Microarray - Versionsgeschichte

Allexkoch: /* Arten von Protein-Microarrays */ ln+

2024-04-26T10:52:16Z

Arten von Protein-Microarrays: ln+

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	* '''Antigen Microarrays''': Auf jeder Testfläche des Arrays wird ein anderes Antigen fixiert. Enthält das [[Blutserum\|Serum]] einer Blutprobe den dazugehörigen, spezifischen Antikörper, bleibt dieser an der Testfläche haften. Damit kann die Reaktion auf eine Vielzahl von bakteriellen Antigenen oder Allergenen gleichzeitig getestet werden. Der Erstantikörper wird in einem weiteren Inkubationsschritt von einem markierten Zweitantikörper gebunden und kann detektiert werden.		* '''Antigen Microarrays''': Auf jeder Testfläche des Arrays wird ein anderes Antigen fixiert. Enthält das [[Blutserum\|Serum]] einer Blutprobe den dazugehörigen, spezifischen Antikörper, bleibt dieser an der Testfläche haften. Damit kann die Reaktion auf eine Vielzahl von bakteriellen Antigenen oder Allergenen gleichzeitig getestet werden. Der Erstantikörper wird in einem weiteren Inkubationsschritt von einem markierten Zweitantikörper gebunden und kann detektiert werden.
	* Bei '''Proteindomänen Microarrays''' werden Fusionsproteine auf dem Array fixiert um Protein-Protein Interaktionen nachzuweisen. Das Fusionsprotein ermöglicht die zuverlässige Fixierung auf dem Array mit dem ersten Teil ohne die Interaktionsfähigkeit des anderen Proteinteils zu stören. Das aufgebrachte Protein bleibt nur an jenen Testflächen haften, an denen es zu einer Interaktion kommt.		* Bei '''Proteindomänen Microarrays''' werden Fusionsproteine auf dem Array fixiert um Protein-Protein Interaktionen nachzuweisen. Das Fusionsprotein ermöglicht die zuverlässige Fixierung auf dem Array mit dem ersten Teil ohne die Interaktionsfähigkeit des anderen Proteinteils zu stören. Das aufgebrachte Protein bleibt nur an jenen Testflächen haften, an denen es zu einer Interaktion kommt.
	* Ein '''Peptid-Microarray''' enthält kurze [[Peptid]]<nowiki/>sequenzen, die je nach Methode entweder ''[[in situ]]'' [[Peptidsynthese\|synthetisiert]] oder aber mit Hilfe eines [[Laserdrucker]]s und per [[Festphasensynthese]] direkt auf die Oberfläche aufgebracht werden<ref>{{Literatur\|Autor=Volker Stadler, Thomas Felgenhauer, Mario Beyer, Simon Fernandez, Klaus Leibe\|Titel=Combinatorial Synthesis of Peptide Arrays with a Laser Printer\|Sammelwerk=Angewandte Chemie International Edition\|Band=47\|Nummer=37\|Datum=2008-09-01\|Seiten=7132–7135\|ISSN=1521-3773\|DOI=10.1002/anie.200801616}}</ref><ref>{{Literatur\|Autor=Frank Breitling, Thomas Felgenhauer, Alexander Nesterov, Volker Lindenstruth, Volker Stadler\|Titel=Particle-Based Synthesis of Peptide Arrays\|Sammelwerk=ChemBioChem\|Band=10\|Nummer=5\|Datum=2009-03-23\|Seiten=803–808\|ISSN=1439-7633\|DOI=10.1002/cbic.200800735}}</ref>. Diese Methode hat verschiedene Vorteile, u. a. geringere Synthesekosten und eine größere Anzahl an Peptiden die parallel gedruckt werden können. Peptid-Microarrays werden u. a. eingesetzt zur Profilerstellung von [[Enzym]]en, zur Untersuchung von Antikörper-Epitopen ([[Epitopkartierung]]), oder um die Aminosäuren aufzuklären, die nötig sind für Proteinbindung. In der Praxis werden Peptid-Microarrays u. a. zur Überwachung von therapeutischen Interventionen, [[Stratifikation (Medizin)\|Stratifikation]] von Patienten, zur Profilerstellung von Immunantworten individueller Patienten bei fortschreitender Erkrankung oder auch zur Entwicklung von diagnostischen und therapeutischen Wirkstoffen und [[Impfung]]en eingesetzt.		* Ein '''Peptid-Microarray''' enthält kurze [[Peptid]]<nowiki/>sequenzen, die je nach Methode entweder ''[[in situ]]'' [[Peptidsynthese\|synthetisiert]] oder aber mit Hilfe eines [[Laserdrucker]]s und per [[Festphasensynthese]] direkt auf die Oberfläche aufgebracht werden<ref>{{Literatur\|Autor=Volker Stadler, Thomas Felgenhauer, Mario Beyer, Simon Fernandez, Klaus Leibe\|Titel=Combinatorial Synthesis of Peptide Arrays with a Laser Printer\|Sammelwerk=Angewandte Chemie International Edition\|Band=47\|Nummer=37\|Datum=2008-09-01\|Seiten=7132–7135\|ISSN=1521-3773\|DOI=10.1002/anie.200801616}}</ref><ref>{{Literatur\|Autor=Frank Breitling, Thomas Felgenhauer, Alexander Nesterov, [[Volker Lindenstruth]], Volker Stadler\|Titel=Particle-Based Synthesis of Peptide Arrays\|Sammelwerk=ChemBioChem\|Band=10\|Nummer=5\|Datum=2009-03-23\|Seiten=803–808\|ISSN=1439-7633\|DOI=10.1002/cbic.200800735}}</ref>. Diese Methode hat verschiedene Vorteile, u. a. geringere Synthesekosten und eine größere Anzahl an Peptiden die parallel gedruckt werden können. Peptid-Microarrays werden u. a. eingesetzt zur Profilerstellung von [[Enzym]]en, zur Untersuchung von Antikörper-Epitopen ([[Epitopkartierung]]), oder um die Aminosäuren aufzuklären, die nötig sind für Proteinbindung. In der Praxis werden Peptid-Microarrays u. a. zur Überwachung von therapeutischen Interventionen, [[Stratifikation (Medizin)\|Stratifikation]] von Patienten, zur Profilerstellung von Immunantworten individueller Patienten bei fortschreitender Erkrankung oder auch zur Entwicklung von diagnostischen und therapeutischen Wirkstoffen und [[Impfung]]en eingesetzt.

	Ein möglicher Vorteil gegenüber DNA-Microarrays ist die schnellere Vor-Ort-Analyse von Proben, da man auf die oft notwendige [[Amplifikation (Genetik)\|Amplifikation]] genetischen Materials sowie die [[Hybridisierung (Molekularbiologie)\|Hybridisierung]] verzichten kann. Zudem lassen Protein-Microarrays eine Hochdurchsatz-Analyse des Proteinlevels zu. Neueste Forschungsergebnisse lassen darauf schließen, dass mRNA- und Proteinmenge nicht immer miteinander korrelieren. Somit lässt sich von cDNA-Microarray-Ergebnissen nicht unbedingt auf die Proteinexpression schließen.		Ein möglicher Vorteil gegenüber DNA-Microarrays ist die schnellere Vor-Ort-Analyse von Proben, da man auf die oft notwendige [[Amplifikation (Genetik)\|Amplifikation]] genetischen Materials sowie die [[Hybridisierung (Molekularbiologie)\|Hybridisierung]] verzichten kann. Zudem lassen Protein-Microarrays eine Hochdurchsatz-Analyse des Proteinlevels zu. Neueste Forschungsergebnisse lassen darauf schließen, dass mRNA- und Proteinmenge nicht immer miteinander korrelieren. Somit lässt sich von cDNA-Microarray-Ergebnissen nicht unbedingt auf die Proteinexpression schließen.

Paragem: /* Geschichte */ Hinweis auf DNA-Tests zur Familienforschung

2023-09-05T10:41:17Z

Geschichte: Hinweis auf DNA-Tests zur Familienforschung

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	Für Protein-Microarrays beschrieb Ekins Ende der [[1980er]] Jahre, dass „Mikrospot-Assays“ von herausragender Nachweisempfindlichkeit sind. Ähnliche Ansätze wurden bereits für die Herstellung von Antikörper-Makroarrays beschrieben. Bis zum Jahr 2000 ermöglichten die Geräte-Entwicklungen für die Genom-Forschung bereits die Herstellung von Protein-Microarrays mit vielen tausend DNA-Sonden auf kleinster Fläche.		Für Protein-Microarrays beschrieb Ekins Ende der [[1980er]] Jahre, dass „Mikrospot-Assays“ von herausragender Nachweisempfindlichkeit sind. Ähnliche Ansätze wurden bereits für die Herstellung von Antikörper-Makroarrays beschrieben. Bis zum Jahr 2000 ermöglichten die Geräte-Entwicklungen für die Genom-Forschung bereits die Herstellung von Protein-Microarrays mit vielen tausend DNA-Sonden auf kleinster Fläche.

			Mit der Verbreitung von [[Genetische Genealogie\|DNA-Tests zur Familienforschung]] sind heute viele Menschen (indirekte) Nutzer von DNA-Microarrays. Im Jahr 2016 verwendete [[MyHeritage]] den OmniExpress-Chip von [[Illumina]], der 700.000 [[Einzelnukleotid-Polymorphismus\|SNPs]] detektiert.<ref>{{Cite web \|title=MyHeritage DNA: Your Questions Answered \|url=https://blog.myheritage.com/2016/11/myheritage-dna-your-questions-answered/ \|last= \|first=Esther \|language=en \|date=2016-11-09 \|accessdate=2023-09-05}}</ref>

	== Siehe auch ==		== Siehe auch ==

Aka: /* Geschichte */ Tippfehler entfernt

2023-02-08T11:59:16Z

Geschichte: Tippfehler entfernt

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	== Geschichte ==		== Geschichte ==
	Die Technologie der Microarrays ist erst in den [[1990er]] Jahren entstanden. Wegen der hohen Anzahl an Tests pro ~~Zeispanne~~, der vergleichsweise geringen Probenmenge und der guten Automatisierbarkeit hat sie sich jedoch rasch als wichtiger Bestandteil in der Forschung für die Bereiche [[Pharmazie]], [[Medizin]], [[Biochemie]], [[Biotechnologie]], [[Genetik]] und [[Molekularbiologie]] durchgesetzt.		Die Technologie der Microarrays ist erst in den [[1990er]] Jahren entstanden. Wegen der hohen Anzahl an Tests pro Zeitspanne, der vergleichsweise geringen Probenmenge und der guten Automatisierbarkeit hat sie sich jedoch rasch als wichtiger Bestandteil in der Forschung für die Bereiche [[Pharmazie]], [[Medizin]], [[Biochemie]], [[Biotechnologie]], [[Genetik]] und [[Molekularbiologie]] durchgesetzt.

	Davor wurden in diesen Forschungsfeldern für die gleiche Aufgabe auf [[Gel]]en basierende [[Elektrophorese\|elektrophoretische]] Methoden oder [[Chromatographie\|chromatographische]] Verfahren eingesetzt, die um vieles zeitaufwändiger waren. Eine Vorgängermethode ist die [[Dot Blot\|Dot-Blot]]-Analyse.		Davor wurden in diesen Forschungsfeldern für die gleiche Aufgabe auf [[Gel]]en basierende [[Elektrophorese\|elektrophoretische]] Methoden oder [[Chromatographie\|chromatographische]] Verfahren eingesetzt, die um vieles zeitaufwändiger waren. Eine Vorgängermethode ist die [[Dot Blot\|Dot-Blot]]-Analyse.

Saure: /* Geschichte */

2023-02-08T08:21:07Z

Geschichte

← Nächstältere Version		Version vom 8. Februar 2023, 10:21 Uhr
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	== Geschichte ==		== Geschichte ==
	Die Technologie der Microarrays ist erst in den [[1990er]] Jahren entstanden. Wegen der hohen Anzahl an Tests pro ~~Zeiteinheit~~, der vergleichsweise geringen Probenmenge und der guten Automatisierbarkeit hat sie sich jedoch rasch als wichtiger Bestandteil in der Forschung für die Bereiche [[Pharmazie]], [[Medizin]], [[Biochemie]], [[Biotechnologie]], [[Genetik]] und [[Molekularbiologie]] durchgesetzt.		Die Technologie der Microarrays ist erst in den [[1990er]] Jahren entstanden. Wegen der hohen Anzahl an Tests pro Zeispanne, der vergleichsweise geringen Probenmenge und der guten Automatisierbarkeit hat sie sich jedoch rasch als wichtiger Bestandteil in der Forschung für die Bereiche [[Pharmazie]], [[Medizin]], [[Biochemie]], [[Biotechnologie]], [[Genetik]] und [[Molekularbiologie]] durchgesetzt.

	Davor wurden in diesen Forschungsfeldern für die gleiche Aufgabe auf [[Gel]]en basierende [[Elektrophorese\|elektrophoretische]] Methoden oder [[Chromatographie\|chromatographische]] Verfahren eingesetzt, die um vieles zeitaufwändiger waren. Eine Vorgängermethode ist die [[Dot Blot\|Dot-Blot]]-Analyse.		Davor wurden in diesen Forschungsfeldern für die gleiche Aufgabe auf [[Gel]]en basierende [[Elektrophorese\|elektrophoretische]] Methoden oder [[Chromatographie\|chromatographische]] Verfahren eingesetzt, die um vieles zeitaufwändiger waren. Eine Vorgängermethode ist die [[Dot Blot\|Dot-Blot]]-Analyse.

RudolfSimon: /* Protein-Microarrays */ Quelle konvertiert

2022-05-31T22:52:10Z

Protein-Microarrays: Quelle konvertiert

← Nächstältere Version		Version vom 1. Juni 2022, 00:52 Uhr
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	{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}		{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}
	'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von [[Polymerase-Kettenreaktion\|PCR-Produkten]], die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.		'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von [[Polymerase-Kettenreaktion\|PCR-Produkten]], die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.
	* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail~~/article~~/33223/ ~~HaloTag-NAPPA~~ TU-~~München]~~</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>		* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>{{Internetquelle \|url=https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/33223/ \|titel=Tausende auf einem Chip: Neue Methode zur Erforschung von Proteinen \|sprache=de \|abruf=2022-05-31}}</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>

	== Protein-Microarrays ==		== Protein-Microarrays ==

2A06:6880:426:2E00:C153:1021:6E56:C906: /* Protein-Microarrays */

2021-11-26T19:13:22Z

Protein-Microarrays

← Nächstältere Version		Version vom 26. November 2021, 21:13 Uhr
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	beim Protein-Microarray in jedem Testfeld – auch Spot genannt – kleine Protein-Mengen auf dem Trägermaterial fixiert. Der ''spotten'' genannte Vorgang erfordert wegen der kleinen Testflächen mit geringem Abstand eine hohe Präzision und wird daher von speziellen Geräten durchgeführt.		beim Protein-Microarray in jedem Testfeld – auch Spot genannt – kleine Protein-Mengen auf dem Trägermaterial fixiert. Der ''spotten'' genannte Vorgang erfordert wegen der kleinen Testflächen mit geringem Abstand eine hohe Präzision und wird daher von speziellen Geräten durchgeführt.

	Auf dem Array kann nun entweder ein gereinigtes Protein, beispielsweise ein Antikörper, oder ein Proteinmix der getesteten Probe aufgebracht werden. Jene Spots, in denen keine Interaktion stattfindet, bleiben nach Durchführung eines Waschschritts leer. Die Detektionsmethode erlaubt anschließend die Unterscheidung zwischen Spots mit und ohne Protein-Protein Interaktion. Es sind auch quantitative Detektionsverfahren möglich, in denen die Menge an haftendem Protein bestimmt werden kann.		Auf dem Array kann nun entweder ein gereinigtes Protein, beispielsweise ein Antikörper, oder ein Proteinmix der getesteten Probe aufgebracht werden. Jene Spots, in denen keine Interaktion stattfindet, bleiben nach Durchführung eines Waschschritts leer. Die Detektionsmethode erlaubt anschließend die Unterscheidung zwischen Spots mit und ohne Protein-Protein-Interaktion. Es sind auch quantitative Detektionsverfahren möglich, in denen die Menge an haftendem Protein bestimmt werden kann.

	=== Arten von Protein-Microarrays ===		=== Arten von Protein-Microarrays ===

JamesP: fix typo

2021-04-14T20:24:23Z

fix typo

← Nächstältere Version		Version vom 14. April 2021, 22:24 Uhr
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	* '''Antigen Microarrays''': Auf jeder Testfläche des Arrays wird ein anderes Antigen fixiert. Enthält das [[Blutserum\|Serum]] einer Blutprobe den dazugehörigen, spezifischen Antikörper, bleibt dieser an der Testfläche haften. Damit kann die Reaktion auf eine Vielzahl von bakteriellen Antigenen oder Allergenen gleichzeitig getestet werden. Der Erstantikörper wird in einem weiteren Inkubationsschritt von einem markierten Zweitantikörper gebunden und kann detektiert werden.		* '''Antigen Microarrays''': Auf jeder Testfläche des Arrays wird ein anderes Antigen fixiert. Enthält das [[Blutserum\|Serum]] einer Blutprobe den dazugehörigen, spezifischen Antikörper, bleibt dieser an der Testfläche haften. Damit kann die Reaktion auf eine Vielzahl von bakteriellen Antigenen oder Allergenen gleichzeitig getestet werden. Der Erstantikörper wird in einem weiteren Inkubationsschritt von einem markierten Zweitantikörper gebunden und kann detektiert werden.
	* Bei '''Proteindomänen Microarrays''' werden Fusionsproteine auf dem Array fixiert um Protein-Protein Interaktionen nachzuweisen. Das Fusionsprotein ermöglicht die zuverlässige Fixierung auf dem Array mit dem ersten Teil ohne die Interaktionsfähigkeit des anderen Proteinteils zu stören. Das aufgebrachte Protein bleibt nur an jenen Testflächen haften, an denen es zu einer Interaktion kommt.		* Bei '''Proteindomänen Microarrays''' werden Fusionsproteine auf dem Array fixiert um Protein-Protein Interaktionen nachzuweisen. Das Fusionsprotein ermöglicht die zuverlässige Fixierung auf dem Array mit dem ersten Teil ohne die Interaktionsfähigkeit des anderen Proteinteils zu stören. Das aufgebrachte Protein bleibt nur an jenen Testflächen haften, an denen es zu einer Interaktion kommt.
	* Ein '''Peptid-Microarray''' enthält kurze [[Peptid]]<nowiki/>sequenzen, die je nach Methode entweder ''[[in situ]]'' [[Peptidsynthese\|synthetisiert]] oder aber mit Hilfe eines [[Laserdrucker]]s und per [[Festphasensynthese]] direkt auf die Oberfläche aufgebracht werden<ref>{{Literatur\|Autor=Volker Stadler, Thomas Felgenhauer, Mario Beyer, Simon Fernandez, Klaus Leibe\|Titel=Combinatorial Synthesis of Peptide Arrays with a Laser Printer\|Sammelwerk=Angewandte Chemie International Edition\|Band=47\|Nummer=37\|Datum=2008-09-01\|Seiten=7132–7135\|ISSN=1521-3773\|DOI=10.1002/anie.200801616}}</ref><ref>{{Literatur\|Autor=Frank Breitling, Thomas Felgenhauer, Alexander Nesterov, Volker Lindenstruth, Volker Stadler\|Titel=Particle-Based Synthesis of Peptide Arrays\|Sammelwerk=ChemBioChem\|Band=10\|Nummer=5\|Datum=2009-03-23\|Seiten=803–808\|ISSN=1439-7633\|DOI=10.1002/cbic.200800735}}</ref>. Diese Methode hat verschiedene Vorteile, u. a. geringere Synthesekosten und ~~ein~~ größere Anzahl an Peptiden die parallel gedruckt werden können. Peptid-Microarrays werden u. a. eingesetzt zur Profilerstellung von [[Enzym]]en, zur Untersuchung von Antikörper-Epitopen ([[Epitopkartierung]]), oder um die Aminosäuren aufzuklären, die nötig sind für Proteinbindung. In der Praxis werden Peptid-Microarrays u. a. zur Überwachung von therapeutischen Interventionen, [[Stratifikation (Medizin)\|Stratifikation]] von Patienten, zur Profilerstellung von Immunantworten individueller Patienten bei fortschreitender Erkrankung oder auch zur Entwicklung von diagnostischen und therapeutischen Wirkstoffen und [[Impfung]]en eingesetzt.		* Ein '''Peptid-Microarray''' enthält kurze [[Peptid]]<nowiki/>sequenzen, die je nach Methode entweder ''[[in situ]]'' [[Peptidsynthese\|synthetisiert]] oder aber mit Hilfe eines [[Laserdrucker]]s und per [[Festphasensynthese]] direkt auf die Oberfläche aufgebracht werden<ref>{{Literatur\|Autor=Volker Stadler, Thomas Felgenhauer, Mario Beyer, Simon Fernandez, Klaus Leibe\|Titel=Combinatorial Synthesis of Peptide Arrays with a Laser Printer\|Sammelwerk=Angewandte Chemie International Edition\|Band=47\|Nummer=37\|Datum=2008-09-01\|Seiten=7132–7135\|ISSN=1521-3773\|DOI=10.1002/anie.200801616}}</ref><ref>{{Literatur\|Autor=Frank Breitling, Thomas Felgenhauer, Alexander Nesterov, Volker Lindenstruth, Volker Stadler\|Titel=Particle-Based Synthesis of Peptide Arrays\|Sammelwerk=ChemBioChem\|Band=10\|Nummer=5\|Datum=2009-03-23\|Seiten=803–808\|ISSN=1439-7633\|DOI=10.1002/cbic.200800735}}</ref>. Diese Methode hat verschiedene Vorteile, u. a. geringere Synthesekosten und eine größere Anzahl an Peptiden die parallel gedruckt werden können. Peptid-Microarrays werden u. a. eingesetzt zur Profilerstellung von [[Enzym]]en, zur Untersuchung von Antikörper-Epitopen ([[Epitopkartierung]]), oder um die Aminosäuren aufzuklären, die nötig sind für Proteinbindung. In der Praxis werden Peptid-Microarrays u. a. zur Überwachung von therapeutischen Interventionen, [[Stratifikation (Medizin)\|Stratifikation]] von Patienten, zur Profilerstellung von Immunantworten individueller Patienten bei fortschreitender Erkrankung oder auch zur Entwicklung von diagnostischen und therapeutischen Wirkstoffen und [[Impfung]]en eingesetzt.

	Ein möglicher Vorteil gegenüber DNA-Microarrays ist die schnellere Vor-Ort-Analyse von Proben, da man auf die oft notwendige [[Amplifikation (Genetik)\|Amplifikation]] genetischen Materials sowie die [[Hybridisierung (Molekularbiologie)\|Hybridisierung]] verzichten kann. Zudem lassen Protein-Microarrays eine Hochdurchsatz-Analyse des Proteinlevels zu. Neueste Forschungsergebnisse lassen darauf schließen, dass mRNA- und Proteinmenge nicht immer miteinander korrelieren. Somit lässt sich von cDNA-Microarray-Ergebnissen nicht unbedingt auf die Proteinexpression schließen.		Ein möglicher Vorteil gegenüber DNA-Microarrays ist die schnellere Vor-Ort-Analyse von Proben, da man auf die oft notwendige [[Amplifikation (Genetik)\|Amplifikation]] genetischen Materials sowie die [[Hybridisierung (Molekularbiologie)\|Hybridisierung]] verzichten kann. Zudem lassen Protein-Microarrays eine Hochdurchsatz-Analyse des Proteinlevels zu. Neueste Forschungsergebnisse lassen darauf schließen, dass mRNA- und Proteinmenge nicht immer miteinander korrelieren. Somit lässt sich von cDNA-Microarray-Ergebnissen nicht unbedingt auf die Proteinexpression schließen.

Mariuscg: Verlinkung PCR

2019-07-28T19:08:52Z

Verlinkung PCR

← Nächstältere Version		Version vom 28. Juli 2019, 21:08 Uhr
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	[[Datei:Microarray printing.ogv\|mini\|200px\|Ein DNA-Microarray wird von einem Roboter gedruckt.]]		[[Datei:Microarray printing.ogv\|mini\|200px\|Ein DNA-Microarray wird von einem Roboter gedruckt.]]
	{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}		{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}
	'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.		'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von [[Polymerase-Kettenreaktion\|PCR-Produkten]], die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.
	* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>		* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>

Mariuscg am 27. Juli 2019 um 10:37 Uhr

2019-07-27T10:37:47Z

← Nächstältere Version		Version vom 27. Juli 2019, 12:37 Uhr
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	[[Datei:Microarray printing.ogv\|mini\|200px\|Ein DNA-Microarray wird von einem Roboter gedruckt.]]		[[Datei:Microarray printing.ogv\|mini\|200px\|Ein DNA-Microarray wird von einem Roboter gedruckt.]]
	{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}		{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}
	'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[~~cnRNA~~]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.		'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.
	* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>		* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>

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	{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}		{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}
	'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.		'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[cnRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.
	* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>		* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>

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	{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}		{{Hauptartikel\|DNA-Chip-Technologie}}
	'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von PCR-Produkten, die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.		'''DNA-Microarrays''' finden Anwendung in der [[Genomanalyse]], der [[Diagnostik]] und bei Untersuchungen in der differenziellen [[Genexpression]]. DNA-Microarrays dienen dazu, die [[mRNA]]- und [[ncRNA]]-Menge bestimmter Gene oder [[rRNA]] bestimmter Organismen nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche, bei denen [[cDNA]], Oligonukleotide oder Fragmente von [[Polymerase-Kettenreaktion\|PCR-Produkten]], die der mRNA und ncRNA entsprechen, auf das Trägermaterial gedruckt werden („Spotted Microarrays“) und solche, die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen („Oligonukleotid-Microarrays“). Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden.
	* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>		* Das '''NAPPA''', englisch für ''nucleic acid programmable protein array'', dient zur schnellen Herstellung von Proteinen. Hierfür wird [[Desoxyribonukleinsäure\|DNA]] in hoher Dichte auf Arrays gedruckt und anschließend in einen Reaktionspuffer getaucht. Entstandene Proteine werden dann durch Anker, sogenannte Halo-Tag [[Ligand (Biochemie)\|Liganden]], eingefangen. Dieses Verfahren wird als HaloTag-NAPPA bezeichnet.<ref>[https://www.tum.de/die-tum/aktuelles/pressemitteilungen/detail/article/33223/ HaloTag-NAPPA TU-München]</ref> Entwickelt wurde es vom ''Lehrstuhl für [[Systembiologie]] der Pflanzen'' der [[Technische Universität München\|TUM]] zusammen mit Wissenschaftlern aus den USA und Japan, publiziert im Juni 2016.<ref>[http://www.pnas.org/content/early/2016/06/28/1603229113.short?rss=1 HaloTag-NAPPA Publikation]</ref>