesetzt, bevor die weiteren Bindungen folgen. Die Klammerebenen und damit die Verzweigungen können beliebig tief verschachtelt werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.3 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.3 ~~\|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot~~ }}</ref>		Atome mit drei oder mehr Bindungen sind Ausgangspunkt von Verzweigungen. Dabei wird nach dem entsprechenden Atom erst die Seitenkette in runden Klammern gesetzt, bevor die weiteren Bindungen folgen. Die Klammerebenen und damit die Verzweigungen können beliebig tief verschachtelt werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.3 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.3}}</ref>

	Beispiele:		Beispiele:
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	=== Getrennte Strukturen ===		=== Getrennte Strukturen ===

	Bei Strukturen, die nicht zusammenhängen, wie z. B. Ionenbindungen wird ein Punkt (.) zwischen die getrennten Moleküle gesetzt.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.7 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.7 ~~\|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot~~ }}</ref><br />		Bei Strukturen, die nicht zusammenhängen, wie z. B. Ionenbindungen wird ein Punkt (.) zwischen die getrennten Moleküle gesetzt.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.7 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.7}}</ref><br />
	Beispiel: Natriumhydrogencarbonat (Na<sup>+</sup>HCO<sub>3</sub><sup>−</sup>) = <code>[Na+].O=C([O-])O</code>		Beispiel: Natriumhydrogencarbonat (Na<sup>+</sup>HCO<sub>3</sub><sup>−</sup>) = <code>[Na+].O=C([O-])O</code>

	=== Cyclische Strukturen ===		=== Cyclische Strukturen ===
	Eines der größten Probleme einer solchen Sprache ist es, cyclische Strukturen darzustellen.		Eines der größten Probleme einer solchen Sprache ist es, cyclische Strukturen darzustellen.
	Bei SMILES geschieht dies dadurch, dass man nach einem Atom, das mit einem anderen Atom verbunden werden soll, welches weiter hinten steht, einen Index schreibt; dies macht man auch bei dem anderen Atom und die beiden sind verbunden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.4 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.4 ~~\|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot~~ }}</ref>		Bei SMILES geschieht dies dadurch, dass man nach einem Atom, das mit einem anderen Atom verbunden werden soll, welches weiter hinten steht, einen Index schreibt; dies macht man auch bei dem anderen Atom und die beiden sind verbunden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.4 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.4}}</ref>
	Bei aromatischen Ringen werden die ringbildenden Atome kleingeschrieben.		Bei aromatischen Ringen werden die ringbildenden Atome kleingeschrieben.

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	* [[Wiswesser Line Notation]] (WLN)		* [[Wiswesser Line Notation]] (WLN)
	* [[Chemische Formel]]		* [[Chemische Formel]]
	* [[Gruppenformel]]
	* [[Konstitutionsformel]]		* [[Konstitutionsformel]]
	* [[International Chemical Identifier]]		* [[International Chemical Identifier]]
Zeile 136:		Zeile 135:
	* [http://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [http://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]		* [http://www.vcclab.org/lab/alogps E-BABEL] wechselwirkende Umwandlung der Moleküle auf dem Netz mit [http://openbabel.sourceforge.net/ OpenBabel]
	* [http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html „SMARTS – SMILES Extension“] Einführung in SMARTS		* [http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html „SMARTS – SMILES Extension“] Einführung in SMARTS
	* [http://~~www.~~opensmiles.org/~~spec/open-smiles~~.html OpenSMILES Spezifikation]		* [http://opensmiles.org/opensmiles.html OpenSMILES-Spezifikation]

	== Einzelnachweise ==		== Einzelnachweise ==
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	[[Kategorie:Chemische Nomenklatur]]		[[Kategorie:Chemische Nomenklatur]]
			[[Kategorie:Computerchemie]]

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	Um die Notation zu vereinfachen, können die eckigen Klammern bei Elementen der sogenannten „organischen Teilmenge“ weggelassen werden.		Um die Notation zu vereinfachen, können die eckigen Klammern bei Elementen der sogenannten „organischen Teilmenge“ weggelassen werden.
	Wenn die Klammern weggelassen werden, dann werden die [[Wertigkeit (Chemie)\|freien Valenzen]] des Atoms auf die niedrigste Standardvalenz nach der abgebildeten Tabelle mit Wasserstoffatomen aufgefüllt.		Wenn die Klammern weggelassen werden, dann werden die [[Wertigkeit (Chemie)\|freien Valenzen]] des Atoms auf die niedrigste Standardvalenz nach der abgebildeten Tabelle mit Wasserstoffatomen aufgefüllt.
	So reicht zum Beispiel für die Eingabe von [[Wasser]] ein <code>O</code>, und für [[Methan]] ein <code>C</code>.<ref>[http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.1 SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.1]</ref>		So reicht zum Beispiel für die Eingabe von [[Wasser]] ein <code>O</code>, und für [[Methan]] ein <code>C</code>.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.1 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.1 \|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot }}</ref>

	{\| class="wikitable"		{\| class="wikitable"
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	Bindungen in [[Aromaten\|aromatischen Systemen]] können statt durch abwechselnde Doppel- und Einfachbindungen durch einen Doppelpunkt symbolisiert werden.		Bindungen in [[Aromaten\|aromatischen Systemen]] können statt durch abwechselnde Doppel- und Einfachbindungen durch einen Doppelpunkt symbolisiert werden.

	Um die Schreibweise noch weiter zu vereinfachen, dürfen die Symbole für Einfachbindungen und aromatische Bindungen weggelassen werden.<ref>[http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.2 SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.2]</ref>		Um die Schreibweise noch weiter zu vereinfachen, dürfen die Symbole für Einfachbindungen und aromatische Bindungen weggelassen werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.2 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.2 \|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot }}</ref>

	=== Verzweigungen ===		=== Verzweigungen ===

	Atome mit drei oder mehr Bindungen sind Ausgangspunkt von Verzweigungen. Dabei wird nach dem entsprechenden Atom erst die Seitenkette in runden Klammern gesetzt, bevor die weiteren Bindungen folgen. Die Klammerebenen und damit die Verzweigungen können beliebig tief verschachtelt werden.<ref>[http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.3 SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.3]</ref>		Atome mit drei oder mehr Bindungen sind Ausgangspunkt von Verzweigungen. Dabei wird nach dem entsprechenden Atom erst die Seitenkette in runden Klammern gesetzt, bevor die weiteren Bindungen folgen. Die Klammerebenen und damit die Verzweigungen können beliebig tief verschachtelt werden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.3 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.3 \|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot }}</ref>

	Beispiele:		Beispiele:
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	=== Getrennte Strukturen ===		=== Getrennte Strukturen ===

	Bei Strukturen, die nicht zusammenhängen, wie z. B. Ionenbindungen wird ein Punkt (.) zwischen die getrennten Moleküle gesetzt.<ref>[http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.7 SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.7]</ref><br />		Bei Strukturen, die nicht zusammenhängen, wie z. B. Ionenbindungen wird ein Punkt (.) zwischen die getrennten Moleküle gesetzt.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.7 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.7 \|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot }}</ref><br />
	Beispiel: Natriumhydrogencarbonat (Na<sup>+</sup>HCO<sub>3</sub><sup>−</sup>) = <code>[Na+].O=C([O-])O</code>		Beispiel: Natriumhydrogencarbonat (Na<sup>+</sup>HCO<sub>3</sub><sup>−</sup>) = <code>[Na+].O=C([O-])O</code>

	=== Cyclische Strukturen ===		=== Cyclische Strukturen ===
	Eines der größten Probleme einer solchen Sprache ist es, cyclische Strukturen darzustellen.		Eines der größten Probleme einer solchen Sprache ist es, cyclische Strukturen darzustellen.
	Bei SMILES geschieht dies dadurch, dass man nach einem Atom, das mit einem anderen Atom verbunden werden soll, welches weiter hinten steht, einen Index schreibt; dies macht man auch bei dem anderen Atom und die beiden sind verbunden.<ref>[http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.4 SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.4]</ref>		Bei SMILES geschieht dies dadurch, dass man nach einem Atom, das mit einem anderen Atom verbunden werden soll, welches weiter hinten steht, einen Index schreibt; dies macht man auch bei dem anderen Atom und die beiden sind verbunden.<ref>{{Webarchiv\|url=http://www.opensmiles.org/spec/open-smiles-3-input.html#3.4 \|wayback=20100713205713 \|text=SMILES-Spezifikation, Abschnitt 3.4 \|archiv-bot=2023-01-10 05:28:27 InternetArchiveBot }}</ref>
	Bei aromatischen Ringen werden die ringbildenden Atome kleingeschrieben.		Bei aromatischen Ringen werden die ringbildenden Atome kleingeschrieben.