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Unique Ingredient Identifier

2018-07-19T18:30:25Z

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{{Refimprove|date=September 2010}}
The '''Unique Ingredient Identifier''' ('''UNII''') is a non-proprietary, free, unique, unambiguous, non-semantic, alphanumeric identifier linked to a substance's molecular structure or descriptive information by the Substance Registration System (SRS) of the [[Food and Drug Administration]] (FDA) and the United States Pharmacopeia (USP).

The SRS is used to generate permanent, unique identifiers for substances in regulated products, such as ingredients in drug and biologic products. The SRS uses molecular structure and descriptive information to define a substance and generate the UNII. The primary means for defining a substance is by its molecular structure as represented on a two-dimensional plane. When a molecular structure is not available (e.g., botanicals), the UNII is defined by descriptive information.<ref>{{cite web|url=http://www.fda.gov/ForIndustry/DataStandards/SubstanceRegistrationSystem-UniqueIngredientIdentifierUNII/ucm127839.htm|title=Substance Registration System – UNII Presentation|work=fda.gov}}</ref>

The procedures and management of the SRS is provided by the SRS Board which includes experts from both FDA and the [[United States Pharmacopoeia]] (USP).<ref>{{cite web|url=http://www.fda.gov/ForIndustry/DataStandards/SubstanceRegistrationSystem-UniqueIngredientIdentifierUNII/default.htm|title=Substance Registration System - Unique Ingredient Identifier (UNII)|work=fda.gov}}</ref>

==Examples==
{| class="wikitable"
|-
! Preferred Term !! UNII
|-
| [[Methadone hydrochloride]] || 229809935B
|-
| [[Methadone]] || UC6VBE7V1Z
|-
| [[Water]] || 059QF0KO0R
|}

==References==
{{Reflist}}

==External links==

{{Wikidata property|P652}}

* [http://www.fda.gov/ForIndustry/DataStandards/SubstanceRegistrationSystem-UniqueIngredientIdentifierUNII/default.htm Substance Registration System - Unique Ingredient Identifier (UNII)]

[[Category:Pharmacological classification systems]]

{{pharma-stub}}

Endoneurium

2014-12-10T17:35:28Z

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{{Infobox anatomy
| Name = Endoneurium
| Latin =
| GraySubject = 183
| GrayPage = 728
| Image = Gray636.png
| Caption = Transverse section of human [[tibial nerve]].
| Image2 = Illu nerve structure.jpg
| Caption2 = Nerve structure
| System =
| MeshName = Endoneurium
| MeshNumber = A08.800.800
| DorlandsPre = e_09
| DorlandsSuf = 12332510
}}
The '''endoneurium''' (also called '''endoneurial channel''', '''endoneurial sheath''', '''endoneurial tube''', or '''Henle's sheath''') is a layer of delicate [[connective tissue]] around the [[myelin sheath]] of each myelinated [[nerve fiber]]. Its component cells are called '''endoneurial cells'''.<ref name="Marieb" >{{cite book | author = Elaine N. Marieb and Katja Hoehn | title = Human Anatomy & Physiology (7th Ed.) | publisher = Pearson | pages = 498–9 | year = 2007 | isbn = 0-8053-5909-5}}</ref> The endoneuria with their enclosed nerve fibers are bundled into groups called [[nerve fascicle]]s, each fascicle within its own protective sheath called a [[perineurium]]. In sufficiently large nerves multiple fascicles, each with its [[blood]] supply and fatty tissue, may be bundled within yet another sheath, the [[epineurium]].

The endoneurium contains a liquid known as [[Nerve#Anatomy|endoneurial fluid]], which contains little [[protein]]. In the [[peripheral nervous system]] the endoneurial fluid is notionally equivalent to [[cerebro-spinal fluid]] in the [[central nervous system]]. Peripheral nerve injuries commonly release increased amounts of endoneurial fluid into surrounding tissues; these can be detected by [[magnetic resonance neurography]], thereby assisting in locating injuries to peripheral nerves.

The endoneurium runs longitudinally along the nerve fiber, but with discontinuities where [[Septum|septa]] pass inward from the innermost layer of the perineurium. It contains fine bundles of [[fibrous connective tissue]], primarily [[collagen]], embedded in a matrix of ground substance. This structure serves to support [[capillary]] [[blood vessel]]s, arranged so as to form a network of elongated meshes. Similar structures occur around some nervous components elsewhere in the body, for example around the [[Schwann cell]]s on the peripheral side of the transitional zone on the [[auditory nerve]].<ref>{{cite journal |author=Fraher JP |title=The transitional zone and CNS regeneration |journal=J. Anat. |volume=196 |issue= 1|pages=137–58 |year=2000 |pmid=10697296 |doi=}}</ref>

==See also==
* [[Connective tissue in the peripheral nervous system]]
* [[Epineurium]]
* [[Nerve fascicle]]
* [[Nerve fiber]]
* [[Perineurium]]

==References==
{{reflist|1}}
==External links==
* {{eMedicineDictionary|Endoneurium}}
* {{BUHistology|21301loa}} - "Ultrastructure of the Cell: myelinated axon and Schwann cell"
* {{BUHistology|21401loa}} - "Ultrastructure of the Cell: arteriole and peripheral nerve"
* {{OklahomaHistology|1_03}}
* [http://neuromedia.neurobio.ucla.edu/campbell/nervous/wp_images/182%20endoneurium%20LP.jpg Histology] at [[University of California, Los Angeles]]
* [http://www.med.howard.edu/anatomy/gas/wk2/images/image2.gif Diagram] at [[Howard University]]

{{Nervous tissue}}

[[Category:Soft tissue]]
[[Category:Nervous system]]
[[Category:Neuroanatomy]]

{{neuroscience-stub}}

Anatomography

2012-11-25T13:16:13Z

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{{Infobox website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
| commercial = No
| type =
| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
[[File:Introduction to BodyParts3D Anatomography.webm|thumb|Clip explains the function overview of Anatomography server.]]
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is a common given name for males in Japanese, as [[John (given name)|John]] is in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

The construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in the [[Wavefront .obj file|OBJ]] file format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) and 521 MB (high quality) as of version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Images generated by Anatomography and the polygon data included in BodyParts3D are licensed under the [[Creative Commons license]]<ref name="CREDIT"/>, in hope of widening usage and democratizing medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], as lecture material in universities, and elsewhere to share knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Technical features==
BodyParts3D/Anatomography project uses the [[Foundational Model of Anatomy]] (FMA). The FMA is an open-source anatomical [[Ontology_(information_science)|ontology]] developed and maintained by the Structural Informatics Group at the [[University of Washington]]. In BodyParts3D, each body-part is managed by an FMA identifier (FMAID) defined by the FMA. For example, the [[vertebral column]] is registered as ''[http://lifesciencedb.jp/bp3d/ag_annotation.cgi?i=FMA13478&lng=en&t=Conventional&position=rotate FMA13478]'', the [[temporal lobe]] is registered as ''[http://lifesciencedb.jp/bp3d/ag_annotation.cgi?i=FMA61825&lng=en&t=Conventional&position=rotate FMA61825]'', and so on.

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> Total number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) Total number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
A few tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]],<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> see [[#External links|external links]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data, included in BodyParts3D data, using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at University of Tokyo conference.<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/okubo Okubo's presentation in Japanese], just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire videos of each lecture are available on the [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program conference website's program schedule page (partly Japanese, partly English)].</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-11-09T19:20:26Z

Was a bee: adding 2 examples of FMAID in Anatomography

{{Infobox website
| name = Anatomography
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| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
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| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[Wavefront .obj file|OBJ]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Both images generated by Anatomography and polygon data BodyParts3D are licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Technical features==
BodyParts3D/Anatomography project uses [[Foundational Model of Anatomy]] (FMA). FMA is an open source [[anatomical ontology]] developed and maintained by the Structural Informatics Group at the [[University of Washington]]. In BodyParts3D, each body-parts are managed by FMA identifier (FMAID) defined by FMA. For exapmle, [[vertebral column]] is registered as ''[http://lifesciencedb.jp/bp3d/ag_annotation.cgi?i=FMA13478&lng=en&t=Conventional&position=rotate FMA13478]'', [[temporal lobe]] is registered as ''[http://lifesciencedb.jp/bp3d/ag_annotation.cgi?i=FMA61825&lng=en&t=Conventional&position=rotate FMA61825]'' and so on.

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data which are included in downloaded BodyParts3D data, using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-11-02T19:30:21Z

Was a bee: using Foundational Model of Anatomy

{{Infobox website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
| commercial = No
| type =
| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[Wavefront .obj file|OBJ]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Both images generated by Anatomography and polygon data BodyParts3D are licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Technical features==
BodyParts3D/Anatomography project uses [[Foundational Model of Anatomy]] (FMA). FMA is an open source [[anatomical ontology]] developed and maintained by the Structural Informatics Group at the [[University of Washington]]. In BodyParts3D, each body-parts are managed by FMA identifier (FMAID) defined by FMA.

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data which are included in downloaded BodyParts3D data, using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-11-02T16:27:22Z

Was a bee: /* Additional images */

{{Infobox website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
| commercial = No
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| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[Wavefront .obj file|OBJ]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Both images generated by Anatomography and polygon data BodyParts3D are licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data which are included in downloaded BodyParts3D data, using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-11-02T16:13:51Z

Was a bee: some years ago, file format was stl & vtk. But currently file format is OBJ,

{{Infobox website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
| commercial = No
| type =
| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[Wavefront .obj file|OBJ]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Both images generated by Anatomography and polygon data BodyParts3D are licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data in BodyParts3D using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-11-02T15:57:47Z

Was a bee: /* Additional images */ adding one image.

{{Infobox website
| name = Anatomography
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:Cervical vertebrae from BodyParts3D on MeshLab.png| Painting colors on [[cervical vertebrae]] polygon data in BodyParts3D using [[MeshLab]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-27T10:11:59Z

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{{Infobox Website
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used on the website (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI image set which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is a 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] dataset of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. The entire data file's size is 127 [[Megabyte|MB]] (polygon reduced) or 521 MB (high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 as of version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
The BodyParts3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from [[Fiscal year|FY]]2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> As of FY2011, the project has been funded by the JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] - Free web service provided by the [[Zygote Media Group]] located in American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used on the website is a commercial product. As of October, 2012, the price of its full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] - Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published in 2011. BioDigital Systems is a [[university spin-off]] from [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]
* [http://rgm2.lab.nig.ac.jp/wiki/index.php/BodyParts3D%E9%96%8B%E7%99%BA Developer's wiki site (partly Japanese, partly English)]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T07:05:50Z

Was a bee: /* Similar services */

{{Infobox Website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
| commercial = No
| type =
| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] Free web service provided by [[Zygote Media Group]] located at American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used in the site is commercial product. At 2012, the price of full-body polygon data is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published on 2011. BioDigital Systems is one of the [[university spin-off]] by [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T07:02:43Z

Was a bee:

{{Infobox Website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
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| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
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| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
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| current status = Active
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] Free web service provided by [[Zygote Media Group]] located at American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as '''Google Body''' on December 15, 2010. The polygon data used in Zygote Body is commercial product. The price of full-body polygon data of human male is $13,995.<ref>[http://www.3dscience.com/3D_Models/Human_Anatomy/Collections/Male_Collection.php Male Anatomy Collection 5.0] 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Retrieved 2012-10-19.</ref>
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published on 2011. BioDigital Systems is one of the [[university spin-off]] by [[New York University]].<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T06:53:09Z

Was a bee: -{{Orphan}} tag. i made 2 links to this article at related article

{{Infobox Website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
| caption =
| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
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| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
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| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] Free service provided by [[Zygote Media Group]] located at American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as Google Body on December 15, 2010.
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published on 2011. BioDigital Systems is one of the [[university spin-off]] by [[New York University]]<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>.

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T06:35:00Z

Was a bee: /* Similar services */

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
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| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
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| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] Free service provided by [[Zygote Media Group]] located at American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as Google Body on December 15, 2010.
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published on 2011. BioDigital Systems is one of the [[university spin-off]] by [[New York University]]<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>.

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T06:20:53Z

Was a bee: add Similar services: Zygote Body, BioDigital Human

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
| alexa =
| logo = [[File:BodyParts3D Anatomography.png|250px|Anatomography logo.]][[File:Screenshot Anatomography en.png||250px|Anatomography screenshot]]
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| url = [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en lifesciencedb.jp/bp3d]
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| language = English or [[Japanese language|Japanese]]
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Similar services==
* [[Zygote Body]] Commercial service provided by [[Zygote Media Group]] located at American Fork, Utah, US. Zygote Body was launched as Google Body on December 15, 2010.
* [http://www.biodigital.com/biodigital-human.html BioDigital Human] Commercial service provided by BioDigital Systems. BioDigital Human was published on 2011. BioDigital Systems is one of the [[university spin-off]] by [[New York University]]<ref>[http://www.nyu.edu/about/university-initiatives/entrepreneurship/nyu-ventures/success-stories/biodigital.html Success Stories: BioDigital Systems] New York University. Retrieved 2012-10-19.</ref>.

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-19T05:37:04Z

Was a bee: funding info. initially MEXT, since 2011 by JST

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Funding==
BodyPatrs3D/Anatomography project was funded by MEXT (Japanese [[Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology]]) from FY2007 to FY2010.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/desc.html BodyParts3D Database Description] Life Science Database Archive. Retrieved 2012-10-19.</ref><ref name="DBCLS_FAQ">[http://dbcls.rois.ac.jp/en/faq FAQ - About the Database Center for Life Science (DBCLS)] DBCLS. Retrieved 2012-10-19.</ref> Since FY2011 the project is funded by JST ([[Japan Science and Technology Agency]]).<ref name="DBCLS_FAQ"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Similar services==

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-17T03:37:25Z

Was a bee: added Category:Medical databases using HotCat

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
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'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Human anatomy]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Medical databases]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Japanese websites]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-17T03:14:36Z

Was a bee: /* Others */

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
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| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref> See [[#External links|External links section]].

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-17T03:08:39Z

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{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
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| current status = Active
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">{{Cite journal|pmid=18835852|pmc=2686534|year=2009|last1=Mitsuhashi|first1=N|last2=Fujieda|first2=K|last3=Tamura|first3=T|last4=Kawamoto|first4=S|last5=Takagi|first5=T|last6=Okubo|first6=K|title=BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts|volume=37|issue=Database issue|pages=D782–5|doi=10.1093/nar/gkn613|journal=Nucleic acids research}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO". [[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English. TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>{{Cite journal|pmid=14971769|year=2004|last1=Nagaoka|first1=T|last2=Watanabe|first2=S|last3=Sakurai|first3=K|last4=Kunieda|first4=E|last5=Watanabe|first5=S|last6=Taki|first6=M|last7=Yamanaka|first7=Y|title=Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry|volume=49|issue=1|pages=1–15|journal=Physics in medicine and biology}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010)<ref>[http://dbcls.rois.ac.jp/en/archives/163 "BodyParts3D/Anatomography" Updates] Posted on April 28, 2010. DBCLS. Retrieved 2012-10-16.</ref> The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>{{Cite journal|pmid=21803786|pmc=3294242|year=2012|last1=Kawano|first1=S|last2=Ono|first2=H|last3=Takagi|first3=T|last4=Bono|first4=H|title=Tutorial videos of bioinformatics resources: Online distribution trial in Japan named TogoTV|volume=13|issue=2|pages=258–68|doi=10.1093/bib/bbr039|journal=Briefings in bioinformatics}}{{Open access}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
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File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=NmQPsJOWj4E|title=Introduction to BodyParts3D / Anatomography}}
* {{YouTube|id=GXjXzYu4IMQ|title=How to use BodyParts3D / Anatomography 2010}}
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-15T03:15:44Z

Was a bee: Version history

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
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'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2686534/?tool=pubmed BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts]" ''Nucleic Acids Research'', 2009, '''Vol. 37''', Database issue D782-D785 {{PMID|18835852}} {{PMC|2686534}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO".<ref>[[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English.</ref> TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>Nagaoka T, Watanabe S, Sakurai K, Kunieda E, Watanabe S, Taki M, Yamanaka Y. "Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry." ''Phys Med Biol''. 2004 Jan 7;49(1):1-15. {{PMID|14971769}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1,523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Version history==
* Version 1.0 (Feb. 9, 2009) <ref name="LAUNCH"/>
* Version 2.0 (Apr. 28, 2010) The number of body parts is 1,324.<ref>[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/20100816/release_2.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 2.0, 2010/4/28)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Version 3.0 (Jun. 20, 2011) The number of body parts is 1,523.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>Kawano S, Ono H, Takagi T, Bono H. "Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV." ''Brief Bioinform''. 2012 Mar;13(2):258-68. {{PMID|21803786}} {{PMC|3294242}}{{Open access}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=HlntzmKPZhU|title=How to use BodyParts3D/Anatomography{{ja icon}}}} - Lecture by Kaori Fujieda, developer of Anatomography.
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-15T02:48:08Z

Was a bee: /* Description */

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
| name = Anatomography
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| language = English or Japanese
| registration =
| owner = Database Center for Life Science
| author = Kousaku Okubo
| launch date = 2009-02-09<ref name="LAUNCH"/>
| content_license = [[File:CC-BY-SA icon.svg]] CC-BY-SA 2.1-ja<ref name="CREDIT">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/faq/credit.html FAQs - credit.] (in Japanese) DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref>
| current status = Active
| slogan =
| revenue =
}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2686534/?tool=pubmed BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts]" ''Nucleic Acids Research'', 2009, '''Vol. 37''', Database issue D782-D785 {{PMID|18835852}} {{PMC|2686534}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO".<ref>[[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English.</ref> TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>Nagaoka T, Watanabe S, Sakurai K, Kunieda E, Watanabe S, Taki M, Yamanaka Y. "Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry." ''Phys Med Biol''. 2004 Jan 7;49(1):1-15. {{PMID|14971769}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks,<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> atlases and mock-up models by medical illustrators.
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>Kawano S, Ono H, Takagi T, Bono H. "Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV." ''Brief Bioinform''. 2012 Mar;13(2):258-68. {{PMID|21803786}} {{PMC|3294242}}{{Open access}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=HlntzmKPZhU|title=How to use BodyParts3D/Anatomography{{ja icon}}}} - Lecture by Kaori Fujieda, developer of Anatomography.
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-15T02:30:44Z

Was a bee: Construction process of BodyParts3D

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
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| current status = Active
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2686534/?tool=pubmed BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts]" ''Nucleic Acids Research'', 2009, '''Vol. 37''', Database issue D782-D785 {{PMID|18835852}} {{PMC|2686534}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on is "TARO".<ref>[[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males in Japanese, like [[John (given name)|John]] in English.</ref> TARO is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>Nagaoka T, Watanabe S, Sakurai K, Kunieda E, Watanabe S, Taki M, Yamanaka Y. "Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry." ''Phys Med Biol''. 2004 Jan 7;49(1):1-15. {{PMID|14971769}}</ref> TARO was published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

Construction process of BodyParts3D is as follows.<ref name="PMID18835852"/>
* Phase 1: Additional anatomical segmentations were introduced in the original TARO data.
* Phase 2: Then, missing details were supplemented and blurred contours were clarified using a 3D editing program by referring to textbooks, atlases and mock-up models by medical illustrators.<ref name="RELEASE3.0">[ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/bodyparts3d/LATEST/release_3.0_e.html BodyParts3D Release Note (Release 3.0, 2011/6/20)] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>
* Phase 3: Further segmentation and data modification will continue in collaboration with clinical researchers until sufficient concept coverage is achieved.

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref> The number of body parts (organs) registered in BodyParts3D is 1523 at version 3.0.<ref name="RELEASE3.0"/>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>Kawano S, Ono H, Takagi T, Bono H. "Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV." ''Brief Bioinform''. 2012 Mar;13(2):258-68. {{PMID|21803786}} {{PMC|3294242}}{{Open access}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyeballs.
File:Frontal lobe animation.gif|Brain and [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Human anatomy]]
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]
* [[Democratization of knowledge]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=HlntzmKPZhU|title=How to use BodyParts3D/Anatomography{{ja icon}}}} - Lecture by Kaori Fujieda, developer of Anatomography.
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-15T01:20:45Z

Was a bee:

{{Orphan|date=October 2012}}

{{Infobox Website
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}}
'''Anatomography''' is an interactive website which supports generating anatomical diagrams and animations of the [[human body]]. The Anatomography website is maintained by the DBCLS (Database Center for Life Science) non-profit research institute located at the [[University of Tokyo]]. Anatomical diagrams generated by Anatomography, and 3D polygon data used in the site (called BodyParts3D), is freely available under the [[Creative Commons license|Creative Commons Attribution-ShareAlike license]].<ref name="CREDIT"/>

==Description==
Anatomography was launched on Feb. 9, 2009<ref name="LAUNCH">[http://lifesciencedb.jp/bp3d/info/userGuide/releaseNotes/index.html Release notes] (in Japanese). DBCLS. Retrieved 2012-10-12.</ref> by founder and chief director Kousaku Okubo ([[:ja:大久保公策|大久保公策]]), professor of the [[DNA Data Bank of Japan]] at the [[National Institute of Genetics]].

Human body polygon data used in the site is called "'''BodyParts3D'''".<ref name="PMID18835852">Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2686534/?tool=pubmed BodyParts3D: 3D structure database for anatomical concepts]" ''Nucleic Acids Research'', 2009, '''Vol. 37''', Database issue D782-D785 {{PMID|18835852}} {{PMC|2686534}}{{Open access}}</ref> BodyParts3D polygon data is extracted from full-body [[MRI]] images. The MRI images which BodyParts3D is based on are "TARO".<ref>[[Taro (given name)|Taro]] is common given name for males Japanese, like [[John (given name)|John]] in English.</ref> "TARO" is 2mm * 2mm * 2mm [[voxel]] datasets of the human male created by the [[National Institute of Information and Communications Technology]].<ref>Nagaoka T, Watanabe S, Sakurai K, Kunieda E, Watanabe S, Taki M, Yamanaka Y. "Development of realistic high-resolution whole-body voxel models of Japanese adult males and females of average height and weight, and application of models to radio-frequency electromagnetic-field dosimetry." ''Phys Med Biol''. 2004 Jan 7;49(1):1-15. {{PMID|14971769}}</ref> TARO and HANAKO were published freely on November, 2004.<ref>[http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0411/10/news106.html 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 2004/11/10] (in Japanese). ITMedia. Retrieved 2012-10-12.</ref><ref>[http://www2.nict.go.jp/pub/whatsnew/press/h16/041110-2/041110-2.html 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10] (in Japanese). National Institute of Information and Communications Technology. Retrieved 2012-10-12.</ref>

BodyParts3D polygon data is distributed in [[STL (file format)|STL]] and [[VTK]] format. Full data size is 127MB(polygon reduced) or 521MB(high quality) in version 3.0.<ref>[http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html Download - BodyParts3D] DBCLS. Retrieved 2012-10-15.</ref>

==Reception==
Diagrams from Anatomography are used, for example, in Canadian science TV show [[:fr:Le code Chastenay|Le code Chastenay]]<ref>[http://lecodechastenay.telequebec.tv/emission.aspx?id=54 「LE CODE CHASTENAY」Emission 48], 2010-01-19 aired</ref>, Internet encyclopedia [[Wikipedia]], lecture materials at universities, [[Twitter]], and so on.<ref name="Mitsuhashi2010">三橋信孝、藤枝香、今井紫緒、武藤勇、田村卓郎、川本祥子、高木利久、大久保公策 [https://symposium.lifesciencedb.jp/godo/wp-content/themes/zenlite/documents/19.pdf 「BodyParts3DとAnatomography: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」{{ja icon}}] シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi and Kousaku Okubo "BodyParts3D and Anatomography: Materials motivating sharing information in medicine" Poster presentation at "Symposium: Toward the Future of Life Science - Thinking Databases of 10 Years Later" held in the University of Tokyo at 2010-10-05. Retrieved 2012-10-12.</ref> About usage of Anatomography on websites like Wikipedia and Wikimedia Commons, developers say "spreading of usages by anonymous users on like Wikipedia and Wikimedia Commons is what we had expected."<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==License==
Anatomography is licensed under the [[Creative Commons license]].<ref name="CREDIT"/> The reason for this is to widen usage and democratize medical knowledge.<ref name="Mitsuhashi2010"/>

==Others==
Some tutorial videos on using Anatomography are available on [[YouTube]].<ref>Kawano S, Ono H, Takagi T, Bono H. "Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV." ''Brief Bioinform''. 2012 Mar;13(2):258-68. {{PMID|21803786}} {{PMC|3294242}}{{Open access}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:BodyParts3D ver.2.0.jpg|Bones and muscles.
File:Anatomography rib cage and heart.png|[[Heart]] and its [[blood vessel]]s.
File:Anatomography skull and eyeball.png|[[Skull]] and eyes.
File:Frontal lobe animation.gif|Animation of [[frontal lobe]].
File:BodyParts3D Blender.png|Downloaded BodyParts3D polygon data, edited with [[Blender]].
File:Dr ohkubo.png|Chief director Kousaku Okubo at conference<ref>Conference "Balancing IP Protection and Data Sharing in Science" held at the University of Tokyo, 2009-10-05. [http://symposium.lifesciencedb.jp/IPDS/program "Conference program (partly Japanese, partly English)"]. Okubo's presentation is Japanese just before [[Lawrence Lessig]]'s lecture. Entire video of each lectures are available by clicking links.</ref>
</gallery>

==See also==
{{Commons category|Anatomography}}
* [[Open science]]
* [[Open data]]
* [[Science Commons]]

==References==
{{Reflist}}

==External links==
* [http://lifesciencedb.jp/bp3d/?lng=en Anatomography]
* [http://dbarchive.biosciencedbc.jp/en/bodyparts3d/download.html BodyParts3D polygon data]
* {{YouTube|id=HlntzmKPZhU|title=How to use BodyParts3D/Anatomography{{ja icon}}}} - Lecture by Kaori Fujieda, developer of Anatomography.
* [http://dbcls.rois.ac.jp/en/ Database Center for Life Science]

[[Category:Japanese websites]]
[[Category:Open science]]
[[Category:Open data]]
[[Category:Medical websites]]
[[Category:Anatomical simulation]]
[[Category:Human anatomy]]

[[he:Anatomography]]
[[ja:アナトモグラフィー]]

Anatomography

2012-10-15T00:38:29Z

Was a bee: +Category:Medical websites; +Category:Anatomical simulation; +Category:Human anatomy using HotCat

Anatomography

2012-10-15T00:12:32Z

Was a bee:

Anatomography

2012-10-14T23:53:26Z

Was a bee: /* Additional images */ +animation

Anatomography

2012-10-14T23:16:09Z

Was a bee: ←Created page with '{{Infobox Website | name = Anatomography | alexa = | logo = Anatomography logo.[[File:...'

Diskussion:Earth Simulator

2012-09-25T07:23:45Z

Was a bee:

Gibt es Informationen, was der Earth Simulator gekostet hat?
Dürfte ja der teuerste Rechner der letzten Jahre gewesen sein. --[[Benutzer:HenningB|HenningB]] 09:25, 21. Mär 2006 (CET) (Signatur nachgetragen von Jailbird)

:In [[:en:Earth Simulator]] steht etwas von 7.200.000.000 Yen - nach momentanem Kurs wären das 60.000.000 US-Dollar. Im dort verlinkten [http://www.time.com/time/2002/inventions/rob_earth.html TIME-Artikel] werden 350.000.000 US-Dollar genannt. Entweder ich kann nicht rechnen, oder in irgendeiner Angabe ist da ein Fehler. --[[Benutzer:Jailbird|jailbird]] 14:20, 21. Mär 2006 (CET)

Hier werden nur die Hardwaredaten runtergeleiert. Ein Rechner der so einen interessanten Namen hat, hat doch auch sicher eine Aufgabe oder wurde der nur zum angeben gebaut (mein rechner is schneller als dein rechner)? --[[Spezial:Beiträge/91.34.193.69|91.34.193.69]] 13:31, 17. Nov. 2008 (CET)

Sorry für die nicht Deutsch. I changed coordinate. Old coordinate, which is approximately correct, had pointed [[IHI]] factory, which is next to the building ES resides. You can easily confirm this from Bing map. Strange and flat shaped building is that ES settled. Google map does not have photo image of this region. danke. --[[Benutzer:Was a bee|Was a bee]] ([[Benutzer Diskussion:Was a bee|Diskussion]]) 09:23, 25. Sep. 2012 (CEST)

Earth Simulator

2012-09-25T03:33:07Z

Was a bee: Sorry for not German (fix coordinate. the position was Yokohama factory of IHI. ES locates next to this factory.)

[[Bild:Earth_simulator_ES2.jpg|thumb|Earth Simulator ES2]]
[[Bild:EarthSimulator.jpg|thumb|Erster Earth Simulator]]
Als '''Earth Simulator''' ([[Japanische Schrift|jap.]] {{lang|ja-Jpan|地球シミュレータ}}, ''Chikyū shimyurēta'', dt. „Erdsimulator“) sind zwei [[japan]]ische [[Supercomputer]] bekannt, die auf [[Vektorprozessor]]en basieren. Das erste [[Parallelrechner]]system wurde [[2002]] am ''[[Yokohama Institute for Earth Sciences]]'' (YES) von der Firma [[NEC Corporation|NEC]] in Betrieb gesetzt.

Für den Earth Simulator wurde damals ein speziell für ihn konzipiertes 3.250 m² großes Gebäude im Stadtbezirk Kanazawa der Stadt [[Yokohama]] ([[Präfektur Kanagawa]]) errichtet. Das ursprüngliche System basierte auf der [[SX-6]]-Architektur von NEC und bestand aus 640 Rechenknoten, zu denen je 8 Vektorprozessoren und 16 GB Hauptspeicher gehörten, sowie 130 Kommunikationsknoten mit je einer [[Crossbar]]-Switchmatrix und Anschlüssen an alle 640 Rechenknoten. Die Kommunikation fand über ein 12,3 Gbps schnelles Verbindungsnetz statt. Insgesamt standen 5120 CPUs, 10 TB Hauptspeicher, 700 TB Festplatten- und 1,6 PB [[Bandlaufwerk]]speicher zur Verfügung.

In der [[TOP500]]-Liste lag der Earth Simulator von Juni 2002 bis Juni 2004 mit einer Rechenleistung von 35,86 [[Floating Point Operations Per Second|Teraflops]] als schnellster Rechner der Welt auf Platz 1. In der Liste vom November 2004 wurde er jedoch von gleich zwei Rechnern (IBMs [[BlueGene]]/L sowie [[Silicon Graphics|SGI]]s [[Columbia (Supercomputer)|Columbia]]) überholt und lag zuletzt im November 2008 nur noch an 73. Stelle. Seit Juni 2011 ist er nicht mehr gelistet.

Mitte November 2008 wurde der erste Earth Simulator stillgelegt und gegen seinen Nachfolger mit dem offiziell gleichen Namen (intern ES2) ersetzt. Dieses basiert auf der [[SX-9/E]]-Architektur von NEC und besteht aus 160 Rechenknoten, zu denen je 8 Vektorprozessoren und 128 GB Hauptspeicher gehören. Die Kommunikation erfolgt nun über ein Switchnetz mit [[Fat Tree]]-Topologie das 128 GB/s übertragen kann. Insgesamt können die 1280 CPUs auf 20 TB Hauptspeicher zurückgreifen.

Die Neuauflage debütierte in der TOP500-Liste Juni 2009 mit 122,4 TFLOPS auf Platz 22 und liegt aktuell (November 2011) auf Platz 94.

== Weblinks ==
* [http://www.jamstec.go.jp/es/en/index.html Die Homepage des „Earth Simulator“] (Japanisch, Englisch)
* [http://www.hpcwire.com/features/A_Tribute_to_the_Earth_Simulator.html Artikel über den Earth Simulator] (Englisch)

[[Kategorie:Supercomputer]]
[[Kategorie:Wissenschaft und Forschung in Japan]]
[[Kategorie:Yokohama]]

{{Coordinate |NS=35/22/51/N |EW=139/37/34.8/E |type=landmark |region=JP-14}}

[[ar:محاكي الأرض]]
[[ca:Earth Simulator]]
[[en:Earth Simulator]]
[[es:Earth Simulator]]
[[fr:Earth Simulator]]
[[id:Earth Simulator]]
[[it:Earth Simulator]]
[[ja:地球シミュレータ]]
[[nl:Earth Simulator]]
[[pl:Earth Simulator]]
[[ru:Earth Simulator]]
[[sv:Earth Simulator]]
[[zh:地球模拟器]]

Gyrus praecentralis

2012-08-04T01:11:54Z

Was a bee: {{Commonscat|Precentral gyrus}} interwiki

[[Bild:Precentral gyrus animation.gif|thumb|Lage des ''Gyrus praecentralis'' (rot)]]
'''''Gyrus praecentralis''''' ist ein anatomisch-deskriptiver Begriff. So wird die auf dem [[Frontallappen]] des [[Telencephalon |Großhirns]] vor der Zentralfurche (''[[Sulcus centralis]]'') gelegene Windung (''[[Gyrus]]'') genannt. Ihre herausragende Bedeutung beim Menschen hat sie als Ort der unmittelbaren Bewegungssteuerung, der sogenannten [[Motorcortex#Primär-motorische Rinde (M1)|Primär-motorischen Rinde]]. Dem Gyrus praecentralis wird gemäß der auf histologischen Kriterien aufbauenden [[Brodmann-Areal|Brodmann-Einteilung]] die Area 4 zugeordnet. Sie wird auch als ''Area pyramidalis'' bezeichnet. Von ihr nimmt die [[Pyramidenbahn]] ihren Ausgang.

== Siehe auch ==
{{Commonscat|Precentral gyrus}}
* [[Motorcortex]]
* [[Motoneuron]]
* [[Gyrus postcentralis]]

[[Kategorie:Telencephalon]]

[[es:Circunvolución prerrolándica]]
[[fr:Gyrus précentral]]
[[ja:中心前回]]
[[ro:Girusul precentral]]
[[ru:Прецентральная извилина]]

Anatomische Lage- und Richtungsbezeichnungen

2012-07-31T08:17:02Z

Was a bee: /* Weblinks */ {{Commonscat|Anatomical terms of location}}

Die '''Lage- und Richtungsbezeichnungen''' dienen in der [[Anatomie]] zur Beschreibung der Position ''(situs),'' der Lage ''(versio)'' und des Verlaufs einzelner Strukturen. Zum Teil sind diese Bezeichnungen auch Bestandteil [[Nomenklatur (Anatomie)|anatomischer Namen]]. Während sich klassische Lagebezeichnungen wie „oben“ oder „unten“ je nach Körperposition ändern, sind die anatomischen Lagebezeichnungen absolut und damit unabhängig von der Position des Körpers.

{{Anker|apikal}}
== Generelle Lage- und Richtungsbezeichnungen ==
[[Datei:Horse Axes.JPG|miniatur|Anatomische Hauptrichtungen]]
[[Datei:Direcoes anatomicas.svg|miniatur|Detaillierte Beschreibung]]
{{Anker|intrakorporal}}
* '''intrakorporal''' (von [[Latein|lat.]] ''intra'' ‚innerhalb‘ und ''corpus'' ‚Körper‘): innerhalb des Körpers
* '''median''' (von lat. ''medius'' ‚Mitte‘): in der Mitte gelegen
* '''medial:'''{{FN|*}} zur Mitte hin gelegen
* '''paramedian:''' neben der Mitte gelegen
* '''lateral'''{{FN|*}} (lat. ''latus'' ‚Seite‘): zur Seite hin gelegen
* '''ipsilateral''' oder '''homolateral:''' auf der gleichen Seite befindlich
* '''kontralateral:''' auf der gegenüberliegenden Seite befindlich
* '''parietal''' (''paries'' ‚Wand‘): zur Wand eines Organes oder zur Leibeswand gehörig; seitlich, wandständig; zum Scheitel gehörend
* '''viszeral''' (''viscera'' ‚Eingeweide‘): die Eingeweide betreffend, zu den Eingeweiden gehörend
* '''dorsal'''{{FN|*}} (''dorsum'' ‚Rücken‘): rückenseits, am Rücken gelegen
* '''ventral'''{{FN|*}} (''venter'' ‚Bauch‘): bauchseits, am Bauch gelegen
* '''kranial''' oder '''cranial'''{{FN|*}} (''cranium'' ‚Schädel‘): zum Schädel hin (beim Menschen also oben, bei Tieren vorn)
* '''kaudal''' oder '''caudal'''{{FN|*}} (''cauda'' ‚Schwanz‘): zum Schwanze hin (beim aufrecht stehenden Menschen also unten, bei Tieren hinten)
* '''vertikal:''' jene Linie, die vom Scheitel zu der Sohle zieht und damit unabhängig von der momentanen Körperlage gilt
* '''postkranial''' oder '''postcranial:''' ‚hinter dem Schädel‘ (beim Menschen: unterhalb)
* '''terminal:''' am Ende gelegen
* '''subterminal:''' mit Abstand vor dem Ende gelegen
* '''apikal''' (von [[Latein|lat.]] ''apex'' ‚Spitze‘): an der Spitze gelegen (so werden beispielsweise die Herzspitze als ''Apex cordis,'' die Zungenspitze als ''Apex linguae'' und die Nasenspitze als ''Apex nasi'' bezeichnet)
* '''basal:''' fundamental, grund- bzw. basisbildend z. B.: ''[[Basalmembran]]''
* '''ektop:''' am falschen Ort gelegen (→ [[Ektopie]], [[Extrauteringravidität]])
{{FNZ|*|Diese Bezeichnungen können kombiniert werden, wobei die Endsilbe ([[Suffix]]) des ersten Begriffs durch „o“ ersetzt wird: z. B. ''kraniodorsal:'' kopf-rückenwärts.}}

In Bezug auf die [[Sagittalebene]] unterscheidet man die beiden Körperhälften:
* '''dexter:''' rechts
* '''sinister:''' links.

In Bezug auf das Körperzentrum verwendet man die Begriffe:
* {{anker|proximal}}'''proximal''' (''proximus'' ‚der Nächste‘): zum Körperzentrum hin gelegen oder verlaufend
* {{anker|distal}}'''distal''' (''distare'' ‚sich entfernen‘): vom Körperzentrum entfernt gelegen oder verlaufend (abweichende Bedeutung in der Zahnheilkunde, [[#Lage- und Richtungsbezeichnungen an den Zähnen|siehe unten]]).
* {{anker|profund}}'''profund''' (''profundus'' ‚tief‘): auf das Innere des Körpers zu
* {{anker|uperfizial}}'''superfizial''' (''superficialis'' ‚oberflächlich‘): auf die Oberfläche des Körpers zu.

Im Bereich des Rumpfes verwendet man in der Humananatomie häufiger die Begriffe:
* '''anterior:''' (lat. ''ante'' ‚vor‘) vorn liegend (beim Menschen identisch mit ventral)
* '''posterior:''' (lat. ''post'' ‚hinter‘) hinten liegend (beim Menschen identisch mit dorsal)
* '''inferior:''' (lat. ''infra'' ‚unter‘) unten liegend (beim Menschen identisch mit kaudal)
* '''superior:''' (lat. ''super'' ‚über‘) oben liegend (beim Menschen identisch mit kranial)
Diese Begriffe sind in der Tieranatomie ausschließlich am Kopf erlaubt.

In Bezug auf die Wirbelsäule verwendet man:
* '''prävertebral:''' vor der Wirbelsäule liegend.

In Bezug auf das [[Brustbein]] verwendet man:
* '''retrosternal:''' hinter dem Brustbein liegend.
* '''parasternal:''' seitlich des Brustbeins liegend.

== Zusätzliche Lage- und Richtungsbezeichnungen am Kopf ==
[[Datei:Rostralcaudal.svg|rahmenlos|rechts]]
Am Kopf ist die Bezeichnung ''kranial'' nicht sinnvoll, für vorn orientierte Strukturen verwendet man daher die Begriffe:
* '''rostral''' (''rostrum'' ‚[[Schnabel]]‘, ‚[[Rüssel]]‘): schnabel-, schnauzenwärts oder zur Kopfvorderseite
* '''oral''' (''os'' ‚[[Mund]]‘): mundwärts.

Für hinten liegende Strukturen verwendet man auch den Begriff:
* '''aboral:''' vom Mund weg gelegen
* '''okzipital''' (''Occiput'' ‚[[Hinterhaupt]]‘): zum Hinterkopf hin gelegen (→ [[Hinterhauptbein]]).

Statt ''lateral'' und ''medial'' verwendet man am Kopf, insbesondere am [[Auge]], auch die Begriffe:
* '''temporal''' (''tempus'' ‚[[Schläfe]]‘): schläfenwärts, also seitlich (lateral)
* '''nasal''' (''nasus'' ‚[[Nase]]‘): nasenwärts, zur in der Mitte gelegenen Nase hin (medial)

== Zusätzliche Lage- und Richtungsbezeichnungen an den Gliedmaßen ==
Während bis zur [[Handwurzel|Hand-]] bzw. [[Fußwurzel]] noch die gleichen Bezeichnungen wie am Rumpf gelten, verwendet man an der [[Hand]] bzw. am [[Fuß]]:
[[Datei:Hand Directional Axes.JPG|rahmenlos|rechts]]
* '''dorsal''' (''Dorsum manus'' ‚Handrücken‘ und ''Dorsum pedis'' ‚Fußrücken‘): zum Hand- bzw. Fußrücken hin gelegen
* '''palmar''' (''Palma manus'' ‚Handfläche‘): handflächenseitig
* '''volar:''' hohlhandseitig, identisch mit palmar
* '''plantar''' (''Planta pedis'' ‚Fußsohle‘): fußsohlenseitig
* '''axial''' (''axis'' ‚Achse‘): zu einer gedachten Gliedmaßenachse hin gelegen
* '''abaxial:''' von der gedachten Gliedmaßenachse weg gelegen
{{anker|radial|ulnar|fibular|tibial}}
Durch die mögliche [[Rotation (Medizin)|Rotation]] des [[Unterarm]]s und des [[Unterschenkel]]s sind die Bezeichnungen ''lateral'' und ''medial'' nicht eindeutig definiert. Daher spricht man normalerweise von '''radial''' (zum [[Radius (Anatomie)|Radius]] – also der Speiche hin) statt lateral bzw. von '''ulnar''' (zur [[Ulna]] – also der Elle hin) statt medial am Unterarm und in gleicher Weise von '''fibular''' (zur Fibula – also dem [[Wadenbein]] hin) und '''tibial''' (zur Tibia – also dem [[Schienbein]] hin) am Unterschenkel.

== Zusätzliche Lage- und Richtungsbezeichnungen in den Körperhöhlen ==
In den [[Körperhöhle]]n verwendet man zusätzlich die Begriffe:
* '''parietal''' (''paries'' ‚Wand‘): zur Körperwand hin gelegen. Der Begriff ist auch für im Scheitelbereich (''Os parietale'' ‚[[Scheitelbein]]‘) gelegene Strukturen anwendbar.
* '''viszeral''' (''viscera'' ‚Eingeweide‘): zu den Eingeweiden hin gelegen
* {{Anker|thorakal}} '''thorakal''' (''[[thorax]]'' ‚Brustkorb‘): am Brustkorb, für innerhalb des Brustkorbs gelegene Strukturen ''intrathoracal''
* {{Anker|abdominal|intraabdominal}} '''abdominal''' (''abdomen'' ‚Bauch‘): am Bauch, für innerhalb des Bauchs gelegene Strukturen ''intraabdominal,'' für innerhalb der [[Bauchhöhle]] im Bereich des Bauchfells liegende ''[[intraperitoneal]]'' (''[[Peritoneum]]'' ‚Bauchfell‘).

== Lage- und Richtungsbezeichnungen an den Zähnen ==

[[Datei:Lage- und Verhältnisbestimmung Zahn.jpg|250px|thumb|Bezeichnungen am Beispiel der Zähne [[Zahnschema|16 und 21]] (Oberkiefer von unten gesehen)]]
Am [[Zahn]] werden spezielle Bezeichnungen verwendet. Wegen der Krümmung des [[Zahnbogen]]s wurde hier die Lagebezeichnung '''mesial''' eingeführt, denn ''medial'' wäre an den [[Schneidezahn|Schneidezähnen]] die zur Mitte liegende Kontaktfläche zum Nachbarzahn, jedoch an den [[Molar (Zahn)|Mahlzähnen]] im Unterkiefer die linguale, im Oberkiefer die palatinale Fläche und an den [[Eckzahn|Eckzähnen]] ein Mittelding.
{{Anker|apikal}}
* '''apikal''' (von [[Latein|lat.]] ''apex'' ‚Spitze‘): zur Wurzelspitze hin {{Anker|approximal}}
* '''approximal''' (von [[Latein|lat.]] ''proximus'' ,der Nächste‘ (räumlich)), ([[Superlativ]] von ''prope''): zum Nachbarzahn hin (mesial oder distal)
* '''axial''' (von [[Latein|lat.]] ''axis'' ,Wagenachse‘, ,Achse‘): in Richtung der Zahnachse
* '''bukkal''' (von [[Latein|lat.]] ''bucca'' ,[[Wange|Backe]]‘): backenseitig, im Seitenzahnbereich identisch mit ''vestibulär''
* '''crestal''' oder '''krestal''' (von [[Latein|lat.]] ''crista'' ,Kamm‘): 1.) Richtungsbezeichnung für „vom Kieferkamm her“ 2.) im Bereich des knöchernen Alveolarrandes (Limbus alveolaris) oder an der Crista alveolaris; Arcus alveolaris
* '''distal'''{{FN|**}} (von [[Latein|lat.]] ''distare'' ,entfernt sein‘): zum Ende des Zahnbogens hin
* '''gingival''' (von [[Latein|lat.]] ''gingiva'' ,Zahnfleisch‘): zum Zahnfleisch hin, zum Zahnfleisch gehörend
* '''interradikulär''' (von [[Latein|lat.]] ''inter'' ,zwischen‘ und ''radix'' ,Wurzel‘): zwischen den Zahnwurzeln gelegen {{Anker|inzisal}}
* '''inzisal''' (von [[Latein|lat.]] ''incidere'' ,einschneiden‘, ,eingraben‘): zur Schneidekante hin
* '''koronal''' (von [[Latein|lat.]] ''corona'' ,Krone‘): zur Zahnkrone hin
* '''labial''' (von [[Latein|lat.]] ''labium'' ,[[Lippe]]‘): lippenseitig, im Frontzahnbereich identisch mit ''vestibulär''
* '''lingual''' (von [[Latein|lat.]] ''lingua'' ,[[Zunge]]‘): zungenseitig (ausschließlich an den Unterkieferzähnen anzuwenden), identisch mit ''oral''
*'''mandibulär''' (von [[Latein|lat.]] ''mandibula'' ,[[Unterkiefer]]‘): auf den Unterkiefer bezogen
* '''marginal''' (von [[Latein|lat.]] ''margo, marginis'' ,Rand‘): zum Zahnfleischrand gehörend
*'''maxillär''' (von [[Latein|lat.]] ''maxilla'' ,[[Oberkiefer]]‘): auf den Oberkiefer bezogen. Selten bezieht sich das Wort ''maxillär'' auch auf den Unterkiefer: Eine ''bimaxilläre Umstellungsosteotomie'' ist eine [[Operation (Medizin)|Operation]], bei der sowohl der Unterkiefer als auch der Oberkiefer vom restlichen Gesichtsskelett abgetrennt und in neuer Lage fixiert werden.
* '''mesial'''{{FN|**}} (von [[Altgriechisch|griech.]] ''μέσος (mésos)'' ,mittelseitig‘): zur Mitte des Zahnbogens hin
* '''okklusal''' (von [[Latein|lat.]] ''occludere'' ,verschließen‘): zur [[Okklusion (Zahnmedizin)|Okklusionsfläche]] (Kaufläche) hin
* '''palatinal''' (von [[Latein|lat.]] ''palatum'' ,[[Gaumen]]‘): gaumenseitig (ausschließlich an den Oberkieferzähnen anzuwenden), identisch mit ''oral''
* '''parapulpär''' (von [[Altgriechisch|griech.]]: ''{{Polytonisch|παρά}} (para)'' ,bei‘, ,neben‘) und (von [[latein]]: ''pulpa'' ,Fleisch‘): neben der [[Zahnpulpa]] gelegen (im Dentin)
* '''periapikal''' (von [[Altgriechisch|griech.]] ''περί peri'' ,um‘, ,herum‘ und [[Latein|lat.]] ''apex'' ,Spitze‘): um die [[Zahnwurzel|Wurzelspitze]] herum
* '''perikoronal''' (von [[Altgriechisch|griech.]] ''περί peri'' ,um‘, ,herum‘ und [[Latein|lat.]] ''corona'' ,Krone‘): um die [[Zahnkrone]] herum
* '''radikulär''' (von [[Latein|lat.]] ''radix'' ,Wurzel‘): die [[Zahnwurzel]] betreffend, von der Zahnwurzel ausgehend
* '''transdental''' (von [[Latein|lat.]] ''trans'' ,hinüber‘, ,darüber hinaus‘ und ''dens'' ,der Zahn‘): durch den Zahn hindurch, über die Wurzelspitze hinaus
* '''vestibulär''' (von [[Latein|lat.]] ''vestibulum'' ,Vorhof‘) zum [[Mundhöhle|Mundvorhof]] hin (in der Neurologie bezieht sich ''vestibulär'' auf das [[Gleichgewichtsorgan]])
* '''zervikal''' (von [[Latein|lat.]] ''cervix'' ,[[Hals]]‘): zum [[Zahnhals]] hin

{{FNZ|**| Diese Bezeichnungen können kombiniert werden, wobei die Endsilbe (Suffix) des ersten Begriffs durch „o“ ersetzt wird: z. B. ''mesiobukkal'' (vorne zur Wange hin).}}

Die einzelnen Zähne selbst werden durch das [[Zahnschema]] bezeichnet und identifiziert, wobei heute fast ausschließlich das [[Elektronische Datenverarbeitung|EDV]]-gerechte [[Zahnschema#FDI-Schema|FDI-Schema]] gebräuchlich ist.

== Verlaufsbezeichnungen ==

[[Datei:Human anatomy Koerperebenen.svg|miniatur|Die drei Körperebenen]]
* '''aszendierend''' (''ascensus'' ,Aufstieg‘): aufsteigend
* '''deszendierend''' (''descensus'' ,Abstieg‘): absteigend
* '''antegrad''' oder '''anterograd:''' zeitlich oder örtlich (regelhafte Bewegungsrichtung, z. B. Flussrichtung) nach vorn gerichtet
* '''retrograd:''' zeitlich oder örtlich zurückliegend, entgegen der normalen Fluss- oder Bewegungsrichtung
In Bezug auf die drei Körperebenen (Transversalebene, Frontalebene, Sagittalebene) werden unterschieden:
* '''transversal:''' senkrecht zur Sagittalebene (rechts-links)
* '''longitudinal:''' entlang der Körperlängsachse oder senkrecht zur Transversalebene (oben-unten)
* '''sagittal''' (''sagitta'' ,Pfeil‘): parallel zur sagittalen Achse oder senkrecht zur Frontalebene (vorne-hinten)
* '''median:''' in der [[Medianebene]]
In der [[Radiologie|Bildgebung]] des Kopfes werden Schnitte entlang der drei Körperebenen wie folgt benannt:
* '''axialer Schnitt:''' entspricht der [[Transversalebene]] (also horizontal oder so, als würde man von oben oder unten in den Kopf hinein blicken)
* '''sagittaler Schnitt:''' parallel zur [[Sagittalebene|sagittalen Ebene]] (also so, als würde man von der Seite in den Kopf hinein blicken)
* '''koronarer (cornarer) Schnitt:''' entspricht der [[Frontalebene]] (also so, als würde man von vorne in den Kopf hinein blicken; ''historisch „parallel zur [[Sutur|Sutura coronalis]]“'')

== Freie Lage- und Richtungsbezeichnungen ==
Neben diesen generellen Lagebezeichnungen ist es praktisch möglich, aus allen Körperteilen Lage- bzw. Richtungsbezeichnungen zu kreieren. Dazu wird der lateinische Wortstamm des Körperteils bzw. Organs mit der Endsilbe '''-al''' versehen:

z. B.
*'''intestinal''' (''intestinum'' ,[[Darm]]‘)
*'''zervikal''' (''cervix'' ,Hals‘)
*'''thorakal''' (''[[thorax]]'' ,Brustkorb‘)
*'''abdominal''' (''abdomen'' ,Bauch‘)
*'''sakral''' (''Os sacrum'' ,[[Kreuzbein]]‘)
*'''laryngeal''' (''Larynx'' ,[[Kehlkopf]]‘)
*'''spinal''' (''spina'' ,[[Wirbelsäule]]‘)

== Quellen ==
* W. [[Willibald Pschyrembel|Pschyrembel]]: ''Klinisches Wörterbuch.'' Walter de Gruyter Verlag, Berlin - New York.
* Walter Hoffmann-Axthelm: ''Lexikon der Zahnmedizin.'' Quintessenz-Verlag, Berlin.
* [[Joseph Maria Stowasser]]: ''[[Der Kleine Stowasser]], Lateinisch-deutsches Schulwörterbuch.'' G. Freytag Verlag, München.
* [[Wilhelm Gemoll]]: ''GEMOLL, Griechisch-deutsches Schul- und Handwörterbuch.'' G. Freytag Verlag, München.

== Weblinks ==
{{Commonscat|Anatomical terms of location}}
* [http://homepage.smc.edu/russell_richard/Psych2/Graphics/human_brain_directions.htm Visuelle Darstellung der Lage- und Richtungsbezeichnungen im Gehirn]

[[Kategorie:Anatomische Lagebezeichnung| Lage- und Richtungsbezeichnungen]]
[[Kategorie:Paläontologie]]
[[Kategorie:Liste (Medizin)]]

[[bg:Анатомични термини за местоположение]]
[[ca:Termes anatòmics de localització]]
[[cs:Orientace na lidském těle]]
[[en:Anatomical terms of location]]
[[es:Terminología anatómica de localización]]
[[et:Anatoomilised asenditähistused]]
[[fa:دید پس‌وپیش]]
[[fr:Système de référence en anatomie]]
[[hr:Anatomski izrazi za smještaj]]
[[hu:Az anatómiában használatos síkok és irányok]]
[[id:Istilah lokasi anatomi]]
[[it:Posizione anatomica]]
[[ja:解剖学における方向の表現]]
[[jv:Istilah lokasi anatomi]]
[[nl:Anatomische termen van positie]]
[[no:Anatomiske retningsbeskrivelser]]
[[pl:Pozycja anatomiczna]]
[[pt:Anexo:Lista de termos técnicos de anatomia]]
[[ru:Пространственные отношения в анатомической терминологии]]
[[sk:Anatomické postavenie]]
[[su:Istilah perenah anatomi]]
[[sv:Anatomiska termer för läge]]
[[uk:Анатомічна термінологія розташування]]
[[zh:人体解剖学方位]]

Wikipedia:Helferlein/markAdmins

2010-12-26T09:46:39Z

Was a bee: ja:Help:マークアドミン

[[Datei:Euku-monobook-screenshot.png|thumb|Das Helferlein in der Praxis]]
markAdmins basiert auf beziehungsweise benutzt direkt [[Benutzer:PDD/markAdmins.js]].

Das Script markiert auf Spezial-, Benutzer-, Diskussions-, Projekt-, Datei- und Hilfeseiten sowie in Versionsunterschieden und der Versionsgeschichte Benutzer mit erweiterten Rechten:

* [[Wikipedia:Administratoren|Administratoren]] mit (A) oder (A-Ren) (umbenannte Administrator-Accounts)
* [[Wikipedia:Bürokraten|Bürokraten]] mit (B)
* [[Wikipedia:Checkuser|Checkuser]] mit (CU)
* [[Wikipedia:Ombudsleute|Ombudsleute]] mit (Omb)
* [[Wikipedia:Oversight|Oversighter]] mit (OS)
* [[Wikipedia:Steward|Stewards]] mit (S)
* [[Wikipedia:Schiedsgericht|Schiedsgerichtangehörige]] mit (SG) oder (SG-A) (letztere haben extra und nur für das Schiedsgericht Admin-Rechte erhalten)

Wem diese Auszeichnungen nicht reichen (das Script unterstützt auch noch „Commons-Administratoren“, „ehemalige Administratoren“ und „ehemalige Bürokraten“) oder die Texte ändern möchte, kann dies in einem eigenen JavaScript anpassen. Je nach eigenem Skin muss hierfür die eigene [[Special:MyPage/monobook.js|monobook.js]], die [[Special:MyPage/vector.js|vector.js]] oder dergleichen angepasst werden. Hier können dann die folgenden Einstellungen konfiguriert werden (hier gelistet sind die "Vorgaben" des gadget):

<source lang="JavaScript">
markadmins = true; // Admins u.ä. besonders hervorheben?
marksubpages = false; // auch Links auf Admin-Unterseiten markieren?
mawatchlist = true; // auch auf der Beobachtungsliste?
macontribs = true; // auch auf den Benutzerbeiträgen?
markarbcom = true; // zusätzlich: Schiedsgericht besonders hervorheben?
markcheckuser = true; // zusätzlich: CheckUser besonders hervorheben?
markoversight = true; // zusätzlich: Oversights besonders hervorheben?
markcomadmins = false; // zusätzlich: Commons-Admins besonders hervorheben?
markexadmins = false; // zusätzlich: Ex-Admins besonders hervorheben?

// Beschriftungen
markatxt = "A"; // Markierung für Admins
markrenatxt = "A-Ren"; // Markierung für umbenannte Admins
markbureautxt = "B"; // Markierung für Bürokraten
markstewtxt = "S"; // Markierung für Stewards
markcomatxt = "Com-A"; // Markierung für Commons-Admins
markexatxt = "Ex-A"; // Markierung für Ex-Admins
markexbureautxt = "Ex-B"; // Markierung für Ex-Bürokraten
markarbcomtxt = "SG"; // Markierung für Schiedsgerichtler
markcheckusertxt = "CU"; // Markierung für Checkuser-Berechtigte
markombudsmantxt = "Omb"; // Markierung für Ombudspersonen
markoversighttxt = "OS"; // Markierung für Oversight-Berechtigte
</source>

Wer also z.B. nur die Markierung für Schiedsgerichtmitglieder auf '(SR)' ändern will, kann in seiner Config <code>markarbcomtxt = "SR";</code> eintragen (die Klammern werden automatisch gesetzt).

Zusätzliche Anpassungen in der Darstellung sind möglich - die Markierung liegt in einem 'span' und hat die CSS-Klasse "adminMark". Wer also die Markierung zusätzlich auf rotem Hintergrund haben möchte, kann in seiner [[Special:MyPage/monobook.css|monobook.css]], [[Special:MyPage/vector.css|vector.css]] oder entsprechend die CSS-Auszeichnung ergänzen, z.B.:
<source lang="CSS">
span.adminMark
{
background-color: red;
}</source>

Um die Standard-Auszeichnung "bold" der Markierung zu überschreiben, hilft der folgende CSS-Code:
<source lang="CSS">
span.adminMark
{
font-weight: normal !important;
}</source>
[[Kategorie:Wikipedia:Helferlein]]

[[ja:Help:マークアドミン]]

Wikipedia:Helferlein/Revision Counter

2010-12-13T17:12:04Z

Was a bee: ja:Help:リビジョン・カウンター

[[Datei:RevisionCounterSample.png|framed|Dieser Artikel hat 1106 Versionen, von denen der eingeloggte Nutzer 285 erstellt hat]]
Mit dem '''Revision Counter''' kann man sich die Gesamtzahl an Versionen einer Seite anzeigen lassen. Im Reiter „Versionsgeschichte“ wird dabei die Anzahl Versionen angehängt und die Anzahl Versionen, die der eingeloggte Benutzer bearbeitet hast. Standardmäßig wird dies nur ermittelt, wenn man auf der Versionsgeschichten-Seite ist.

== Installation ==
Man muss unter einem Wikipedia-Benutzerkonto angemeldet sein, um den Revision Counter verwenden zu können. [[Spezial:Userlogin|Hier]] kann man ein solches Konto anlegen und sich anmelden.

Der nächste Schritt ist es auf [[Spezial:Einstellungen]] in den Karteireiter „Helferlein“ zu gehen, dort im Abschnitt „Lesehilfen“ den Haken vor „Revision Counter“ zu setzen und anschließend auf „Einstellungen speichern“ zu klicken.

Um das Skript zu '''deinstallieren''', entfernt man einfach den Haken in den Einstellungen und speichert diese ab.

== Eigene Anpassungen ==
Da die Ermittlung bei Seiten mit vielen Versionen einige Sekunden dauern kann und während dieser Zeit andere Tools (wie z.B. Navigations-Popups) nicht funktionieren, wird die Anzahl standardmäßig nur ermittelt, wenn du per „Versionen/Autoren“ auf die Versionen-Seite gewechselt bist.

Möchtest du, dass die Anzahl Versionen bei jedem Seitenaufruf ermittelt wird, musst du deine [[Special:Mypage/vector.js|eigene vector.js]] (bzw. [[Special:Mypage/monobook.js|monobook.js]] – je nach Skin) bearbeiten und dort folgendes eintragen:

<source lang="JavaScript">
if (window.revisionCounter) revisionCounter.checkOnlyOnHistory = false;
</source>

== Technische Details ==

Dieses Gadget nutzt die [http://www.mediawiki.org/wiki/API Wikipedia-API]. Bei Ausführung werden über diese die Versionen ermittelt.

Der JavaScript-Code ist unter [[MediaWiki:Gadget-revisionCounter.js]] zu finden.

== Changelog ==
* '''20. Januar 2010''': Erste Version

== Autor ==
* [[Benutzer:APPER]], ursprünglicher Autor

[[Kategorie:Wikipedia:Helferlein|{{SUBPAGENAME}}]]

[[ja:Help:リビジョン・カウンター]]

Benutzer:Was a bee/connectivity

2010-10-07T00:37:33Z

Was a bee: move to ru

Wikipedia:Toolserver

2010-10-02T18:21:46Z

Was a bee: ja:Wikipedia:ウィキメディア・ツールサーバー

[[Datei:Wikimedia_Community_Logo-Toolserver.svg|thumb|Das Toolserver-Logo]]
Der '''Wikimedia Toolserver''' ist ein Projekt von Wikimedia Deutschland, das es interessierten Programmierern erlaubt, direkt auf die Wiki-Datenbanken zuzugreifen. Auf diese Weise können sie der Community bessere Werkzeuge zur Verfügung stellen.

* [[m:Toolserver|Beschreibung des Toolservers auf Meta]]
* [https://wiki.toolserver.org/ Hauptseite des Toolserver-Wikis]

== Infrastruktur ==
[[Datei:Toolserver-cluster.svg|thumb|Der Toolserver-Cluster]]
Der Toolserver ist kein einzelner Rechner, sondern ein Cluster von Servern mit unterschiedlichen Aufgaben:
# Datenbank-Server, die die Kopien der Datenbanken von allen Wikimedia-Projekten enthalten.
# Web-Server, auf dem die Tools zur Verfügung gestellt werden.
# Login-Server, auf dem Bots und andere Skripte laufen.

Zusätzlich gibt es noch Server für die verschiedenen Hilfsdienste, wie zum Beispiel den [http://jira.toolserver.org Bug-Tracker JIRA].

* [https://wiki.toolserver.org/view/Servers Liste der Toolserver-Hardware]

=== Status ===
Der Toolserver läuft zwar mittlerweile recht stabil, dennoch kann es ab und an zu Ausfällen oder Störungen kommen. Mehr über den aktuellen Status erfährt man hier:

* [http://journal.toolserver.org/ Toolserver Blog]
* [http://status.toolserver.org/ Datenbank-Status]

Aktuelle Informationen gibt es auch im [[Wikipedia:IRC|IRC]] im Kanal #wikimedia-toolserver.

==== Replag ====
Der „Replag” (von „Replication Lag”, dt. „Replikationsverzögerung”) besagt, wie lange es dauert, bis eine Änderung, die in der Wikipedia vorgenommen wurde, auf dem Toolserver ankommt. Wenn der Replag hoch ist, sind die Ergebnisse, die die Tools liefern, u.U. veraltet.

* [http://toolserver.org/~bryan/stats/replag/ Aktueller Replag] (Der für die deutschsprachige Wikipedia zuständige Server heißt „sql-s5”)

== Zugang ==
Grundsätzlich kann jeder Interessierte Zugang zum Toolserver bekommen. Etwas programmieren sollte man aber schon können, sonst kann man damit wenig anfangen. Wichtig ist, dass man sich an die [https://wiki.toolserver.org/view/Rules Nutzungsbedingungen] (englisch) hält.

* [https://wiki.toolserver.org/view/Account_approval_policy/de Richtlinie für die Accountvergabe](deutsch)

== Kontakt ==
Wenn es Probleme mit oder Fragen zum Toolserver gibt, sind die Toolserver-Admins im IRC im Kanal #wikimedia-toolserver zu erreichen, oder per Mail unter ts-admins@toolserver.org. Lokale Ansprechpartner hier in der Wikipedia sind:

* [[Benutzer:DaB.]]
* [[Benutzer:Duesentrieb]]

Wenn es um Probleme mit einem spezifischen Tool gibt, ist es besser, den Autor des Tools direkt anzusprechen. Die Admins haben da meistens zu wenig Informationen.

Der Autor lässt sich über die Webadresse des Tools finden, also ''www.toolserver.org/~AUTOR/irgendwas''. Kontakt ist dann z.B. über die E-Mailadresse ''AUTOR@toolserver.org'' möglich, vorher sollte man aber schauen, ob es nicht schon eine Projektseite zu dem Tool gibt.

== Siehe auch ==
* [[Wikipedia:Helferlein]]
* [[Wikipedia:TUSC]] (Ein TUSC-Konto hilft bei der leichteren Benutzung einiger Helferlein des Toolservers)
[[Kategorie:Wikipedia:Hilfe|Toolserver]]

[[be-x-old:Вікіпэдыя:Сэрвэр інструмэнтаў]]
[[en:Wikipedia:Toolserver]]
[[fr:Wikipédia:Toolserver]]
[[it:Wikipedia:Toolserver]]
[[ja:Wikipedia:ウィキメディア・ツールサーバー]]
[[ksh:Wikipedia:Toolserver]]
[[pl:Wikipedia:Toolserver]]
[[pt:Wikipedia:Toolserver]]
[[ru:Википедия:Тулсервер]]
[[sv:Wikipedia:Toolserver]]

Benutzer:Was a bee/connectivity

2010-10-01T01:49:06Z

Was a bee: AZ: Die Seite wurde neu angelegt: ==age== <pre> pagetitle="${language}wiki の作成日順孤立した記事" thish1="${language}wiki の…

==age==
<pre>
pagetitle="${language}wiki の作成日順孤立した記事"
thish1="${language}wiki の最も古い孤立した記事"
whatisit="このページは孤立した記事を、記事の作成日順にリストしています。作成されてそれほど日のたってない記事は、テンプレートを貼り付けることで修正されることが期待できます。しかしここにリストされている記事はすでに記事を立てた人がチェックしてない可能性が高いものです。"
list2name="作成日順の孤立した記事"
</pre>

==category==
<pre>
pagetitle="${language}wiki の孤立した記事（カテゴリ別）"
thish1="${language}wiki の孤立した記事（カテゴリ別）"
example="例: Писатели России"
catnamereq="カテゴリ名を入力"
top1name="孤立した記事が多いカテゴリトップ100"
top2name="孤立した記事の割合が高いカテゴリトップ100"
submenudesc="$wiki_link_to_category 内の孤立した記事全リスト"
</pre>

==categoryspruce==
<pre>
pagetitle="${language}wiki のカテゴリーツリーの状態"
thish1="${language}wiki のカテゴリーツリーの状態"
rootcatnote1="The list below normally must contain just one category named Всё. "
rootcatnote2="Other entries are considered as uncotegorized categories. "
clsizenote1="The list below shows categories forming clusters of size"
clsizenote2="Normally it should be empty (and unexistent), there must be no clusters of size above one in the categorytree. "
cattreedesc1="Each row in the table represents a layer in the categorytree."
cattreedesc2="Normally layers are formed by categorization of categories and must have no cycles."
cattreedesc3="All the layers having a number higher than 1 at the end of the layer name are wrong and represent cycles."
cattreedesc4="Also it is important to keep the top layer category <a href=\"./go.sh?listby=categoryspruce&language=$language&interface=en&networkpath=_1\">_1</a> having the single top member. "
struchead="Categorytree structure"
queryname1="empty redirecting categories"
query1note1="Categories namespace is not designed for redirects. "
query1note2="Categorization through a redirect does not construct proper category lists. "
queryname2="redirecting categories with members or redundant links"
query2note1="This list contains redirects in category namespace with articles included into this redirec as in a category, or even redirects with superflous text and links, which are normally invisible. "
query2note2="Redirects to main namespace with articles included are probably not redirects, but regular categories. "
query2note3="Other redirects linking categories need to be emptied before redirect deletion. "
</pre>

==common==
<pre>
mainh1="コネクティビティ・プロジェクト"
motivation="記事"
isolatedarticles="孤立した記事"
bycategory="カテゴリ別"
catns="カテゴリ"
allsuggestions="with suggestions"
fortext="for"
resolvedisambigs="disambigue links"
justlink="iwiki spy"
parttranslate="spy links"
translatenlink="translate & link"
anonymiso="IP利用者が作成した記事"
wholelist="リスト"
byclustertype="by cluster type"
orphanes="完全に孤立した記事"
bycreator="作成者別"
byage="作成日順"
graphdata="グラフ"
usrns="利用者"
deadend="行き止まりの記事"
nca="カテゴリがない記事"
disambig="曖昧さ回避ページ"
links_disambiguation_for_articles="曖昧さ回避にリンクしてる記事"
for_templates="テンプレート経由"
cattreecon="カテゴリーツリーの状態"
contactme="連絡先"
commondisc="mashiah の会話ページ"
attext="at"
srclocation="ソースコード "
nohost="が利用できません。sql が $dbhost にアップされていないようです。"
nodata="指定された言語版のデータは準備されていません"
noudb="利用者データベースが存在しません。$dbhost の問題のようです。"
hostisnotallowed="hemlock から $dbhost 上のsalサーバへのアクセスは許可されていません。"
dbjustcreated="要求された表が存在しません。恐らくデータベースが生成されたばかりで、まだシステムにアップされていません。"
dbhostblocked="多数の接続エラーのため、データベース・ホストがブロックされています。"
next="次"
previous="前"
agotext="前"
reptext="データ取得日"
runtext="ボット計算開始"
acttext="ページ最終更新"
daystext="日"
hourstext="時間"
mintext="分"
sectext="秒"
updatedtext="最終更新"
freshtext="新鮮"
acceptabletext="普通"
rottentext="更新待ち"
misscfgtext="古い"
linkshere="リンク元"
suggesttext="suggest links"
article_title_tr="isolated article title"
iso_type_tr="cluster chain type"
activateform="してエンターを押してください"
languagename="english/native language name"
articlestoimprove="articles to improve"
linkableisolates="isolates affected"
articlestotranslate="articles to translate"
byforeignlang="by suggestion language"
byisocategory="by category of isolates"
bylanguagespied="by language spied"
ianamereq="記事名を入力"
langnamereq="言語版を選択"
all_languages="全言語版"
and="and"
spiedwikification="spied wikification"
r_notrecognized="この記事は「孤立記事ではない」と判定されています。"
r_orphaned="Article is recognized as orphaned article.<table class=\"cite\"><tr><td class=\"left\">«</td><td><a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%98%D0%B7%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B5_%D1%81%D1%82%D0%B0%D1%82%D1%8C%D0%B8\">Orphaned articles</a> cannot be open with a hyperlink reading other <a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%A1%D1%82%D0%B0%D1%82%D1%8C%D1%8F\">articles</a> (links from chronological articles are not taken into account); work on orphaned articles linking from other related articles is welcome. It should be especially noted that links through redirection pages and chains of redirects are taken into account.</td><td class=\"right\">»</td></tr></table>"
r_isolated="この記事は「他の孤立記事からリンクされている孤立記事」と判定されています。<table class=\"cite\"><tr><td class=\"left\">«</td><td><a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%98%D0%B7%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B5_%D1%81%D1%82%D0%B0%D1%82%D1%8C%D0%B8\">Isolated articles</a> are <a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%A1%D1%82%D0%B0%D1%82%D1%8C%D1%8F\">articles</a> unreachable walking with hyperlinks from vast majority of other articles. Isolated articles can form <a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%98%D0%B7%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B5_%D0%BA%D0%BB%D0%B0%D1%81%D1%82%D0%B5%D1%80%D1%8B\">isolated clusters</a>. Members of isolated clusters are all reachable from each other within the cluster. Linked with one-way links clusters can form <a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:%D0%A6%D0%B5%D0%BF%D0%BE%D1%87%D0%BA%D0%B8_%D0%B8%D0%B7%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D1%85_%D0%BA%D0%BB%D0%B0%D1%81%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%BE%D0%B2\">chains of isolated clusters.</a> Isolated articles analysis does not take into account links from chronological articles.</td><td class=\"right\">»</td></tr></table>"
disambiguationspage_improperly_configured="<a href='http://$language.wikipedia.org/wiki/MediaWiki:Disambiguationspage'>[[MediaWiki:Disambiguationspage]]</a> is improperly configured. Use direct links to template namespace pages to enable articles connectivity analysis."
templatedoc_improperly_configured="Requires standard template documentation subpage name to be configured at"
never_run="言語版$languageのデータ収集はまだ行われていません。"
interface_text="インターフェース"
tablelink="言語版の比較表"
isotext="孤立した記事 は他の記事からほとんどリンクされていない記事です。内のいくつかは他の記事から全くリンクされていません。"
_articles1="記事"
_articles="記事"
</pre>

== creator ==
<pre>
pagetitle="${language}wiki の作成者別孤立した記事"
thish1="${language}wiki の作成者別孤立した記事"
example="例:"
default_example="[placeholder]"
unamereq="利用者名を入力"
list1expl="このリストは次の利用者が作成した孤立した記事です"
list2name="孤立した記事の作成数が多い利用者"
whatisit="このページでは孤立した記事の作成量順に利用者をリストしています。"
anonymous_s="このリストは次のIPアドレスが作成した孤立した記事です。"
</pre>

== disambig ==
<pre>
pagetitle="記事からリンクされている曖昧さ回避ページ"
thish1="リンクされている曖昧さ回避ページ"
whatisit1="このリストは曖昧さ回避ページの一覧です。記事からのリンク数が多い順に並んでいます。相互にリンクしあってるもの (例えば {{otheruses}} テンプレートによるもの等) はカウントしていません。"
top1name="最もリンクされている曖昧さ回避ページ"
top2name="最も曖昧な記事"
top3name="最も曖昧なテンプレート"
_of_X_does_="of article links point"
_of_X="of disambiguation pages instead"
drdi_text="<a href=\"http://en.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:Disambiguation rule disregard index\">Disambiguation rule disregard index</a>"
par1="Disambiguation rule informs us from {{disambig}} template we may wish to resolve links pointing disambiguation pages."
par2="A ratio between portion of links leading to disambiguation pages to portion of those pages in the set joining them to articles is known as disambiguation rule disregard index."
</pre>

== disambig,template ==
<pre>
pagetitle="曖昧さ回避ページにリンクしてるテンプレート"
thish1="曖昧さ回避ページにリンクしてるテンプレート"
whatisit1="このリストは曖昧さ回避ページへのリンクが多いテンプレートの一覧です。リンクの数が多い順に並んでいます。"
top1name="曖昧さ回避ページへのリンクが多いテンプレート"
top2name="曖昧さ回避ページへのリンクが多い記事"
top3name="記事からのリンクが多い曖昧さ回避ページ"
template_title="テンプレート名"
ambiguous_links="曖昧なリンク"
a_cnt="used in articles"
</pre>

== disambig,title ==
<pre>
pagetitle="曖昧さ回避ページへのリンクが多い記事"
thish1="曖昧さ回避ページへのリンクが多い記事"
whatisit1="このリストは曖昧さ回避ページへのリンクが多い記事の一覧です。リンクの数が多い順に並んでいます。相互にリンクしあってる記事同士 (例えば {{otheruses}} テンプレートによるもの等) はカウントしていません。"
top1name="曖昧さ回避ページへのリンクが多い記事"
top2name="曖昧さ回避ページへのリンクが多いテンプレート"
top3name="記事からのリンクが多い曖昧さ回避ページ"
</pre>

== language ==
<pre>
pagetitle="コネクティビティ・プロジェクト統計"
thish1="言語版の比較"
lang_text="言語"
article_text="記事 "
disambig_text="曖昧さ回避 "
article_and_disambig_text="記事+曖昧さ回避 "
ambig_text="terms ambiguity, %"
drdi_text="<a href=\"http://en.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:Disambiguation_rule_disregard_index\">DRDI</a>, % "
main_text="core"
iso_text="isolated "
iso_rat_text="isolated, %"
iso_cr_text="isolates creators "
chrono_text="chrono artcles "
deadend_text="deadend articles "
nocat_text="not categorized articles"
catring_text="category tree cycles size"
nocatcat_text="not categorized categories"
time_text="actuality"
cl_text="cluster size limit"
</pre>

== lists ==
<pre>
pagetitle="孤立した記事のリスト"
thish1=$isolatedarticles
available_lists="available lists of isolated articles"
fl="孤立した記事の完全なリスト"
fl_disambig="full list of isolated articles with suggestions on links disambiguation"
fl_interlink="full list of isolated articles with suggestions on linking from interwiki spy"
fl_translate="full list of isolated articles with suggestions on linking with translation"
fl_anonym="full list of isolated articles created by anonymous or not logged in authors"
isoclustertext="Links between isolated articles form isolated clusters, wich are not linked from articles out of the cluster but for each pair of isolated articles in a cluster it is possible to pass from one to another with use of hyperlinks."
upper_cluster_limit="The upper limit on isolated cluster size during the analysis is"
no_upper_limit="The analysis is made with no upper limit on isolated cluster size."
linked_core="linked core"
_isolated="isolated"
</pre>

== suggest ==
<pre>
pagetitle="Suggest a link for isolated articles"
thish1="suggest a link for isolated articles for ${language}wiki"
clause1="All suggestion types cannot be shown together by categories. Try for particular article name or by a suggestion type."
clause2="What if it does not suggest?"
clause3="Most likely the article has no or low on interwiki links, add few and wait for hope one or two days, then look again, the suggestions may have slightly changed."
clause4="The article maybe non-isolated, did not exist or was non-isolated when latest data been collected."
subclause1="Isolated articles below are linked from disambiguation pages, which are also linked from regular articles. This is a chance for both, making isolated articles linked, or making disambiguation pages not linked from articles directly."
subclause2="Isolated articles below are inter-wiki lined by non-isolated articles, and articles linking them are also interwiki-linked back to [[ru:]]."
subclause3="Isolated articles below are inter-wiki lined by non-isolated articles, and articles linking them can be translated and then link isolates."
</pre>

== suggest,category ==
<pre>
pagetitle="Suggest a link for isolated articles"
thish1="suggest a link for isolated articles for ${language}wiki"
submenu1desc="this is the list of isolated articles linked from linked disambiguation pages for category $wiki_link_to_category"
submenu2desc="this is the list of isolated articles with linking suggestions for category $wiki_link_to_category"
submenu3desc="this is the list of isolated articles with translation suggestions for category $wiki_link_to_category"
subclause1="Categories below are ordered by amount of isolated articles having links from disambiguations, which are also linked from other articles."
subclause2name="...what is your name..."
subclause2="Categories below are ordered by amount of isolated articles, which may have linked, because some of interwiki links for that articles point to linked pages and linking articles also have backward intewiki links."
subclause3="Categories below are ordered by amount of isolated articles, which mave have linked, because some of interwiki links for that articles point to linked pages and linking articles can be translated to link isolates."
</pre>

== suggest,category,foreign ==
<pre>
pagetitle="Suggest a link for isolated articles"
thish1="suggest a link for isolated articles for ${language}wiki"
subclause1name="articles in category $wiki_link_to_category with linking suggestions spied from ${foreignname}"
subclause2name="articles in category $wiki_link_to_category with suggestions for translation from ${foreignname}"
subclause2="This is the list of languages to spy links from for isolated articles in category $wiki_link_to_category. For each language the amount of articles suggested for translation improvement and the amount of isolated articles, which could be linked, are provided."
subclause3name="languages to copy links from for isolates in category $wiki_link_to_category"
subclause3="This is the list of languages to spy links from for isolated articles in category $wiki_link_to_category. For each language the amount of articles suggested for translation improvement and the amount of isolated articles, which could be linked, are provided."
subclause4name="languages to translate from for isolates in category $wiki_link_to_category"
subclause4="This is the list of languages to translate and spy links from for isolated articles in category $wiki_link_to_category. For each language the amount of articles suggested for translation and the amount of isolated articles, which could be linked, are provided."
</pre>

== suggest,foreign ==
<pre>
pagetitle="Article improvement hints"
thish1="article improvement hints for ${language}wiki"
subclause1name="languages to copy links from"
subclause1="This is the list of languages to spy links from with the amount of articles suggested for further translation or wikification and with the amount of isolated articles, which could be linked."
subclause2name="languages to translate from"
subclause2="This is the list of languages to translate and spy links from with the amount of articles suggested for translation and with the amount of isolated articles, which could be linked."
</pre>

== suggest,foreign,category ==
<pre>
pagetitle="Suggest a link for isolated articles"
thish1="suggest a link for isolated articles for ${language}wiki"
subclause1name="categories for links copying from ${foreignname}"
subclause1="This is the list of categories of articles, which could be wikified spying links to isolated articles from ${foreignname} wikipedia."
</pre>

== suggest,template ==
<pre>
pagetitle="Disambiguation of template links"
thish1="disambiguation of template links for ${language}wiki"
sggclause1="Disambiguation pages linked"
sggclause2="Disambiguation pages listed below are linked from the template page. Links from the template documentation are excluded from the list unless the documentation is templated from non-standard location."
</pre>

== suggest,title ==
<pre>
pagetitle="Suggest a link for isolated articles"
thish1="suggest a link for isolated articles for ${language}wiki"
sggclause0="may have linked through disambiguation page"
sggclause1="Based on disambiguation links analysis, this isolated article may become linked from the following articles:"
sggclause2="Note that chronological articles and collaborative list do not form valid links."
sggclause3="They can be considered for links pointing disambiguation pages cleanup."
sggclause4="other languages based suggestion for linking"
sggclause5="Interwiki analysis shows that interlinked articles are linked in their language sections, and the foreign linkers also have interwiki to ${language}:"
sggclause6="suggestion for translation"
sggclause7="Interwiki analysis shows that interlinked articles are linked in their language sections, so linking pages can be translated:"
sggclause8="disambiguation pages linked"
sggclause9="Article contains links to disambiguation pages listed here. Links to disambiguation pages are not desired in articles, it is recommended to specify links so that they point articles instead."
sggclause10="wikification suggested spying other languages"
sggclause11="Isolated articles listed below could be linked from this article as it is done in other language sections."
googleonwikipedia="search Wikipedia with Google"
</pre>

== zns ==
<pre>
pagetitle="コネクティビティ・プロジェクト統計"
thish1='scope'
par1="Let define articles as named connected texts in main namespace with content about one of possible meanings of the term used as the text name."
par2="Disambiguation pages describe multiple term meanings, collaborative lists and redirection pages contain no connected text, so they all cannot be treated as articles according to the definition above."
par3="Links from chronological articles are not enough as providing low achievability to articles they link. Thus we do not take them into account doing orphaned and other isolated articles analysis."
par3a="All links considered as equivalent, however links from chrono articles are insufficient for making articles connected, thus it is necessary to configure categories for chronological articles on page"
par3b="configuration example can be found <a href=\"http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%92%D0%B8%D0%BA%D0%B8%D0%BF%D0%B5%D0%B4%D0%B8%D1%8F:ConnectivityProjectInternationalization/ArticlesNotFormingValidLinks\">here</a>"
par4="Dead-end articles do not contain any links to other existent non-chronological articles. This defines a wider set than just \"no links at all\" not taking into account where those link go to."
par4a="Dead-end articles do not contain any links to other existent articles. This defines a wider set than just \"no links at all\" not taking into account where those link go to."
zns_contains_="標準名前空間内訳"
_pages1="ページ"
_pages="ページ"
_other='その他'
_lists1="リスト"
_lists="リスト"
_types1="タイプ"
_types="様々なタイプ"
_deadend1="行き止まり"
_deadend="行き止まり"
_of_them_crono="of them are chronological articles"
_disambigs="曖昧さ回避"
_and_="+"
_cllt="collaborative"
avg_chrono_links_="Average chronological article links"
other_links_="Other articles link in average"
each_links_="Each article is linked from and links in average"
_of_links_are_to_chrono="of links between articles are links to chrono articles"
avg_chrono_is_linked_by_="Average chrono article is linked from"
_of_articles_are_isolated_of="of articles are isolated articles of"
also_=""
_determined1="判定"
fl_wr="full list of main namespace redirects with redundant links"
fl_wr_desc="This list contains pages, which are recognized by WikiMedia engine as redirects but, unlike to other redirects, containing (in addition to #REDIRECT[[article name]]) some other text with links or transcuding templates containing links to zero namespace. It is recommended to modify the content of pages in this list so that they become recognized as regular redirects or regular articles. In case the cause is in the template, removal of links to zero namespace would be of help."
_couldbe="such as $_cllt lists and soft redirects"
</pre>

Benutzer:APPER/WikiHistory/Programm

2010-09-24T13:35:38Z

Was a bee: add ja:Wikipedia:ツール/ウィキ・ヒストリー

'''WikiHistory''' ist ein Tool zur Autorenbestimmung von Wikipedia-Artikeln.

[[Datei:Nuvola apps download manager.png|thumb|http://toolserver.org/~apper/WikiHistory.exe Download]]
== Anleitung ==
Nach dem Start des Programms sieht man folgendes Fenster:

<center>
[[Bild:WikiHistory01.png]]
</center>

Zunächst sollte das gewünschte Projekt ausgewählt werden:

<center>
[[Bild:WikiHistory02.png]]
</center>

Dann kann der gewünschte Artikel ausgewählt werden:

<center>
[[Bild:WikiHistory03.png]]
</center>

Nach dem Drücken der Enter-Taste oder einem Klick auf „Load History“ wird die Versionsgeschichte des Artikels geladen:

<center>
[[Bild:WikiHistory04.png]]
</center>

Unter dem Reiter „Edit List“ findet man die komplette Versionsgeschichte. Diese kann auch nach Autoren gefiltert und nach allen Kriterien sortiert werden.

<center>
[[Bild:WikiHistory05.png]]
</center>

Unter dem Reiter „User Statistics“ findet sich eine Auflistung sämtlicher Nutzer, die diesen Artikel bearbeitet haben.

<center>
[[Bild:WikiHistory06.png]]
</center>

Unter dem Reiter „Find Revision“ lässt sich die erste Version eines Artikels suchen, die einen bestimmten Text enthält. Dazu wird angefangen von der ältesten Version jede Version komplett geladen und nach dem entsprechenden Text durchsucht. Wird der Text gefunden, wird die entsprechende Version in der „Edit List“ markiert und dorthin gewechselt. Mit einem Doppelklick (oder über das Kontextmenü) kann die Änderung im Browser aufgerufen werden.

Zusätzliche Einschränkungen auf bestimmte Versionen (zeitlich oder per Markierung in der „Edit List“) bzw. auf die Toleranz gegenüber Groß- und Kleinschreibung sind ebenfalls möglich. Für komplexere Aufgaben können reguläre Ausdrücke angegeben werden. Wird der Haken bei „only find the oldest revision matching“ entfernt, werden sämtliche Versionen durchsucht, das Suchergebnis wird jeweils rot bzw. grün in der „Edit List“ gezeigt.

<center>
[[Bild:WikiHistory08.png]]
</center>

Unter dem Reiter „Text authors“ findet sich der Button „Analyze Authors“, über den sämtliche Artikelversionen geladen werden und analysiert wird, welcher Autor was zum Artikel beigetragen hat. Dies kann je nach Länge des Artikels und Anzahl Versionen sehr lange dauern (bis hin zu Stunden bei einigen Exzellenten Artikeln). Nach der Analyse wird die prozentuelle Mitarbeit eines Autoren auch in der Autorenübersicht angezeigt und es kann danach sortiert werden.

<center>
[[Bild:WikiHistory07.png]]
</center>

Mit einem Rechtsklick auf das „Text authors“-Feld wird ein Kontextmenü angeboten, über das man die Autorenmarkierung in die Zwischenablage kopieren kann (als HTML oder als Wiki-Text). In beiden Fällen werden zusätzlich zu den farblichen Markierungen der fünf gewählten Autoren sämtlichen Abschnitte mit title-Tags hinterlegt, sodass beim Überfahren mit der Maus über ein Wort in der Statuszeile des Browsers der Autor dieses Worts angezeigt wird. Ein Beispiel findet sich [[Benutzer:APPER/WikiHistory/Beispiel|hier]].

== Voraussetzungen / Download ==
Das Programm WikiHistory liegt derzeit ausschließlich auf englisch vor, es kann jedoch für verschiedenste Wikimedia-Projekte (u.a. de.wikipedia) genutzt werden. Benötigt wird das .NET-Framework in der Version 2.0 oder höher. Alternativ läuft das Programm auch unter [[Mono-Projekt|Mono]] (und somit unter Linux und Mac OS X), jedoch funktioniert dort die farbige Autorenunterlegung im Programm nicht. Es wird jedoch unter Mono eine alternative Kennzeichnung durch die Textfarbe unterstützt. Der Export nach HTML oder Wiki-Text funktioniert jedoch wie gehabt, auch wenn die Analyse unter Mono gewöhnlich länger dauert als mit MS.NET.

Das Programm liegt derzeit in der Version 1.0.7 vor und kann [http://toolserver.org/~apper/WikiHistory.exe hier] geladen werden. Das [[.NET|.NET-Framework]] kann bei Bedarf bei [http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?displaylang=de&FamilyID=0856eacb-4362-4b0d-8edd-aab15c5e04f5 microsoft.com] geladen werden.

== To Do ==
Einige Dinge sollen im Laufe der Zeit verbessert werden:
* Evtl. Optimierung der Autorenbestimmung oder alternative, schnellere (und ungenauere) Variante
* Alternative Autorenbestimmung, die nur auf Versionsvergleiche aus ist und daher die Speicherung der bisherigen Analyse zulässt und Dinge wie "nur die letzten 50 Versionen analysieren..."
* [[Internationalisierung (Softwareentwicklung)|Internationalisierung]] (Übersetzung ins Deutsche; Korrektur meines schlechten Englisch ;)
* Export der Farblegende bei der Autorenbestimmung
* Speichern der Autorenanalyse (bei aktuellem Algorithmus funktioniert das nur, wenn es keine neue "neueste" Version gibt)
* Proxy-Support

== Fehler und Anregungen ==
Fehler und Anregungen sollten hier auf der Diskussionsseite hinterlegt werden.

== Changelog ==
* Version 1.0.0: Initiale Version (9. Oktober 2008)
* Version 1.0.1: Geschwindigkeit verbessert (9. Oktober 2008)
* Version 1.0.2: Andere farbliche Markierung unter Mono (27. Januar 2009)
* Version 1.0.3: Bugfix (7. Februar 2009)
* Version 1.0.4: Erweiterte Suchoptionen; Fix der Suggestions (9. Februar 2009)
* Version 1.0.5: Kleinigkeiten+Bugfixes; Check for Updates (20. April 2009)
* Version [[Benutzer:APPER/WikiHistory/1.0.6|1.0.6]]: Autorenanalyse für beliebige Revisionen mit Pause-Funktion; Schnellere Analyse durch überspringen von Versionen gleicher Autoren (24. April 2009)
* Version [[Benutzer:APPER/WikiHistory/1.0.7|1.0.7]]: Fix nach Änderung der Wikimedia-Server (21. Februar 2010)

[[ja:Wikipedia:ツール/ウィキ・ヒストリー]]

Benutzer:Was a bee/vector.css

2010-09-23T14:30:30Z

Was a bee: AZ: Die Seite wurde neu angelegt: @import url("http://www.ac.auone-net.jp/~geo/test.css");

@import url("http://www.ac.auone-net.jp/~geo/test.css");

Benutzer:Was a bee/vector.js

2010-09-23T14:29:02Z

Was a bee: AZ: Die Seite wurde neu angelegt: importScriptURI('http://ja.wikipedia.org/w/index.php?title=User:Was_a_bee/vector.js' + '&action=raw&ctype…

importScriptURI('http://ja.wikipedia.org/w/index.php?title=User:Was_a_bee/vector.js' + '&action=raw&ctype=text/javascript');

Benutzer Diskussion:APPER/WikiHistory/Programm

2010-09-23T14:09:35Z

Was a bee: /* Thank you */

== Großes Lob ==
Hallo APPER, ganz ganz ganz großes Lob für dein Tool. Lustigerweise habe ich mir vor anderthalb Jahren etwas ganz ähnlliches gewünscht: [http://de.wikipedia.org/wiki/Wikipedia_Diskussion:Helferlein/Archiv#Wunsch:_Graphisches_Tool_zum_Erkennen_der_Urheberschaft_von_Passagen_eines_Artikels] und [http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Benutzer_Diskussion%3ARaymond&diff=38296509&oldid=38275023#Ideen_zu_Histogramm]. Damals hat keiner angebissen. Würde mich mal interessieren, ob du das gesehen hast. :-)

Ich bin gerade dabei, mit Hilfe des Tools eine Datenbasis zu erheben, um die Diskussion zu Hauptautoren-Attributierung voranzutreiben. Hier entsteht der [[Benutzer:Minderbinder/Hauptautoren|Entwurf]]. Das werd ich dann mal [[Hilfe:Buchfunktion/Feedback_zur_Buchfunktion#Principal_Authors|dort]] einbringen. --[[Benutzer:Minderbinder|Minderbinder]] 13:32, 3. Feb. 2009 (CET)

:Nein, deine Beiträge kannte ich nicht. Die Idee dazu lag mir schon länger auf der Seele und das Tool war größtenteils von den Ergebnissen des [[Benutzer:Jah/Hauptautoren|Hauptautoren-Tools]] beeinflusst, dass ich aber nie selbst installiert habe und nur die zwei Beispiel-Seiten kannte. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 20:08, 3. Feb. 2009 (CET)

::Dem Lob muss ich mich anschließen, wirklich klasse, das Tool. Wie oft ich mich schon durch die History gequält habe, um herauszufinden, wer vor 6 Monaten Passage xy unbelegt eingefügt hat -.- ... Vielen Dank! --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 18:52, 7. Feb. 2009 (CET)
:::+1 schließe mich an --[[Benutzer:Euku|Euku]]:[[Benutzer_Diskussion:Euku|⇄]] 17:31, 19. Apr. 2009 (CEST)

:::: <math>1^9</math> super toll. Soll es das für alle Projekte geben? Auch Wiktionarys? --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 19:19, 15. Mai 2009 (CEST)

:::::Da das Tool die API nutzt, sollte es für alle Projekte gehen. Wenn Wiktionarys gewünscht sind, kann ich sie gerne ergänzen. In der ersten Version habe ich nur die größten Wikipedias und Commons eingebaut, möglich ist aber alles. Einfach hier Wünsche melden. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 03:49, 16. Mai 2009 (CEST)

== Kleiner Bug? ==

Hallo. Irgendwie scheint das Programm beim Artikel [[HIV/AIDS in der Ukraine]] zu streiken. Die History wird zwar geladen, aber wenn ich auf "Analyze Authors" klicke, hängt er sich einfach auf. Selbes Problem besteht bei [[HIV/AIDS in der Ukraine]] und [[McDonnell Douglas F/A-18]], also war mein erster Verdacht, dass es am Schrägstrich im Titel liegt. Aber die Artikel [[Brünn/Thür.]] und [[G/Geschichte]] funktionieren. Macht's die Kombination aus Leerzeichen und Schrägstrich? Kannst du das Problem nachvollziehen? ;) --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 11:12, 8. Feb. 2009 (CET)

:Hm, ich kann das nicht beobachten. Die beiden Artikel sind ziemlich lang und die Analyse dauert leider ne halbe Ewigkeit, aber dass nichts passiert kann ich nicht beobeachten bei mir. Die Analyse schon der ersten Version dauert aber leider ewig. Beide Artikel waren schon am Anfang relativ lang und relativ wenige lange Passagen haben sich gehalten - daher ist die Analyse mehr als aufwändig. Auch wenn es wirkt, dass es nicht vorangeht, die Analyse läuft. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 15:26, 8. Feb. 2009 (CET)

::Hmm... Ich hab das heute Morgen 10 Minuten laufen lassen und es war kein Fortschritt zu sehen; und das Programm hat dann in dieser Zeit auch keinen neuen Artikel angenommen. Daraus habe ich geschlossen, dass es sich aufgehängt hat. Möglicher Weise war ich zu ungeduldig, "schon" nach 10 Minuten abzubrechen und es lag einfach an meinem lahmen Rechner. Ich werd's bei Gelegenheit nochmal versuchen, wenn Wikipedia nicht so lahm läuft wie jetzt gerade. Danke sehr! --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 20:59, 8. Feb. 2009 (CET)

== Sourcen ==

Gibst du auch die Sourcen frei, oder möchtest du das für dich behalten? --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 15:54, 6. Apr. 2009 (CEST)
:PS: Die Version 1.0.4 läuft nicht unter Mono (zumindest nicht unter Ubuntu 8.10 und Ubuntu 9.04). --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 16:16, 6. Apr. 2009 (CEST)
::Hm, unter Windows und Mono läufts. Welche Mono-Version hast du? --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:42, 6. Apr. 2009 (CEST)
:::Das ist 1.9.1+dfsg-4ubuntu2. Keine Ahnung was Canonical da reingemischt hat. --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 23:18, 6. Apr. 2009 (CEST)
::::Okay, also ich teste immer nur gegen die entsprechend neueste Mono-Version und da ich auch selber Bugs dem Mono-Projekt melde und meine Tools oft umbaue, sobald eine gefixte Mono-Version draußen ist, überrascht mich das jetzt nicht. Bei 2.2 und 2.4 gab es glaub ich keine für WikiHistory relevanten Veränderungen, aber 2.0 wird wohl mindestens erwartet. Ich schiebe es einfach mal darauf --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 00:01, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::: Werde das bei Gelegenheit mal testen und dann Rückmeldung geben. --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 01:07, 7. Apr. 2009 (CEST)
:::::: 2.0.1 tut's auch noch nicht. Muss also mal mindestens 2.2 sein. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 12:12, 7. Apr. 2009 (CEST)
:::::::Dann tippe ich aber eher auf 'n anderes Problem... stürzt es nichtmal mit ner entsprechenden Meldung ab? Ich werde mal versuchen, mir das nächste Woche anzugucken, ich hab zwar kein Ubuntu hier, aber in ner virtuellen Maschine mit openSuse werd ichs dann mal versuchen. Wenn ich dann nicht antworte, hab ichs vergessen, bitte nachfragen *g* --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 12:26, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::::::Hier die Absturzmeldung:
** (./WikiHistory.exe:8978): WARNING **: The following assembly referenced from /home/xx/WikiHistory.exe could not be loaded:
Assembly: System.Windows.Forms (assemblyref_index=0)
Version: 2.0.0.0
Public Key: b77a5c561934e089
The assembly was not found in the Global Assembly Cache, a path listed in the MONO_PATH environment variable, or in the location of the executing assembly (/home/xx/).

** (./WikiHistory.exe:8978): WARNING **: Could not load file or assembly 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089' or one of its dependencies.

Unhandled Exception: System.IO.FileNotFoundException: Could not load file or assembly 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089' or one of its dependencies.
File name: 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089'
::::::::Der mag das System.Windows.Forms nicht. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 13:15, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::::::: 2.4 tuts :) --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 14:22, 7. Apr. 2009 (CEST)

:Die Sourcen sind schrecklich (vor allem durch die Analyse sieht wohl kaum jemand durch, nichtmal ich), aber prinzipiell sind die schon offen, bei Interesse Mail an apper@apper.de --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:42, 6. Apr. 2009 (CEST)

::Habe grade mal mit dem guten, alten Reflector reingeschaut und versuche es zu durchblicken. Aber so langsam kommt Licht ins Dunkel ;-) -- [[Benutzer:NonScolae|NonScolae]] 17:23, 11. Mai 2010 (CEST)

== Verbesserungsvorschläge ==
# Wenn du erst alle Versionen lädst und bei identischer Größe prüfst, ob eine Version zurückgesetzt wurde, kannst du recht leicht zurückgesetzte Vandalismen aus deiner History ausschließen. So weit ich das erkennen kann, werden die momentan mit analysiert.
# Wenn der selbe benutzer mehrere aufeinander folgende Bearbeitungen vorgenommen hat, reicht es die letzte Version des benutzers zu betrachten.
--[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 17:26, 6. Apr. 2009 (CEST)

:Der zweite Vorschlag ist in der Version 1.0.6 umgesetzt, danke für den sinnvollen Hinweis! Die Rücksetzerkennung halte ich für zu gefährlich - nur aus der Größe schlusszufolgern, dass es der gleiche Text ist, kann danebengehen. Wenn dann sollte der Text verglichen werden, das mach ich vielleicht irgendwann ;).

----

Bei der Analyse wäre es schön, wenn man angeben könnte bis zu welcher Version die Analyse laufen soll. Nicht immer interessiert die neueste version. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 12:14, 7. Apr. 2009 (CEST)

:Ab Version 1.0.6 kann jede alte Revision analysiert werden.

----

Bei sehr langen Artikeln kommt es ja verständlicherweise zu einer langen Berechnungszeit. Dass diese unter Umständen auch 24 Std. oder länger dauern kann, kann ich jetzt nur vermuten, so berechne ich gerade Hanns Eisler mit 150k. Bei der Übernahme der gänzlich überarbeiteten Version (gottseidank nur kopiert und keine Übernahme der Versionen) gab es einen Sprung um 140k. An dieser Version arbeitet das Tool nun allein schon mehrere Stunden. Soll es doch sein, ist ja kein Problem. Wenn dies aber auch gleichzeitig lokale Rechnerressourcen in hohem Maß in Anspruch nimmt, ist es eher problematisch, denn ich brauche ihn ja zum Arbeiten. Wenn es nun eine Funktion gäbe, welche die Weiterbearbeitung des Tools auf Pause stellt, und dann bei Bedarf wieder aktiviert werden könnte, dann könnten die Ressourcen besser eingesetzt werden. Soll er doch in der Nacht rechnen... <s>Eine Frage noch dazu: werden die laufenden Zwischenergebnisse eigentlich temporär auf der Platte gespeichert?</s> erledigt, bereits gesehen wo es ist, hier ist auch der Fortschritt gut erkennbar!--[[Benutzer:Hubertl|Hubertl]] 11:23, 17. Apr. 2009 (CEST)
:Nur zur Info: die erste Übernahme eines neuen, langen Textes erforderte (auf einem mittellangsamen Rechner) 2,5 STd, danach ging es im 3-Minuten-Takt weiter, zum Schluss beschleunigte sich das auf einen Minutentakt. ich war in 15 Std. fertig. --[[Benutzer:Hubertl|Hubertl]] 12:16, 18. Apr. 2009 (CEST)

----

Erstmal muss mich dem Lob anschließen. Dein Tool ist mir eine echte Hilfe! Ein Verbesserungsvorschlag meinerseits ist die Analyse von definierten Zeiträumen. In der jetztigen Version geht das Tool vom aktuellen Stand aus. Interessant wäre für mich und für andere Forscher und Forscherinnen darüber hinaus auch Antworten auf folgenden Fragen zu erhalten: Wieviele edits gab es am xx.xx.xxxx? Wer waren zu jenem Zeitpunkt die Top-User? etc (Kenne mich nicht in der Programmierung aus und kann nicht abeschätzen, wieviel Aufwand mit diesem Vorschlag verbunden ist.) Auch wäre es zur weiteren Analyse schön, wenn man die Daten nicht nur als wikisyntax rauskopieren könnte, um damit dann in anderen Programmen weiterzuarbeiten (z.B. ManyEyes zur Visualisierung). --[[Benutzer:Jojoon|Jojoon]] 09:01, 24. Apr. 2009 (CEST)

:Es können jetzt auch ältere Revisionen geprüft werden. Zum Export: dafür müsstest du mir sagen, in welcher Form und Ausführlichkeit die Daten interessant sind, dass du sie z.B. in ManyEyes importieren kannst. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 18:49, 24. Apr. 2009 (CEST)

::re: Darstellung eines älteren Standes auch für die 'overall statistics': Wie kann ich mit dem Tool konkret herausfinden, wie viele Edits insgesamt sowie von wem z.B. bis zum 15.09.2008 in einem Artikel getätigt wurden? re: Export von Daten: Ich bräuchte z.B. die Liste der Usernamen und der Anzahl der Edits, um sie in eine Excel-Tabelle zu kopieren. VIELEN DANK!!! --[[Benutzer:Jojoon|Jojoon]] 11:19, 14. Mai 2009 (CEST)
== Frage wg. Usern mit Minderwertigkeitskomplexen ==

Erst einmal auch Glückwünsche zum Tool. Wegen der Diskussion über die Autorennennung, wo dieses Tool ja eine Rolle spielen könnte, folgender Fall: es gibt ein Artikel ABC mit fünf normalgroßen Absätzen und zehn Autoren. Nur fünf werden als Hauptautoren genannt. Nun will ich einer werden, habe jedoch keine Ahnung vom Thema. Also kopiere ich irgendwo etwas, sagen wir zwei Monitorseiten [[Lorem ipsum]], und bringe es rein. Klar, fleißige Mitarbeiter weren mich gleich revertieren. Dennoch die Frage: wie wirkt sich das auf die Berechnung aus? [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 09:38, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Bei der Autorennennung meines Tools gar nicht. Grob gesagt kann man das wie folgt beschreiben: Es wird für jedes Wort im aktuellen Artikel (alles, was zwischendurch drinstand und jetzt wieder weg ist, zählt also nicht) geguckt, in welcher Version es zuerst auftauchte und diesem Autoren gutgeschrieben. Genauer gesagt werden jeweils die längsten vorkommenden Wortgruppen gesucht und einem Autor zugeordnet. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 12:28, 18. Apr. 2009 (CEST)
Fein. Drum ging es mir. Danke. Übrigens, irgendwo in der Anleitung sollte der Hinweis sein, dass man bei der Eingabe des Artikelnamens den richtigen heutigen Titel eintippt, nicht etwa den Titel, unter dem ich es erstellt habe. Wenn's später verschoben wurde dann bekomme ich die Werte für den Redirect (bzw. vielleicht auch spöter erstellte Begriffsklärung ohne es zu merken und ich wundere mich :-). Danke noch mals, [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 12:36, 18. Apr. 2009 (CEST)
Aha: die alphabetische Reihenfolge ist anders als in der Wiki - ich stehe nicht unter '''-'''jkb- sondern unter (-)'''j'''kb-. [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 12:36, 18. Apr. 2009 (CEST)

== Prozentzahl ==

Teilweise scheint die Prozentzahl nicht wirklich zu stimmen. Ich bin bisher der einzige, der den Artikel [[Lyle Workman]] editiert hat, das Tool gibt aber trotzdem nur 98 % an. -- [[Benutzer:Discostu|Discostu]] ([[Benutzer Diskussion:Discostu|Disk]]) 19:22, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Hmm... ja. Das Problem ist z.B. die später erfolgte Verlinkung von "Der Ja-Sager". Dadurch sind Zeichen hinzugekommen, da sie aber kein Text sind, werden sie erstmal niemandem zugeordnet... man kann also sagen, dass die fehlenden 2% nicht-urheberrechtlich relevantes ist. Du hast aber recht, dass das nicht gerade gut ist, ich werde versuchen, diese Teile bei Gelegenheit rauszunehmen, dass auch 100% insgesamt herauskommen... --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:43, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Bei der neuen Version 1.0.5 werden solche Abschnitte bei der Prozentberechnung nicht mehr berücksichtigt, sodass alle Angaben zusammen jetzt immer 100% ergeben sollten. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:37, 20. Apr. 2009 (CEST)

== Eingebundene Vorlagen ==

Ich hab das Tool frecherweise auch mal ausprobiert und mir scheint derjenige der eine Vorlage einfügt wird gezählt als hätte er Text geschrieben? Das kann bei kürzeren Artikeln, und je nachdem wie umfangreich die Vorlage ist das Ergebnis verzerren. Ansonsten erstmal ein Super Tool *Daumen hoch* [[Benutzer:Lady_Whistler|Lady Whistler]][[Benutzer Diskussion:Lady Whistler|☺]] 19:48, 20. Apr. 2009 (CEST)

:Ja, das Tool analysiert, wieviel vom Artikeltext von den Personen stammt. Wenn jemand eine große Vorlage "Städte Deutschlands" erstellt hat und die in 1000 Artikel einfügt, hat er ja nicht plötzlich 20% der Wikipedia geschrieben... ich gehe davon aus, dass der Inhalt von Vorlagen (nicht die Füllung durch Parameter, die ja erfasst wird) keine urheberrechtliche Schöpfungshöhe hat. Bei den Vorlagen, die z.B. zur Auslagerung von Timelines benutzt werden, wäre die Verwendung des Textes auch eine Verzerrung, da zwar viel geschrieben aber wenig urheberrechtlich relevantes da drin steht... --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 20:49, 20. Apr. 2009 (CEST)

== Ultra Geiler Shit ==

Ich hoffe du nimmst mir das nicht übel. Aber was adäquateres als '''ultra geiler Shit''' ist mir dafür einfach nicht eingefallen. Thanks --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 19:04, 15. Mai 2009 (CEST)

== Wünsche ==

1) auch alle Wiktionarys einbauen bitte :) --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 11:28, 16. Mai 2009 (CEST)

==Danke==
sehr hilfreiches Tool. [[Benutzer:Splette|Splette]] 03:11, 23. Jul. 2009 (CEST)

== Download kaputt??? ==

Der Download gibt mit eine "404"? Wo kann das Tool denn nun runtergeladen werden? Viele Grüße --[[Benutzer:Thomas Wozniak|Thomas W.]] 23:36, 24. Aug. 2009 (CEST)
: Eigentlich [http://toolserver.org/~apper/WikiHistory.exe hier], eben funktionierte der DOwnload auch. Jedoch hat der Toolserver derzeit einige Macken und er ist teilweise offline. Vielleicht haste da gerade solch eine Downtime erwischt. Wenns nicht klappt, mail ich es dir die nächsten Tage rüber, ist ja nicht groß das Programm. LG -- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 00:19, 25. Aug. 2009 (CEST)

== fehlender Referrer legt WikiHistory lahm? ==

Hallo Apper,

bei mir funktioniert WikiHistory nicht mehr. Kann es sein, dass es [http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Wikipedia:Projektneuheiten&diff=prev&oldid=70734430 mit dieser Änderung] zu tun haben könnte? -- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 23:56, 20. Feb. 2010 (CET)

:Yep, da hast du recht. Ich habe das Programm korrigiert, die neue [[Benutzer:APPER/WikiHistory/1.0.7|Version 1.0.7]] sollte wieder gehen. Eine entsprechende Nachricht sollte beim Start auch per Auto-Update kommen. Grüße --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:16, 21. Feb. 2010 (CET)
::Hallo, bei meiner Version 1.0.5. kommt die Auto-Meldung nicht, und außerdem, wenn ich auf Check for updates klicke, wird mir mitgeteilt, dass es die neueste Version 1.0.6. gibt, nichts über 1.0.7. Mache ich nun maqnuell, dies nur zur Kenntnis, Gruß [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 11:06, 21. Feb. 2010 (CET)
:::Auf jeden Fall sollte jetzt auch bei 1.0.5 die 1.0.7 als neueste Version angeboten werden. Dass sie nicht automatisch kommt, könnte daran liegen, dass schonmal das Update auf 1.0.6 kam und du auf "Nein" geklickt hast, was dazu führt, dass nicht mehr beim Start gecheckt wird (nur noch manuell). --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 11:17, 21. Feb. 2010 (CET)

::::Ja, gerade entdeckt. [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 11:19, 21. Feb. 2010 (CET)
:::::Nicht schlecht, Meldung sehen, Programm korrigieren, uploaden und für die User bereitstellen inklusive Dokumentation in nur 80min. Dafür ein großes Bienchen! Wie las ich neulich: [http://www.klamm.de/partner/unter_news.php?l_id=28&news_id=177436 Microsoft entdeckt 17 Jahre alten Bug].-- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 15:43, 21. Feb. 2010 (CET)

::::::Daher gibt es auch einen Unterschied zwischen APPER und Microsoft :-) [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 15:45, 21. Feb. 2010 (CET)

== Proxy ==

Man kann keinen Proxy eintragen. Das ist ziemlich doof wenn man Über einen Proxy surfen muss. --[[Benutzer:Bkmzde|Bkmzde]] 13:56, 22. Sep. 2010 (CEST)

:Ja, das Problem ist bekannt. Ich hab es mal auf die TODO-Liste auf der Vorderseite gesetzt. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:11, 23. Sep. 2010 (CEST)

== Thank you ==
Hallo APPER! Vielen Dank für nettes Tool. Ich weiß, das Tool von [[:en:Wikipedia: Wikipedia_Signpost/2010-09-20/Dispatches]]. Ich war erstaunt. Dies ist sehr nützlich (meine kleine Hoffnung ist .. Wenn Sie große Veränderung zu machen, ich hoffe, Sie werden Multilingualisierung Funktion zu implementieren: D). Vielen Dank. (Hello APPER! Thank you for nice tool. I know this tool from [[:en:Wikipedia:Wikipedia_Signpost/2010-09-20/Dispatches]]. I was astonished. This is very useful (my small hope is.. When you make big change, I hope you will implement multilingualization feature :D). Thank you very much.) --[[Benutzer:Was a bee|Was a bee]] 16:08, 23. Sep. 2010 (CEST)

Benutzer Diskussion:APPER/WikiHistory/Programm

2010-09-23T14:08:55Z

Was a bee: /* Proxy */ Thank you from Japan

== Großes Lob ==
Hallo APPER, ganz ganz ganz großes Lob für dein Tool. Lustigerweise habe ich mir vor anderthalb Jahren etwas ganz ähnlliches gewünscht: [http://de.wikipedia.org/wiki/Wikipedia_Diskussion:Helferlein/Archiv#Wunsch:_Graphisches_Tool_zum_Erkennen_der_Urheberschaft_von_Passagen_eines_Artikels] und [http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Benutzer_Diskussion%3ARaymond&diff=38296509&oldid=38275023#Ideen_zu_Histogramm]. Damals hat keiner angebissen. Würde mich mal interessieren, ob du das gesehen hast. :-)

Ich bin gerade dabei, mit Hilfe des Tools eine Datenbasis zu erheben, um die Diskussion zu Hauptautoren-Attributierung voranzutreiben. Hier entsteht der [[Benutzer:Minderbinder/Hauptautoren|Entwurf]]. Das werd ich dann mal [[Hilfe:Buchfunktion/Feedback_zur_Buchfunktion#Principal_Authors|dort]] einbringen. --[[Benutzer:Minderbinder|Minderbinder]] 13:32, 3. Feb. 2009 (CET)

:Nein, deine Beiträge kannte ich nicht. Die Idee dazu lag mir schon länger auf der Seele und das Tool war größtenteils von den Ergebnissen des [[Benutzer:Jah/Hauptautoren|Hauptautoren-Tools]] beeinflusst, dass ich aber nie selbst installiert habe und nur die zwei Beispiel-Seiten kannte. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 20:08, 3. Feb. 2009 (CET)

::Dem Lob muss ich mich anschließen, wirklich klasse, das Tool. Wie oft ich mich schon durch die History gequält habe, um herauszufinden, wer vor 6 Monaten Passage xy unbelegt eingefügt hat -.- ... Vielen Dank! --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 18:52, 7. Feb. 2009 (CET)
:::+1 schließe mich an --[[Benutzer:Euku|Euku]]:[[Benutzer_Diskussion:Euku|⇄]] 17:31, 19. Apr. 2009 (CEST)

:::: <math>1^9</math> super toll. Soll es das für alle Projekte geben? Auch Wiktionarys? --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 19:19, 15. Mai 2009 (CEST)

:::::Da das Tool die API nutzt, sollte es für alle Projekte gehen. Wenn Wiktionarys gewünscht sind, kann ich sie gerne ergänzen. In der ersten Version habe ich nur die größten Wikipedias und Commons eingebaut, möglich ist aber alles. Einfach hier Wünsche melden. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 03:49, 16. Mai 2009 (CEST)

== Kleiner Bug? ==

Hallo. Irgendwie scheint das Programm beim Artikel [[HIV/AIDS in der Ukraine]] zu streiken. Die History wird zwar geladen, aber wenn ich auf "Analyze Authors" klicke, hängt er sich einfach auf. Selbes Problem besteht bei [[HIV/AIDS in der Ukraine]] und [[McDonnell Douglas F/A-18]], also war mein erster Verdacht, dass es am Schrägstrich im Titel liegt. Aber die Artikel [[Brünn/Thür.]] und [[G/Geschichte]] funktionieren. Macht's die Kombination aus Leerzeichen und Schrägstrich? Kannst du das Problem nachvollziehen? ;) --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 11:12, 8. Feb. 2009 (CET)

:Hm, ich kann das nicht beobachten. Die beiden Artikel sind ziemlich lang und die Analyse dauert leider ne halbe Ewigkeit, aber dass nichts passiert kann ich nicht beobeachten bei mir. Die Analyse schon der ersten Version dauert aber leider ewig. Beide Artikel waren schon am Anfang relativ lang und relativ wenige lange Passagen haben sich gehalten - daher ist die Analyse mehr als aufwändig. Auch wenn es wirkt, dass es nicht vorangeht, die Analyse läuft. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 15:26, 8. Feb. 2009 (CET)

::Hmm... Ich hab das heute Morgen 10 Minuten laufen lassen und es war kein Fortschritt zu sehen; und das Programm hat dann in dieser Zeit auch keinen neuen Artikel angenommen. Daraus habe ich geschlossen, dass es sich aufgehängt hat. Möglicher Weise war ich zu ungeduldig, "schon" nach 10 Minuten abzubrechen und es lag einfach an meinem lahmen Rechner. Ich werd's bei Gelegenheit nochmal versuchen, wenn Wikipedia nicht so lahm läuft wie jetzt gerade. Danke sehr! --[[Benutzer:Fridel|Fridel]] 20:59, 8. Feb. 2009 (CET)

== Sourcen ==

Gibst du auch die Sourcen frei, oder möchtest du das für dich behalten? --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 15:54, 6. Apr. 2009 (CEST)
:PS: Die Version 1.0.4 läuft nicht unter Mono (zumindest nicht unter Ubuntu 8.10 und Ubuntu 9.04). --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 16:16, 6. Apr. 2009 (CEST)
::Hm, unter Windows und Mono läufts. Welche Mono-Version hast du? --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:42, 6. Apr. 2009 (CEST)
:::Das ist 1.9.1+dfsg-4ubuntu2. Keine Ahnung was Canonical da reingemischt hat. --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 23:18, 6. Apr. 2009 (CEST)
::::Okay, also ich teste immer nur gegen die entsprechend neueste Mono-Version und da ich auch selber Bugs dem Mono-Projekt melde und meine Tools oft umbaue, sobald eine gefixte Mono-Version draußen ist, überrascht mich das jetzt nicht. Bei 2.2 und 2.4 gab es glaub ich keine für WikiHistory relevanten Veränderungen, aber 2.0 wird wohl mindestens erwartet. Ich schiebe es einfach mal darauf --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 00:01, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::: Werde das bei Gelegenheit mal testen und dann Rückmeldung geben. --[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 01:07, 7. Apr. 2009 (CEST)
:::::: 2.0.1 tut's auch noch nicht. Muss also mal mindestens 2.2 sein. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 12:12, 7. Apr. 2009 (CEST)
:::::::Dann tippe ich aber eher auf 'n anderes Problem... stürzt es nichtmal mit ner entsprechenden Meldung ab? Ich werde mal versuchen, mir das nächste Woche anzugucken, ich hab zwar kein Ubuntu hier, aber in ner virtuellen Maschine mit openSuse werd ichs dann mal versuchen. Wenn ich dann nicht antworte, hab ichs vergessen, bitte nachfragen *g* --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 12:26, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::::::Hier die Absturzmeldung:
** (./WikiHistory.exe:8978): WARNING **: The following assembly referenced from /home/xx/WikiHistory.exe could not be loaded:
Assembly: System.Windows.Forms (assemblyref_index=0)
Version: 2.0.0.0
Public Key: b77a5c561934e089
The assembly was not found in the Global Assembly Cache, a path listed in the MONO_PATH environment variable, or in the location of the executing assembly (/home/xx/).

** (./WikiHistory.exe:8978): WARNING **: Could not load file or assembly 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089' or one of its dependencies.

Unhandled Exception: System.IO.FileNotFoundException: Could not load file or assembly 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089' or one of its dependencies.
File name: 'System.Windows.Forms, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=b77a5c561934e089'
::::::::Der mag das System.Windows.Forms nicht. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 13:15, 7. Apr. 2009 (CEST)
::::::::: 2.4 tuts :) --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 14:22, 7. Apr. 2009 (CEST)

:Die Sourcen sind schrecklich (vor allem durch die Analyse sieht wohl kaum jemand durch, nichtmal ich), aber prinzipiell sind die schon offen, bei Interesse Mail an apper@apper.de --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:42, 6. Apr. 2009 (CEST)

::Habe grade mal mit dem guten, alten Reflector reingeschaut und versuche es zu durchblicken. Aber so langsam kommt Licht ins Dunkel ;-) -- [[Benutzer:NonScolae|NonScolae]] 17:23, 11. Mai 2010 (CEST)

== Verbesserungsvorschläge ==
# Wenn du erst alle Versionen lädst und bei identischer Größe prüfst, ob eine Version zurückgesetzt wurde, kannst du recht leicht zurückgesetzte Vandalismen aus deiner History ausschließen. So weit ich das erkennen kann, werden die momentan mit analysiert.
# Wenn der selbe benutzer mehrere aufeinander folgende Bearbeitungen vorgenommen hat, reicht es die letzte Version des benutzers zu betrachten.
--[[Spezial:Beiträge/84.44.168.81|84.44.168.81]] 17:26, 6. Apr. 2009 (CEST)

:Der zweite Vorschlag ist in der Version 1.0.6 umgesetzt, danke für den sinnvollen Hinweis! Die Rücksetzerkennung halte ich für zu gefährlich - nur aus der Größe schlusszufolgern, dass es der gleiche Text ist, kann danebengehen. Wenn dann sollte der Text verglichen werden, das mach ich vielleicht irgendwann ;).

----

Bei der Analyse wäre es schön, wenn man angeben könnte bis zu welcher Version die Analyse laufen soll. Nicht immer interessiert die neueste version. --[[Spezial:Beiträge/87.78.188.218|87.78.188.218]] 12:14, 7. Apr. 2009 (CEST)

:Ab Version 1.0.6 kann jede alte Revision analysiert werden.

----

Bei sehr langen Artikeln kommt es ja verständlicherweise zu einer langen Berechnungszeit. Dass diese unter Umständen auch 24 Std. oder länger dauern kann, kann ich jetzt nur vermuten, so berechne ich gerade Hanns Eisler mit 150k. Bei der Übernahme der gänzlich überarbeiteten Version (gottseidank nur kopiert und keine Übernahme der Versionen) gab es einen Sprung um 140k. An dieser Version arbeitet das Tool nun allein schon mehrere Stunden. Soll es doch sein, ist ja kein Problem. Wenn dies aber auch gleichzeitig lokale Rechnerressourcen in hohem Maß in Anspruch nimmt, ist es eher problematisch, denn ich brauche ihn ja zum Arbeiten. Wenn es nun eine Funktion gäbe, welche die Weiterbearbeitung des Tools auf Pause stellt, und dann bei Bedarf wieder aktiviert werden könnte, dann könnten die Ressourcen besser eingesetzt werden. Soll er doch in der Nacht rechnen... <s>Eine Frage noch dazu: werden die laufenden Zwischenergebnisse eigentlich temporär auf der Platte gespeichert?</s> erledigt, bereits gesehen wo es ist, hier ist auch der Fortschritt gut erkennbar!--[[Benutzer:Hubertl|Hubertl]] 11:23, 17. Apr. 2009 (CEST)
:Nur zur Info: die erste Übernahme eines neuen, langen Textes erforderte (auf einem mittellangsamen Rechner) 2,5 STd, danach ging es im 3-Minuten-Takt weiter, zum Schluss beschleunigte sich das auf einen Minutentakt. ich war in 15 Std. fertig. --[[Benutzer:Hubertl|Hubertl]] 12:16, 18. Apr. 2009 (CEST)

----

Erstmal muss mich dem Lob anschließen. Dein Tool ist mir eine echte Hilfe! Ein Verbesserungsvorschlag meinerseits ist die Analyse von definierten Zeiträumen. In der jetztigen Version geht das Tool vom aktuellen Stand aus. Interessant wäre für mich und für andere Forscher und Forscherinnen darüber hinaus auch Antworten auf folgenden Fragen zu erhalten: Wieviele edits gab es am xx.xx.xxxx? Wer waren zu jenem Zeitpunkt die Top-User? etc (Kenne mich nicht in der Programmierung aus und kann nicht abeschätzen, wieviel Aufwand mit diesem Vorschlag verbunden ist.) Auch wäre es zur weiteren Analyse schön, wenn man die Daten nicht nur als wikisyntax rauskopieren könnte, um damit dann in anderen Programmen weiterzuarbeiten (z.B. ManyEyes zur Visualisierung). --[[Benutzer:Jojoon|Jojoon]] 09:01, 24. Apr. 2009 (CEST)

:Es können jetzt auch ältere Revisionen geprüft werden. Zum Export: dafür müsstest du mir sagen, in welcher Form und Ausführlichkeit die Daten interessant sind, dass du sie z.B. in ManyEyes importieren kannst. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 18:49, 24. Apr. 2009 (CEST)

::re: Darstellung eines älteren Standes auch für die 'overall statistics': Wie kann ich mit dem Tool konkret herausfinden, wie viele Edits insgesamt sowie von wem z.B. bis zum 15.09.2008 in einem Artikel getätigt wurden? re: Export von Daten: Ich bräuchte z.B. die Liste der Usernamen und der Anzahl der Edits, um sie in eine Excel-Tabelle zu kopieren. VIELEN DANK!!! --[[Benutzer:Jojoon|Jojoon]] 11:19, 14. Mai 2009 (CEST)
== Frage wg. Usern mit Minderwertigkeitskomplexen ==

Erst einmal auch Glückwünsche zum Tool. Wegen der Diskussion über die Autorennennung, wo dieses Tool ja eine Rolle spielen könnte, folgender Fall: es gibt ein Artikel ABC mit fünf normalgroßen Absätzen und zehn Autoren. Nur fünf werden als Hauptautoren genannt. Nun will ich einer werden, habe jedoch keine Ahnung vom Thema. Also kopiere ich irgendwo etwas, sagen wir zwei Monitorseiten [[Lorem ipsum]], und bringe es rein. Klar, fleißige Mitarbeiter weren mich gleich revertieren. Dennoch die Frage: wie wirkt sich das auf die Berechnung aus? [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 09:38, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Bei der Autorennennung meines Tools gar nicht. Grob gesagt kann man das wie folgt beschreiben: Es wird für jedes Wort im aktuellen Artikel (alles, was zwischendurch drinstand und jetzt wieder weg ist, zählt also nicht) geguckt, in welcher Version es zuerst auftauchte und diesem Autoren gutgeschrieben. Genauer gesagt werden jeweils die längsten vorkommenden Wortgruppen gesucht und einem Autor zugeordnet. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 12:28, 18. Apr. 2009 (CEST)
Fein. Drum ging es mir. Danke. Übrigens, irgendwo in der Anleitung sollte der Hinweis sein, dass man bei der Eingabe des Artikelnamens den richtigen heutigen Titel eintippt, nicht etwa den Titel, unter dem ich es erstellt habe. Wenn's später verschoben wurde dann bekomme ich die Werte für den Redirect (bzw. vielleicht auch spöter erstellte Begriffsklärung ohne es zu merken und ich wundere mich :-). Danke noch mals, [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 12:36, 18. Apr. 2009 (CEST)
Aha: die alphabetische Reihenfolge ist anders als in der Wiki - ich stehe nicht unter '''-'''jkb- sondern unter (-)'''j'''kb-. [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 12:36, 18. Apr. 2009 (CEST)

== Prozentzahl ==

Teilweise scheint die Prozentzahl nicht wirklich zu stimmen. Ich bin bisher der einzige, der den Artikel [[Lyle Workman]] editiert hat, das Tool gibt aber trotzdem nur 98 % an. -- [[Benutzer:Discostu|Discostu]] ([[Benutzer Diskussion:Discostu|Disk]]) 19:22, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Hmm... ja. Das Problem ist z.B. die später erfolgte Verlinkung von "Der Ja-Sager". Dadurch sind Zeichen hinzugekommen, da sie aber kein Text sind, werden sie erstmal niemandem zugeordnet... man kann also sagen, dass die fehlenden 2% nicht-urheberrechtlich relevantes ist. Du hast aber recht, dass das nicht gerade gut ist, ich werde versuchen, diese Teile bei Gelegenheit rauszunehmen, dass auch 100% insgesamt herauskommen... --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 19:43, 18. Apr. 2009 (CEST)

:Bei der neuen Version 1.0.5 werden solche Abschnitte bei der Prozentberechnung nicht mehr berücksichtigt, sodass alle Angaben zusammen jetzt immer 100% ergeben sollten. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:37, 20. Apr. 2009 (CEST)

== Eingebundene Vorlagen ==

Ich hab das Tool frecherweise auch mal ausprobiert und mir scheint derjenige der eine Vorlage einfügt wird gezählt als hätte er Text geschrieben? Das kann bei kürzeren Artikeln, und je nachdem wie umfangreich die Vorlage ist das Ergebnis verzerren. Ansonsten erstmal ein Super Tool *Daumen hoch* [[Benutzer:Lady_Whistler|Lady Whistler]][[Benutzer Diskussion:Lady Whistler|☺]] 19:48, 20. Apr. 2009 (CEST)

:Ja, das Tool analysiert, wieviel vom Artikeltext von den Personen stammt. Wenn jemand eine große Vorlage "Städte Deutschlands" erstellt hat und die in 1000 Artikel einfügt, hat er ja nicht plötzlich 20% der Wikipedia geschrieben... ich gehe davon aus, dass der Inhalt von Vorlagen (nicht die Füllung durch Parameter, die ja erfasst wird) keine urheberrechtliche Schöpfungshöhe hat. Bei den Vorlagen, die z.B. zur Auslagerung von Timelines benutzt werden, wäre die Verwendung des Textes auch eine Verzerrung, da zwar viel geschrieben aber wenig urheberrechtlich relevantes da drin steht... --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 20:49, 20. Apr. 2009 (CEST)

== Ultra Geiler Shit ==

Ich hoffe du nimmst mir das nicht übel. Aber was adäquateres als '''ultra geiler Shit''' ist mir dafür einfach nicht eingefallen. Thanks --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 19:04, 15. Mai 2009 (CEST)

== Wünsche ==

1) auch alle Wiktionarys einbauen bitte :) --[[Benutzer:WissensDürster|WissensDürster]] 11:28, 16. Mai 2009 (CEST)

==Danke==
sehr hilfreiches Tool. [[Benutzer:Splette|Splette]] 03:11, 23. Jul. 2009 (CEST)

== Download kaputt??? ==

Der Download gibt mit eine "404"? Wo kann das Tool denn nun runtergeladen werden? Viele Grüße --[[Benutzer:Thomas Wozniak|Thomas W.]] 23:36, 24. Aug. 2009 (CEST)
: Eigentlich [http://toolserver.org/~apper/WikiHistory.exe hier], eben funktionierte der DOwnload auch. Jedoch hat der Toolserver derzeit einige Macken und er ist teilweise offline. Vielleicht haste da gerade solch eine Downtime erwischt. Wenns nicht klappt, mail ich es dir die nächsten Tage rüber, ist ja nicht groß das Programm. LG -- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 00:19, 25. Aug. 2009 (CEST)

== fehlender Referrer legt WikiHistory lahm? ==

Hallo Apper,

bei mir funktioniert WikiHistory nicht mehr. Kann es sein, dass es [http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Wikipedia:Projektneuheiten&diff=prev&oldid=70734430 mit dieser Änderung] zu tun haben könnte? -- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 23:56, 20. Feb. 2010 (CET)

:Yep, da hast du recht. Ich habe das Programm korrigiert, die neue [[Benutzer:APPER/WikiHistory/1.0.7|Version 1.0.7]] sollte wieder gehen. Eine entsprechende Nachricht sollte beim Start auch per Auto-Update kommen. Grüße --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:16, 21. Feb. 2010 (CET)
::Hallo, bei meiner Version 1.0.5. kommt die Auto-Meldung nicht, und außerdem, wenn ich auf Check for updates klicke, wird mir mitgeteilt, dass es die neueste Version 1.0.6. gibt, nichts über 1.0.7. Mache ich nun maqnuell, dies nur zur Kenntnis, Gruß [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 11:06, 21. Feb. 2010 (CET)
:::Auf jeden Fall sollte jetzt auch bei 1.0.5 die 1.0.7 als neueste Version angeboten werden. Dass sie nicht automatisch kommt, könnte daran liegen, dass schonmal das Update auf 1.0.6 kam und du auf "Nein" geklickt hast, was dazu führt, dass nicht mehr beim Start gecheckt wird (nur noch manuell). --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 11:17, 21. Feb. 2010 (CET)

::::Ja, gerade entdeckt. [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 11:19, 21. Feb. 2010 (CET)
:::::Nicht schlecht, Meldung sehen, Programm korrigieren, uploaden und für die User bereitstellen inklusive Dokumentation in nur 80min. Dafür ein großes Bienchen! Wie las ich neulich: [http://www.klamm.de/partner/unter_news.php?l_id=28&news_id=177436 Microsoft entdeckt 17 Jahre alten Bug].-- [[Benutzer:Quedel|Quedel]] 15:43, 21. Feb. 2010 (CET)

::::::Daher gibt es auch einen Unterschied zwischen APPER und Microsoft :-) [[Benutzer:-jkb-|-jkb-]] 15:45, 21. Feb. 2010 (CET)

== Proxy ==

Man kann keinen Proxy eintragen. Das ist ziemlich doof wenn man Über einen Proxy surfen muss. --[[Benutzer:Bkmzde|Bkmzde]] 13:56, 22. Sep. 2010 (CEST)

:Ja, das Problem ist bekannt. Ich hab es mal auf die TODO-Liste auf der Vorderseite gesetzt. --[[Benutzer:APPER|APPER]]\[[Benutzer Diskussion:APPER|<big>☺☹</big>]] 01:11, 23. Sep. 2010 (CEST)

== Thank you ==
Hallo APPER! Vielen Dank für nettes Tool. Ich weiß, das Tool von [[: de: Wikipedia: Wikipedia_Signpost/2010-09-20/Dispatches.]] Ich war erstaunt. Dies ist sehr nützlich (meine kleine Hoffnung ist .. Wenn Sie große Veränderung zu machen, ich hoffe, Sie werden Multilingualisierung Funktion zu implementieren: D). Vielen Dank. (Hello APPER! Thank you for nice tool. I know this tool from [[:en:Wikipedia:Wikipedia_Signpost/2010-09-20/Dispatches]]. I was astonished. This is very useful (my small hope is.. When you make big change, I hope you will implement multilingualization feature :D). Thank you very much.) --[[Benutzer:Was a bee|Was a bee]] 16:08, 23. Sep. 2010 (CEST)

Wikipedia:Helferlein/HotCat

2010-09-09T19:30:24Z

Was a bee: /* Siehe auch */ + ja:Wikipedia:HotCat

'''HotCat''' ([[MediaWiki:Gadget-HotCat.js]]) ermöglicht das einfache Hinzufügen, Ändern und Entfernen von [[Hilfe:Kategorien|Kategorien]] in Artikeln bei der Artikelansicht mittels einer während der Eingabe automatisch aktualisierten Auswahlliste.
[[Datei:HotCat.png|miniatur|hochkant=1.5|HotCat in Aktion auf einer Seite]]

== Installation ==
Man muss unter einem Wikipedia-Benutzerkonto angemeldet sein, um dieses Hilfsmittel verwenden zu können. [[Spezial:Userlogin|Hier]] kann man ein solches Konto anlegen und sich anmelden. Zudem muss wie bei allen Gadgets [[JavaScript]] im Browser aktiviert sein. Der nächste Schritt ist, auf [[Spezial:Einstellungen]] in den Karteireiter „Helferlein“ zu klicken, dort im Abschnitt „Bearbeitungswerkzeuge“ den Haken vor „HotCat“ zu setzen und anschließend auf „Einstellungen speichern“ zu klicken.
Ab jetzt werden beim Betrachten einer Seite alle Kategorien in der Fußzeile mit zusätzlichen Zeichen versehen:
* „(−)“ zum Entfernen der Kategorie
* „(±)“ zum Ändern/Bearbeiten der jeweiligen Kategorie
* „(↓)“ zum Ändern der jeweiligen Kategorie in eine Unterkategorie
* „(↑)“ zum Ändern der jeweiligen Kategorie in eine Oberkategorie
* „(+)“ zum Hinzufügen einer neuen Kategorie
* „(++)“ Zur Aktivierung des Multi-Kategorien-Modus: Nach einer Kategorienänderung wird nicht mehr sofort gespeichert, sondern erst nach dem Klick auf den neu entstehenden Speichern-Knopf.
* „(×)“ Zum Zurücksetzen einer Kategorienänderung im Multi-Kategorien-Modus (Undo-Funktion)
Um das Skript zu '''deinstallieren''', entfernt man einfach den Haken in den Einstellungen und speichert diese ab.

== Einstellungen ==
Eine Seite wird, nachdem das Hinzufügen einer Kategorie mit Okay bestätigt wurde, sofort gespeichert, man gelangt nicht mehr in das Bearbeitungsfenster. Dies kann man verhindern:
* durch gleichzeitiges Drücken von {{Taste|Ctrl}} bzw. {{Taste|Strg}} ({{Taste|Cmd}} auf dem Mac), wenn man „OK“ drückt oder
* indem man folgende Zeile in seine [[Spezial:MyPage/monobook.js|Monobook]] einfügt:
<div style="padding: 1em; border: 1px dashed #2f6fab; color: black; background-color: #f9f9f9; line-height: 1.1em;"><source lang="javascript">hotcat_no_autocommit = 1;</source></div>

== Siehe auch ==
* [[commons:MediaWiki talk:HotCat.js]]
* [[:fr:Discussion MediaWiki:Gadget-HotCats.js]]
{{Shortcut|WP:HC}}

[[Kategorie:Wikipedia:Helferlein|{{SUBPAGENAME}}]]

[[ar:ويكيبيديا:المصناف الفوري]]
[[bs:Wikipedia:HotCat]]
[[da:Hjælp:HotCat]]
[[el:Βικιπαίδεια:HotCat]]
[[en:Wikipedia:HOTCAT]]
[[fa:ویکی‌پدیا:رده‌ساز]]
[[fi:Wikipedia:Pienoisohjelma/HotCat]]
[[hr:Wikipedija:HotCat]]
[[is:Wikipedia:HotCat]]
[[it:Wikipedia:Monobook.js/Hot Cat]]
[[ja:Wikipedia:HotCat]]
[[ka:ვიკიპედია:Gadget/Hotcat]]
[[lt:Vikipedija:HotCat]]
[[nl:Wikipedia:HotCat]]
[[no:Wikipedia:HotCat]]
[[pt:Wikipedia:Software/Scripts/HotCat]]
[[ru:Википедия:Гаджеты/HotCat]]
[[si:WP:HOTCAT]]
[[sl:Wikipedija:HotCat]]
[[sv:Wikipedia:Hotcat]]
[[tr:Vikipedi:Araçlar/HotCat]]
[[vi:Wikipedia:HotCat]]
[[zh:Wikipedia:维基百科工具/HotCat]]

Benutzer:Flominator/WikiBlame

2010-08-22T13:07:27Z

Was a bee: /* Technik */ +ja:Wikipedia:ツール/WikiBlame

{{Dieser Artikel|beschreibt die Funktionsweise von [http://wikipedia.ramselehof.de/wikiblame.php WikiBlame]. Fragen, Kommentare und Anregungen bitte auf die [[Benutzer_Diskussion:Flominator/WikiBlame|Diskussionsseite]]}}

__NOTOC__
'''[http://wikipedia.ramselehof.de/wikiblame.php?user_lang=de WikiBlame]''' ist ein [[Wikipedia:Helferlein|Wikipedia-Tool]] von [[Benutzer:Flominator|Flominator]], mit dem automatisiert ermittelt werden kann, in welchen [[Hilfe:Versionen|Versionen]] eines Artikels eine bestimmte [[Zeichenkette]] vorkommt. Von besonderem Interesse ist dabei die Version des ersten Vorkommens, um schnell den Urheber bzw. die [[Wikipedia:Zusammenfassung und Quelle|Zusammenfassung und Quelle]] guter, unbelegter, fragwürdiger oder gar [[WP:URV|urheberrechtlich bedenklicher]] Artikelteile zu ermitteln. Dies kann zum Beispiel für Nachfragen bei Autoren, zum [[Wikipedia:Lizenzbestimmungen|lizenzkonformen]] Kopieren von Artikelteilen oder für das Nachtragen von [[Wikipedia:Einzelnachweise|Einzelnachweisen]] notwendig sein.

==Benutzung==
Das Tool durchsucht die [[Wikipedia:Versionen|Versionsgeschichte]] eines Artikels nach einer [[Zeichenkette]]. Versionen, die den Suchbegriff enthalten, werden mit OOO markiert, während er in Versionen mit XXX fehlt. Versionen, die mit ??? gekennzeichnet sind, wurden übersprungen.

Wenn kein Wikicode (<nowiki>[, ], {, } *, #, '', ''', ==, ====, <, >, |</nowiki>) im Suchbegriff enthalten ist, wird nur reiner Text durchsucht. Will man also beispielsweise nach Interwikitags suchen, so genügt nicht ''„en:Artikelname“'', sondern es muss ''„[[en:Artikelname“'' benutzt werden.

==Einstellungen==
====Versionen durchsuchen====
*Anzahl der Versionen, die durchsucht werden.
** Tipp: ''Wenn die Anzahl der gefundenen Versionen genauso hoch ist wie die zu durchsuchende Anzahl, existieren möglicherweise noch weitere Versionen.''

====immer x Versionen überspringen====
* Ignoriert nach Prüfung einer Version die nächsten x Versionen, bevor wieder eine Version geprüft wird. Dies funktioniert nur bei einer linearen Suche.

====Versionen am Anfang überspringen====
* Ignoriert die gegebene Anzahl von Versionen am Anfang der Versionsgeschichte, bevor mit der Suche begonnen wird.

====Startdatum====
*Versionen vor 23:55 Uhr dieses Tages werden berücksichtigt

====Suche nach Wiki-Text erzwingen====
Wird diese Option aktiviert, so wird der eingegebene Text als Wikitext behandelt. Diese Funktion ist nützlich, wenn es sich beispielsweise um Teile eines Weblinks handelt.

====Suchmethode====
*linear: jede Version durchsuchen, chronologische Reihenfolge
* [[Binäre Suche]] (Intervallhalbierung, empfohlen bei einer großen Anzahl von Versionen)
** Tipp: ''Sollte bei der interpolierten Suche ein [[Hilfe:Wiederherstellen|Revert]] gefunden werden, muss die Suche erneut von einem Zeitpunkt davor gestartet werden.''
** Tipp: ''Beim Überspringen von Versionen oder bei Verwendung der interpolierten Suche bleibt naturgemäß eine Restunsicherheit, da die übersprungenen Versionen nicht geprüft werden.''
** Tipp: ''Versionskommentare geben oft Hinweise darauf, dass man weitersuchen muss (Reverts, Einfügungen aus anderen Artikeln, Vandalismus, ...)

====Sprache====
Mittlerweile gibt es Wikis der [[Wikimedia|Wikimedia Foundation]], die keine Sprachpräfixe in der URL tragen. Dazu gehört beispielsweise http://wikisource.org/. Soll ein solches Wiki durchsucht werden, gibt man im Feld für die Sprache einfach ''blank'' ein.

==Technik==
Die technische Realisierung sieht folgendermaßen aus: Es wird eine Versionsgeschichte (wie [http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Benutzer:Flominator/WikiBlame&action=history]) erzeugt, deren Beginn und Länge über die entsprechenden Eingabefelder verändert werden kann. Nun werden die Links zu den einzelnen Versionen in einem [[Feld (Datentyp)|Array]] gespeichert und die Versionen in der HTML- oder Quelltext-Version einzeln heruntergeladen und mit dem Suchtext verglichen.

{{Benutzer:Vorlage/Du_darfst}}

[[en:User:Flominator/WikiBlame]]
[[es:Usuario:XalD/WikiBlame]]
[[it:Utente:Darth Kule/WikiBlame]]
[[ja:Wikipedia:ツール/WikiBlame]]
[[pt:Wikipedia:Ferramentas/WikiBlame]]

Wikipedia:WikiProjekt Georeferenzierung

2010-07-22T19:45:19Z

Was a bee: /* Siehe auch */ ja:Wikipedia:ウィキプロジェクト地理座標

{{Index-Projekt|Georeferenzierung}}{{Shortcut|WP:GEO}}
<div style="float:right;font-size:90%;margin-left:3em;">{{Purge|Seite aktualisieren}}</div>
[[Bild:Gnome-globe.svg|right|150px|Globus]]
{{/!}}
<big><big>
→ '''[[#toc|Inhaltsverzeichnis]]''' </big></big>→ [[#Kopiervorlage|Kopiervorlage]] → [[:Kategorie:Vorlage mit Koordinate|Vorlagen mit Koordinate]] → [[#Hilfswerkzeuge|Hilfswerkzeuge]] → [[#Interna|Interna]] <big><big>
→ '''[[Spezial:Präfixindex/Wikipedia:WikiProjekt Georeferenzierung/|Unterseiten]]
</big></big>

Das '''WikiProjekt Georeferenzierung''' arbeitet an der [[Georeferenzierung]] möglichst vieler Artikel der Wikipedia. Die Artikel werden durch das Einbinden der jeweiligen [[Geographische Koordinaten|geographischen Koordinate]] mit räumlichen Informationen angereichert und beim Aufruf der [[tools:~magnus/geo/geohack.php|Map-Sources-Seite]] stehen dem Nutzer so die verschiedensten Kartenanbieter der entsprechenden Region zur Verfügung. Die Daten können im Rahmen von [[Geoinformationssystem]]en weiter genutzt werden.

'''Achtung''': Für Bilder gibt es das Projekt [[:commons:Commons:Geocoding/de|Geocoding]] bei Wikimedia-Commons.

== Kurzanleitung zur Koordinateneinbindung ==
'''Beispiel:''' Der Code zur Einbindung der Koordinate für die [[Porta Nigra]] in Trier lautet:
<pre>
{{Coordinate|NS=49.759681|EW=6.6440194|type=landmark|dim=25|region=DE-RP}}
oder
{{Coordinate|NS=49/45/34.85/N|EW=6/38/38.47/E|type=landmark|dim=25|region=DE-RP}}
</pre>
'''[[Vorlage:Coordinate#Lagewunsch|Lagewunsch]]:''' Möchtest du deinen Artikel mit Koordinaten versehen lassen, kopiere diese Vorlage in den Artikel:
<nowiki>{{</nowiki>'''[[Vorlage:Coordinate|Coordinate]]''' |NS= |EW= '''|type= |region=''' }}
Das Einfügen der Kopiervorlage ohne Werte entspricht dem alten <code><nowiki>{{</nowiki>[[Vorlage:Lagewunsch|Lagewunsch]]}}</code> und erzeugt einen Eintrag in [[:Kategorie:Geographische Lage gewünscht]]. Mit den richtigen Werten für ''region'' und ''type'' versehen, wird der Lagewunsch in Unterkategorien von [[:Kategorie:Geographische Lage gewünscht (nach Region-Code)]] und [[:Kategorie:Geographische Lage gewünscht (nach Typ)]] gestellt. Diese Kategorien werden von Ortskundigen regelmäßig abgearbeitet. Als Region-Codes werden die ISO-Codes verwendet, die du in der [[ISO-3166-1-Kodierliste]] findest.
;{{Anker|Kopiervorlage}}[[Vorlage:Coordinate#Kopiervorlage|Kopiervorlage]] (Pflichtparameter fett)
'''<nowiki>{{</nowiki>[[Vorlage:Coordinate|Coordinate]]''' |map= |article= |text= '''|NS= |EW= |type=''' |pop= |elevation= |dim= |name= '''|region='''
{{Kommentar|text={{!}}mapsize= {{!}}maplevel= {{!}}sortkey= }}'''}}'''
{| class="wikitable" id="Parameterliste"
|- class="hintergrundfarbe6"
! Parameter
! Beispiel
! width="50"| Typ
! Erklärung
! width="30"| Detail
|-
| '''NS'''
| style="text-align:center"| NS=12.345678
| style="text-align:center"| fix[a]
| Breitengrad (latitude) in Grad, Minuten und Sekunden oder Dezimalgrad (negative Werte beziehen sich auf die südliche Hemisphäre).
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#NS und EW|→]]
|-
| '''EW'''
| style="text-align:center"| EW=12.345678
| style="text-align:center"| fix[a]
| Längengrad (longitude) in Grad, Minuten und Sekunden oder Dezimalgrad (negative Werte beziehen sich auf Bereiche westlich des [[Nullmeridian]]s).
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#NS und EW|→]]

|-
| '''type'''
| style="text-align:center"| type=landmark
| style="text-align:center"| optional
| Typ des georeferenzierten Objekts.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#type|→]]
|-
| '''pop'''
| style="text-align:center"| pop=100000
| style="text-align:center"| optional
| Einwohnerzahl (population) des georeferenzierten Objekts.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#pop und elevation|→]]
|-
| '''elevation'''
| style="text-align:center"| elevation=8000
| style="text-align:center"| optional
| [[Höhe über dem Meeresspiegel]] des georeferenzierten Objekts (in Meter, ohne irgendwelche Tausendertrennzeichen, ohne von-bis Angaben).
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#pop und elevation|→]]
|-
| '''dim'''
| style="text-align:center"| dim=100
| style="text-align:center"| optional
| Durchmesser des Umkreises in Metern (Dimension des georeferenzierten Objekts).
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#dim|→]]
|-
| '''region'''
| style="text-align:center"| region=DE-SN
| style="text-align:center"| optional
| Region(en mit ›/‹ separiert) des georeferenzierten Objekts.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#region|→]]
|-
| '''name'''
| style="text-align:center"| name=Wrack der Titanic
| style="text-align:center"| optional
| Name des georeferenzierten Objekts, falls dieser nicht dem Lemma des Artikels entspricht.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#name|→]]
|-
| '''sortkey'''
| style="text-align:center"| sortkey=NS
| style="text-align:center"| optional
| Sortierung nach Breitengrad (›NS‹) und Längengrad (›EW‹) in sortierbaren Tabellen (im Fließtext).
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#sortkey|→]]
|-
| '''article'''
| style="text-align:center"| article=DMS
| style="text-align:center"| optional
| Koordinate im spezifizierten Format (default DMS) oben rechts im Artikel.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#article und text|→]]
|-
| '''text'''
| style="text-align:center"| text=DMS
| style="text-align:center"| optional
| Koordinate im spezifizierten Format im Fließtext.
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#article und text|→]]
|-
| '''map'''
| style="text-align:center"| map=right
| style="text-align:center"| optional
| Positionskarte
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#map|→]]
|-
| '''mapsize'''
| style="text-align:center"| mapsize= x180
| style="text-align:center"| optional
| Größe der Karte
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#mapsize|→]]
|-
| '''maplevel'''
| style="text-align:center"|maplevel= adm1st
| style="text-align:center"| optional
| Abweichende Karte auf der ISO Skala rauf und runter: Wertebereich [global, continental, national, adm1st, adm2nd]
| style="text-align:center"|[[Vorlage:Coordinate#maplevel|→]]
|}
)a: Aus einer Verwendung der Vorlage (sowie Infoboxen mit Georeferenz) ohne Koordinatenangabe resultiert ein Eintrag in [[:Kategorie:Geographische Lage gewünscht]]. 

Bezugssystem für die hier verwendenten Koordinaten ist das weltweit gebräuchliche [[World Geodetic System 1984|WGS84]]. Die Verwendung eines falschen Bezugssystems kann zu Fehlern bis zu mehreren Kilometern führen.

Hilfsmittel speziell für die Wikipedia gibt es als [http://www.alder-digital.de/wiki/index.php?title=Koord-ermittlungs-Tool Plugin für Google Earth] und [http://www.mcaviglia.ch/gmap/get_coor_ext.asp?l=de Google Maps Tool].

: ''Siehe auch (ganz ausführlich):'' Dokumentation der Vorlage [[Vorlage:Coordinate|Coordinate]]


__TOC__

== Nutzung der Koordinaten in der Wikipedia ==

=== Verlinkung von Kartenressourcen ===
Eine der Hauptaufgaben der verlinkten Koordinaten ist die Weiterleitung auf unterschiedliche Kartenressourcen im Internet. Die Vorlagen werden dazu derzeit auf eine externe Spezialseite ([[tools:~magnus/geo/geohack.php|Geohack]]) des [[:meta:Toolserver|Wikimedia-Toolservers]] verlinkt, wo eine große Anzahl von unterschiedlichen Diensten verlinkt ist. Der Benutzer kann hier entscheiden, welchen Service er nutzen möchte. Dadurch ist es mit nur einer Koordinatenangabe möglich, viele unterschiedliche topographische Karten, Seekarten oder Satellitenbilder aufzurufen.

Für Listen können Vorlagen genutzt werden, um alle Objekte gemeinsam auf einer Karte darzustellen: [[Vorlage:All Coordinates]] und [[Vorlage:Linked Coordinates]]. [[Vorlage:All Coordinates]] funktioniert auch in Kategorien und zeigt alle geokodierten Seiten der Kategorie, nicht aber der Unterkategorien, auf einer Karte an.

=== WikiMiniAtlas ===

[[Bild:MiniWikiAtlas screenshot.png|thumb|250px|WikiMiniAtlas eingebettet in eine Wikipediaseite (im Landkartenmodus)]]
[[Benutzer:Dschwen/WikiMiniAtlas|WikiMiniAtlas]] ist eine zoom- und scrollbare Landkarte (ähnlich wie Google Maps). Über ein kleines Javascript-Plugin wird die Geokoordinate auf einer Weltkarte eingeblendet. Das Ganze funktioniert jetzt prinzipiell für jeden angemeldeten User in der Wikipedia, da keine serverseitige Extension benötigt wird. WikiMiniAtlas zeigt die Geokoordinate des entsprechenden Artikels durch einen Punkt an und zentriert die Karte auch auf diesen. Mittels AJAX werden Wikilinks auf andere geokodierte Artikel in der Karte angezeigt. Dies ermöglicht es, die Wikipedia auf der Landkarte zu durchblättern. Verfügbare Kartendarstellungen sind:
* eine ausführliche Karte mit Ländergrenzen, Vegetation, Hauptverkehrsnetzen und besiedelten Flächen u.v.m.
* eine einfache Landmassendarstellung
* Satellitenfoto-Modus mit Landsat7-Material und Zoomstufen bis <100 m Aufösung
* MODIS dailies, täglich (!) aktualisiertes Satellitenmaterial bis ca. 500 m Auflösung
* [[tools:~dschwen/wma|Live Demo]] (dort dann von Commons auf deutschsprachig umstellen)

=== Positionskarten ===

{{Positionskarte|Bosnien und Herzegowina
|label=Brčko
|position=left
|width=150
|lat=44.87
|long=18.81
|float=right
|caption=
}}
Unter [[Vorlage:Positionskarte]] finden sich Varianten, um gleich mit der Koordinateneingabe auch eine Punktkarte zu erzeugen. Somit können die Server entlastet werden, da viel weniger Bilder notwendig sind.

== Internationale Zusammenarbeit bei der Georeferenzierung ==

=== Wikipedia-World ===
Das '''[[/Wikipedia-World|Unterprojekt:Wikipedia-World]]''' will die international gesammelten Koordinaten zusammenführen und zur Koordinierung der Projekte beitragen. Dabei befinden sich die Daten in einer Datenbank auf dem Toolserver und stehen verschiedenen Anwendungen zur Verfügung.

== Externe Nutzung der Koordinaten ==
=== [[Google Maps]] und [[Google Earth]] für die Kartenrepräsentationen georeferenzierter Wikipediaartikel ===

* Das Wikipediaprojekt [[/Wikipedia-World|Wikipedia-World]] macht die Angaben der geographischen Koordinaten für die Software [[Google Earth]] nutzbar, welche einen 3D-Globus mit Satellitenbildern darstellt.
* [http://www.tegmento.org/mapwikipedia/ tegmento], stellt die deutschen und englischen Geokoordinaten ebenfalls mit Hilfe von Google Maps dar.
* [http://www.mygeotags.com mygeotags], nutzt neben den Geokoordinaten noch ein Ortsverzeichnis mit 7,5 Mio. Orten zur Suche nach Wikipedia Artikeln und Orten.
* [http://www.geonames.org/wikipedia.html www.geonames.org], mehr als 600.000 georeferenzierte Wikipediaartikel in 185 Sprachen. Webservice für Volltextsuche über Wikipedia-Artikel und Reverse Geocoding.
* [http://www.pediax.de/ pediaX], ein „Ajax-Wikipedia-Mirror“, zeigt die 20 populärsten Artikel im gewählten Google-Maps-Kartenausschnitt, Selektion nach Typen (Berge, Gewässer) ist dabei möglich. Einnahmen über die laufenden Kosten hinaus kommen als Spenden dem Wikimedia e. V. zugute.
* [http://de.wikibymap.org/ Wiki By Map] stellt die deutschen Wikipedia-Artikel nach Kategorien (z.B. Städte, Berge, Leuchtürme, Unis, Flugplätze, Unternehmen usw.) zur Verfügung.

=== Ortssuche ===

* [http://tools.wikimedia.de/~kolossos/wp-world/place-search.php?la=de Ortssuche] mit Unterstützung verschiedener Sprachvarianten der Wikipedia. Hat zusätzlich eine einfache Kartenansicht zur Umkreissuche.
* Die einfache Kartenansicht ist auch über eine [http://tools.wikimedia.de/~kolossos/wp-world/karte.php?la=de Weltkarte] aufrufbar, bei der man einfach nur auf den gewünschten Punkt der Erde klicken muss.

=== Extension für [[MediaWiki]] ===
* Im [http://www.giswiki.org GISWiki] wird anhand von [http://www.giswiki.org/index.php/MediaWiki_GIS_Extensions#Google_Maps_Extensions Google Maps Extensions] für [[MediaWiki]] die Möglichkeit der Einbindung von [[Google Maps|Google-Maps]]-Karten im Artikel aufgezeigt.

* [http://www.giswiki.org/index.php/Point-Mapping_Extension Point-Mapping Extension]. Diese Erweiterung ermöglicht die Darstellung mehrerer Koordinaten in Verbindung mit individuellen Symbolen und weiterführenden Links.

== Extrahierung und Download von Geokoordinaten zu Wikipediaartikeln ==
=== Datenextraktion ===
[[Bild:Wikipedia Geodata Workflow.svg|thumb|Workflow der Datenextrahierung aus eine Wikipedia-Dump durch [[Benutzer:Stefan Kühn|sk]]]]
Die von den Projektteilnehmern in der Wikipedia eingefügten Geodaten liegen in den unterschiedlichsten Vorlagen, in verschiedenen Infoboxen und teilweise auch in unterschiedlichen Landeskoordinatensystemen vor. Es ist deshalb nicht trivial alle Daten direkt auszulesen. Um schnell einen Überblick zu bekommen, in welchen verschiedenen Vorlagen und Infoboxen Geodaten in den verschiedenen Sprachen der Wikipedia gesammelt werden, wurde die [[:Kategorie:Vorlage mit Koordinate]] eingeführt. Es kann also jeder mit dem entsprechenden [[Wikipedia:Dump|Wikipedia-Datenbank-Dump]] sich die Daten selber extrahieren.

Für das WP:GEO wurden von [[Benutzer:Stefan Kühn|sk]] ein paar Perl-Skripte entwickelt, die möglichst flexibel alle Daten aus den Dumps verschiedener Sprachen herausfiltern können. Ein Skript übernimmt das Auslesen aller Vorlagen mit Koordinaten. Ein zweites Skript wandelt die verschiedenen Infoboxen und Vorlagen in ein einziges Format um. Und ein drittes erzeugt KML- und CSV-Daten. Zusätzlich werden während der Filterung noch verschiedene Daten für den „Maybe-Checker“ und den „Templatetiger“ ausgegeben. Die Skripte sind freie Software, aber noch nicht ausreichend dokumentiert (kommt Januar 2008). Wer sie haben möchte, kann eine Mail an den Autor schicken.

Mittlerweile werden die Koordinaten täglich von [[:en:User:Dispenser|Benutzer:Dispenser]] aus der Datenbank ausgelesen, dafür werden die Externallinks auf den Geohack genutzt. Vorteilhaft ist, dass man somit unabhängig der verwendeten Vorlagen ist, als Nachteil ist zu erwähnen, dass nur die Daten aus der Link-URL zur Verfügung stehen. Die so gewonnenen Daten werden von [[Benutzer:Kolossos|Kolossos]] weiterverarbeitet und die verschiedenen Sprachen zu einer einzigen PostGIS-Tabelle auf dem [[meta:Toolserver|Toolserver]] vereinigt. Auf diese Datenbasis wird dann von verschiedenen Anwendungen zugegriffen bzw. die Daten zum Download angeboten, siehe [[/Wikipedia-World|Unterprojekt Wikipedia-World]].

=== Webservices ===
* http://www.geonames.org/export/wikipedia-webservice.html

=== Downloads ===
[[Bild:Imageworld-artphp3.png|thumb|Verteilungsdichte der bis 5. Oktober 2009 im Projekt [[Wikipedia:WikiProjekt Georeferenzierung|Georeferenzierung]] gesammelten Koordinaten]]

* Für die Weiternutzung der Geodaten kann bei dem Unterprojekt [[/Wikipedia-World|Wikipedia-World]] der komplette Datensatz mit über einer Million georeferenzierten Artikel in nahezu allen Sprachen als CSV-Datei heruntergeladen werden.
* Für insgesamt 8 Sprachen werden Daten zum [http://www.webkuehn.de/hobbys/wikipedia/geokoordinaten/index.htm Download] im [[Keyhole Markup Language|KML-Format]] angeboten. Es liegen 84685 Punktdatensätze aus der deutschsprachigen (Stand 23. Mai 2007) und 64323 (Stand 30. November 2006) aus der englischsprachigen Wikipedia vor.
* http://www.geonames.org/export/

== Hilfswerkzeuge ==

=== Wiki-Tool Get Coordinate ===
[[Bild:Ausgeblendet.jpg|thumb|190px|Get Coordinate - Ausgeblendet]]
[[Bild:Eingeblendet.jpg|thumb|190px|Get Coordinate - Eingeblendet]]
[[Bild:Extern.jpg|thumb|190px|Get Coordinate - Externe Version]]
Ein nützlicher Helfer um Koordinaten zu ermitteln und mit der richtigen Vorlage in Artikel einzubinden. Achtung! Dieses Tool ist noch in der Beta-Version und wurde noch nicht ausgiebig getestet. Fragen, Kommentare, gefundene Fehler oder Verbesserungswünsche bitte auf der [[Benutzer Diskussion:Mcaviglia|Diskussionsseite]] platzieren.

Das Tool kann über eine externe Seite genutzt werden oder über das monobook.js direkt in der Wiki eingebunden werden. Bei kleinen Bildschirmen kann es sein, dass die eingebundene Version nicht mehr korrekt angezeigt wird.

==== Externe Version ====
Wer das Tool nicht über die eigene JS-Datei (z. B. vector.js, monobook.js) einbinden will, kann folgenden Link verwenden:
: http://www.mcaviglia.ch/gmap/get_coor_ext.asp?l=de

==== Tool einbinden ====
Um das Tool einzubinden, folgenden Code in die eigene JS-Datei kopieren (je nach verwendetem Skin etwa [[Spezial:Meine Benutzerseite/vector.js|vector.js]] oder [[Spezial:Meine Benutzerseite/monobook.js|monobook.js]]):

// [[Benutzer:Mcaviglia]] - www.mcaviglia.ch - Zeile bitte stehen Lassen
document.write('<script type="text/javascript" src="'
+ 'http://www.mcaviglia.ch/gmap/get_coor_js.asp?l=de"></script>');

Danach wird beim Bearbeiten eines Artikels unter dem Eingabefeld eine blaue Weltkugel und der Titel "Get Coordinate" angezeigt. Mit einem Klick wird das Tool eingeblendet, der Rest erklärt sich dann von selbst.

==== Get Coordinate für Google Earth ====

Das Tool "[http://www.giswiki.org/wiki/Koordinatentool_%22hjl_get_Coor%22 hjl_get_Coor]" wurde für die Verwendung innerhalb von Google Earth um zwei zusätzliche PHP-Skripte ergänzt.
Die für die deutsche Wikipedia notwendige kmz-Datei befindet sich [http://www.alder-digital.de/wiki/images/Ald-Hjl-Koord-de.kmz '''hier''']. Nachdem das mittige Fadenkreuz ausreichend genau platziert ist, klickt man darauf und folgt dem Link ''Koordinatenspezifizierung'', daraufhin öffnet sich das Get Coordinate Formular. Es wird darum gebeten, das Fadenkreuz bei Nichtbenutzung über das Häkchen abzuschalten.

Ebenso gibt es unter http://www.alder-digital.de/wiki/index.php?title=Geonames_in_GoogleEarth die 142.000 Datensätze von www.geonames.org mit Anzeige der entsprechenden Geotags für die deutsche und englische Wikipedia.

Google-Earth spezifische Fragen und Anregung sind bitte an den [[Benutzer Diskussion:Kolossos|Entwickler]] zu stellen, Fragen zum Formular an [[Benutzer Diskussion:Mcaviglia|MCaviglia]]

==== GeoLocator ====
[[Datei:GeoLocator screenshot en.png|thumb|GeoLocator]]
Mit [http://tools.freeside.sk/geolocator/geolocator.html GeoLocator] läßt sich auch die Vorlage Coordinate generieren. Obwohl das auf GoogleMaps basierende Tool bisher wahlweise nur mit einer englischen oder slowakischen Oberfläche verfügbar ist, ist es leicht zu bedienen und bietet neben einer Rückwärtssuche (von gegebenen Koordinaten zur Adresse) sogar Unterstützung für den auf Commons benutzten ''heading''-Parameter. Wer dennoch eine (englische) Beschreibung sucht, findet diese beim Programmierer [[:en:User:Teslaton/Tools/GeoLocator|Teslaton]]. Durch die benutzerdefinierten Vorlagen kann GeoLocator an alle Bedürfnisse angepasst werden.

=== Tools außerhalb der deutschsprachigen Wikipedia ===

==== Coordinates tool ====
Ein weiteres auf GoogleMaps basierendes Werkzeug ist das auf dem Toolserver laufende [http://toolserver.org/~multichill/coordinates.php Coordinates tool]. Das vom niederländischen Benutzer [[:nl:Gebruiker:Multichill|Multichill]] geschriebene Programm bietet passende Koordinaten-Vorlagen für Commons und die niederländische Wikipedia.


=== CatScan-Tool ===

Um systematisch ganze Kategorien und damit Orte auf die Verwendung von Koordinatenvorlagen zu prüfen, kann [http://tools.wikimedia.de/~daniel/WikiSense/CategoryIntersect.php?wikilang=de&wikifam=.wikipedia.org&basecat=Bauwerk+in+M%C3%BCnchen&basedeep=3&templates=Coordinate%7CKoordinate+Text+Artikel%7CKoordinate+Text%7CKoordinate+Artikel&mode=al&go=Scannen&userlang=de Catscan] benutzt werden.

=== Ortnamenssuche im Web ===
* [http://www.geodatenzentrum.de/geodaten/gdz_rahmen.gdz_div?gdz_spr=deu&gdz_akt_zeile=3&gdz_anz_zeile=4&gdz_user_id=0&gdz_para1=1&gdz_html=99 Suche nach Orten beim Bundesamt für Kartografie und Geodäsie]
* [http://www.austrianmap.at/ Suche nach Orten in Österreich beim Bundesamt für Eich- und Vermessungswesen (BEV, ÖK50)]
* [http://www.geoland.at/ Suche nach Orten in Österreich beim geoland.at, einem GIS-Dienstleister] (Koordinaten auf Sekunden)
* [[tools:~kolossos/geonames/place-search.php|Suche nach Orten bei geonames.org incl. der Geotags]]

== {{Anker|Interna}}Projektinterna ==
=== Projektteilnehmer ===

[[Benutzer:A.fiedler|a.fiedler]],
[[Benutzer:ALE!|ALE!]],
[[Benutzer:an-d|an-d]],
[[Benutzer:Anaximander|Anaximander]],
[[Benutzer:Arcy|Arcy]],
[[Benutzer:B.gliwa|B.gliwa]],
[[Benutzer:BLueFiSH.as|BLueFiSH]],
[[Benutzer:Boente|Boente]],
[[Benutzer:Bohr|Bohr]],
[[Benutzer:Boris23|Boris23]],
[[benutzer:Carport|Carport]],
[[Benutzer:Chrkl|chris]],
[[Benutzer:Divisor|Divisor]],
[[Benutzer:Dominik1411|Dominik1411]],
[[Benutzer:Dralon|Dralon]],
[[Benutzer:Druffeler|Druffeler]],
[[Benutzer:Dschwen|Dschwen]],
[[Benutzer:Eigntlich|Eigntlich]],
[[Benutzer:Firefox13|Firefox13]],
[[Benutzer:Fragwürdig|fragwürdig]],
[[Benutzer:Geonick|Geonick]],
[[Benutzer:Gugganij|Gugganij]],
[[Benutzer:Horgner|Horgner]],
[[Benutzer:I.S.|I.S.]],
[[Benutzer:J budissin|j.budissin]],
[[Benutzer:Kay Hude|Kay Hude]],
[[Benutzer:Kh80|kh80]],
[[Benutzer:Kinibaai|Kinibaai]],
[[Benutzer:Kolossos|Kolossos]],
[[Benutzer:Lambdacore|lambdacore]],
[[Benutzer:Lilleskut|Lilleskut]],
[[Benutzer:M1968h|m1968h]],
[[Benutzer:Mazbln|Mazbln]],
[[Benutzer:Mh26|Markus (Mh26)]],
[[Benutzer:Mike Krüger|Mike Krüger]],
[[Benutzer:Mms|Mms]],
[[Benutzer:Mononoke|Mononoke]],
[[Benutzer:Netnet|Netnet]],
[[Benutzer:Newme|Newme]],
[[Benutzer:Nonanet|Nonanet]],
[[Benutzer:Onkel Pit|Onkel Pit]],
[[Benutzer:Panoramafotos.net|Panoramafotos.net]],
[[Benutzer:Proofreader/Geographie|Proofreader]],
[[Benutzer:PumpingRudi|PumpingRudi]],
[[Benutzer:Raymond|Raymond]],
[[Benutzer:Roemer|Roemer]],
[[Benutzer:Rohieb|Rohieb]],
[[Benutzer:Roterraecher|Roterraecher]],
[[Benutzer:SBT|SBT]],
[[Benutzer:Schaengel89|Schaengel89]],

[[Benutzer:Simplicius|Simplicius]],
[[Benutzer:Stardado|Denis Apel]],
[[Benutzer:Stefan Kühn|Stefan Kühn]],
[[Benutzer:Thgoiter|Thgoiter]],
[[Benutzer:Tilla|Tilla]],
[[Benutzer:Timk70|Timk70]],
[[Benutzer:Triggerhappy|Triggerhappy]],
[[Benutzer:Tronicum|Tronicum]],
[[Benutzer:Visi-on|visi-on]],
[[Benutzer:Witten|Witten]],
[[Benutzer:Wolfgang H.|Wolfgang H.]],

[[Benutzer:Zenogantner|zeno]]

=== To-do-Liste ===
Wenn du mithelfen möchtest, dann gibt es hier mehrere Listen, die abgearbeitet werden müssen.

==== Artikel ohne Koordinaten ====
* '''[http://tools.wikimedia.de/~kolossos/wp-world/maybechecker.php?lang=de Maybe-Checker]''' – Datenbankbasiertes Vorschlags-System mit Artikelanzeige und Eingrenzung auf bestimmte Kategorien, in den Sprachen Deutsch, Englisch und Tschechisch. Alle hier aufgelisteten Artikel hatten beim letzten Durchsuchen der Datenbank noch keine Koordinate, aber eine Kategorie (z. B. Ort in Deutschland, Brücke, Hotel), die darauf schließen lässt, dass es sich um einen Artikel handelt, den man georeferenzieren kann. „Maybe“ weil nicht jeder gefilterte Artikel auch unbedingt eine Geokoordinate benötigt (z. B. Liste deutscher Kirchen in Deutschland). – Man ruft den Maybe-Checker auf und schaut sich den Artikel an. Button 1) Man weiß die Koordinaten nicht. 2) Der Artikel sollte keine Koordinate bekommen. 3) Der Artikel hat mittlerweile schon eine Koordinate 4)Hab eine Koordinate gerade eingefügt. – Insbesondere der Button 2 ist interessant, weil diese Info vom Script beim nächsten Update gleich zur Vorsortierung genutzt wird, weil sonst immer wieder einige Artikel auftauchen (z. B. Fallgitter, Kopfbahnhof oder Zugbrücke).
* '''[[:Kategorie:Geographische Lage gewünscht]]''' – In dieser Kategorie werden Orte und Sehenswürdigkeiten aufgelistet, bei welchen dem entsprechendem Artikel bisher eine Koordinate fehlt.
* '''[[meta:User:Duesentrieb/CatScan|CatScan]]''' – Mit dem Tool CatScan kann man sehr schnell Artikel aus bestimmten Kategorien und Unterkategorien finden, die noch keine Koordinate enthalten. Als Beispiel gibt es hier mal die Abfragen für [http://tools.wikimedia.de/~daniel/WikiSense/CategoryIntersect.php?wikilang=de&wikifam=.wikipedia.org&basecat=Bauwerk+in+Bayern&basedeep=15&mode=ts&templates=Coordinate%7CKoordinate+Text%7CKoordinate+Artikel%7CKoordinate+Text+Artikel&untagged=on&go=Scannen&userlang=de Bauwerke in Bayern] und [http://tools.wikimedia.de/~daniel/WikiSense/CategoryIntersect.php?wikilang=de&wikifam=.wikipedia.org&basecat=Ort+in+Rheinland-Pfalz&basedeep=15&mode=ts&templates=Coordinate%7CKoordinate+Text%7CKoordinate+Artikel%7CKoordinate+Text+Artikel&untagged=on&go=Scannen&userlang=de Orte in Rheinland-Pfalz]
* [[tools:~dispenser/view/File_viewer#log:iwcoord-dewiki-CoordinateNO.log]] − Liste nicht georeferenzierter Artikel, deren Koordinaten in anderssprachigen Wikipedias verfügbar sind.

==== Artikel mit nicht verlinkten Koordinaten ====
* '''[[Spezial:Weblink-Suche/maps.google.com|Weblink-Suche nach „maps.google.com“]]''' – Mit dieser Spezialseite erhält man bei Eingabe des Suchstrings „maps.google.com“ eine Liste von Seiten, die Weblinks auf Google Maps setzen. Bis auf wenige, sinnvolle Ausnahmen sollten alle Links mit der Koordinatenvorlage umgesetzt werden. ([[Spezial:Weblink-Suche/*.wikimapia.org|wikimapia.org]] muss auch regelmäßig aufgeräumt werden)

==== Fehlerhafte Koordinaten ====
* '''[[:Kategorie:Parameterfehler]]''' – In dieser Kategorie erscheinen fehlerhafte Anwendungen der Vorlagen [[Vorlage:Coordinate|Coordinate]] und [[Vorlage:Positionskarte|Positionskarte]]([[Vorlage:Positionskarte+|+]]).
* [[tools:~dispenser/view/File_viewer#log:coord-dewiki.log]]
* [[tools:~sk/geo/dewiki_error_geo_list.htm]]
* [[Wikipedia:WikiProjekt Vorlagenauswertung|WikiProjekt Vorlagenauswertung]]
** [http://toolserver.org/~kolossos/templatetiger/tt-table4.php?template=Coordinate&lang=de&where=region&regexp=yes&is=^%5BD%5D%5BE%5D$ Koordinaten ohne deutsches Bundesland in der region-Angabe] (auch auf andere Staaten anwendbar, einfach in der URL das [D][E] durch das Kürzel des jeweiligen Staates ersetzen, z.B. [A][T] für Österreich)
** [http://tools.wikimedia.de/~kolossos/templatetiger/tt-table4.php?template=Coordinate&lang=de&where=NS&is=%5B0-9%5D{10}&regexp=yes Breitengrade, die mit 10 Nachkommastellen eine extreme Genauigkeit vorspielen, sollten gerundet werden]
** [http://tools.wikimedia.de/~kolossos/templatetiger/tt-table4.php?template=Coordinate&lang=de&where=EW&is=%5B0-9%5D{10}&regexp=yes Längengrade, die mit 10 Nachkommastellen eine extreme Genauigkeit vorspielen, sollten gerundet werden]
** [http://tools.wikimedia.de/~kolossos/templatetiger/tt-table4.php?template=Coordinate&lang=de&where=text&is=/&regexp=yes Textformat mit default „/“ nicht erwünscht (teure Parserfunktionen).]
**[http://toolserver.org/~kolossos/templatetiger/tt-table4.php?template=Coordinate&lang=de&where=region&regexp=yes&is={{urlencode:[^/A-Za-z0-9-]}} Sonderzeichen in der region-Angabe]


* [[/Fehlerliste|Fehlerliste]]
* [[/mehrere Artikel an einer Koordinate]]

== Siehe auch ==

* {{Commons|Commons:Geocoding|Geocoding für Bilder}}
* {{Commons|Commons:Geocoding/Overlay-de|Overlay von geographische Karten}}
* {{Commons|Commons:Geocoding/Panorama|Einblendung von georeferenzierten Objekten in Panorama-Bilder}}
* [[Wikipedia:Karten]]
* [[Wikipedia:GEOnet Names Server]]
* [[meta:Wikimaps|Wikimaps]]
* [[meta:Category:Extensions GIS|Meta: Category:Extensions GIS MediaWiki]]
* [[:commons:Atlas|Atlas auf Commons]]
* [[:meta:WikiProjects Geographical coordinates]]

{{DEFAULTSORT:Georeferenzierung}}
[[Kategorie:Wikipedia-WikiProjekt]]
[[Kategorie:Wikipedia:WikiProjekt]]
[[Kategorie:Wikipedia:Dokumentation]]

[[ca:Viquipèdia:Viquiprojecte Coordenades geogràfiques]]
[[da:Wikipedia:Geografiske koordinater]]
[[en:Wikipedia:WikiProject Geographical coordinates]]
[[et:Vikipeedia:Vikiprojekt Asukohainfo]]
[[fi:Wikipedia:Wikiprojekti Maantieteelliset koordinaatit]]
[[fr:Wikipédia:Jargon/Géolocalisation]]
[[ja:Wikipedia:ウィキプロジェクト地理座標]]
[[nl:Help:Externe kaarten]]
[[no:Wikipedia:Underprosjekter/Geografiske posisjoner]]
[[ru:Википедия:Проект:Географические координаты]]
[[sv:Wikipedia:Projekt geografi/Koordinater]]

Wikipedia:WikiProjekt Georeferenzierung/Hauptseite/Wikipedia-World/news

2010-06-28T10:45:08Z

Was a bee: +ja

{|style="float: right; width: 250px; border:1px solid gray; solid: #FFDF00; background: #ffffff; margin-left: 1em; border-spacing: 1px;"
|'''NEWS:''' At the moment (2010-05) we have ('''Source: '''[http://tools.wikimedia.de/~kolossos/wp-world/info.php info.php]):
'''1.35 million entries as input:'''
*en 692510
*de 146126
*nl 82614
*ru 63911
*fr 63637
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... 38 languages

''' with interwikilinks we get as output:'''
*en 933117
*nl 319045
*de 262075
*pl 235282
*fr 216713
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*it 177443
*ru 142990
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*id 46980
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*zh 44813
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*fi 34683
...in 273 languges

'''Database-Dumps''' (2010-05)
*http://toolserver.org/~kolossos/wp-world/pg-dumps/ as csv

*[[Wikipedia_Diskussion:WikiProjekt_Georeferenzierung/Wikipedia-World/news#Database_Structure_postGIS|Database structure (PostGIS)]]

All people with toolserver-account can read and use the database ''u_kolossos'' on server ptolemy. [https://wiki.toolserver.org/view/OpenStreetMap]
|}<noinclude>
[[ja:Template:言語版別_座標データ統計]]
</noinclude>

Obergericht Sendai

2010-06-18T07:10:05Z

Was a bee:

Das '''Obergericht Sendai''' ([[Japanische Schrift|jap.]] {{lang|ja-Hani|仙台高等裁判所}}, ''Sendai kōtō-saiban-sho'') ist eines von acht [[Japan|japanischen]] [[Obergericht (Japan)|Obergerichten]] und hat seinen Sitz in [[Sendai]]. Der Gerichtsbezirk umfasst den Norden der japanischen Hauptinsel [[Honshū]]. Übergeordnet ist nur der [[Oberster Gerichtshof (Japan)|Oberste Gerichtshof]].

== Weblinks ==
*[http://www.courts.go.jp/sendai-h/ Offizielle Homepage] (Japanisch und Englisch)

{{Coordinate |NS=38/15/24.3/N |EW=140/52/06.4/E |type=landmark |region=JP-04}}

[[Kategorie:Gericht (Japan)|Sendai]]
[[Kategorie:Präfektur Miyagi]]

[[ja:仙台高等裁判所]]

Teradaya-Vorfall (1862)

2010-06-05T07:58:25Z

Was a bee: /* Weblinks */ fine tuning

Als '''Teradaya-Vorfall''' ([[Japanische Schrift|jap.]] {{lang|ja|寺田屋事件}}, ''Teradaya-jiken'') werden zwei verschiedene Ereignisse in der japanischen Geschichte, genauer in der [[Bakumatsu]]-Zeit bezeichnet, die beide in derselben [[Ryokan|Herberge]] in [[Fushimi]] südlich von [[Kyoto]], der [[Teradaya]], passiert sind.

* 1862 ([[Bunkyū]] 2): Die [[Sonnō jōi|Sonnō-jōi]]-Anhänger von [[Satsuma (Han)|Satsuma]] werden liquidiert
* 1866 ([[Bunkyū]] 6): Gescheiterter Anschlag des Magistrats von Fushimi auf [[Sakamoto Ryōma]]

== 1862 ==

Beim Vorfall von 1862 verhinderte der Regent von Satsuma, [[Shimazu Hisamitsu]]<ref>[[Daimyo]] war zu diesem Zeitpunkt dessen minderjähriger Sohn, [[Shimazu Tadayoshi]]</ref> einen Anschlag auf Offizielle des Kaiserhofs und des Shogunats, der von ihm untergebenen Samurai geplant wurde.

Am [[29. Mai]] [[1862]] ([[Bunkyū]] 2/4/23 nach dem [[japanische Zeitrechnung|alten japanischen Kalender]]) befand sich Shimazu Hisamitsu, mit etwa 1000 Samurai in Kyoto, um am Kaiserhof Unterstützung für seine Reformpläne im Shogunat zu bekommen. Zu dieser Zeit war Hisamitsu noch nicht am Sturz des Shogunats ([[Tōbaku]]) interessiert, sondern an der Vereinigung der Kräfte von Shogunat und Kaiserhof ([[Kōbu gattai]]).

Einige radikalere Sonnō-jōi-Anhänger aus den Reihen seiner Samurai, angeführt von [[Arima Shinshichi]], waren damit jedoch unzufrieden. Zusammen mit Samurai aus anderen [[Han (Japan)|Han]], wie [[Maki Yasuomi]] und [[Tanaka Kawachinosuke]], versammelten sie sich im [[Ryokan]] Teradaya in Fushimi und planten einen Anschlag auf den [[Kampaku]] (Regenten am Kaiserhof) Kujō Hisatada und den [[Kyōto Shoshidai]] (Statthalter von Kyōto) [[Sakai Tadaaki]].

Hisamitsu erfuhr von diesen Plänen und schickte [[Ōkubo Toshimichi]], um die Verschwörer von ihrem Vorhaben abzubringen, jedoch ohne Erfolg. Also sendete er statt dessen Untergebene, die ebenfalls von Sonnō jōi überzeugt waren, um die Aufwiegler zur Rückkehr in die Satsuma-Residenz in Kyoto zu bewegen. Für diese Aufgabe wählte Hisamitsu neun seiner Samurai, die alle ausgezeichnete Schwertkämpfer waren, darunter [[Ōyama Tsunayoshi]], [[Narahara Shigeru]], [[Michishima Gorōbyōe]] und [[Suzuki Yūemon]].

Arima lehnte es ab, mit Ōyama in die Residenz zurückzukehren, es kam zum Streit und Schwerter wurden gezogen. Von den entsendeten Samurai wurde einer getötet (Michishima Gorōbyōe), von den Verschwörern kamen sechs ums Leben (Arima selbst, außerdem [[Shibayama Aijirō]], [[Hashiguchi Sōsuke]], [[Nishida Naogorō]], [[Deshimaru Ryūsuke]] und [[Hashiguchi Denzō]]), zwei weitere wurden schwer verletzt.

Im zweiten Stockwerk waren noch weitere Verschwörer anwesend, doch Ōyama und die anderen konnten sie durch das Senken ihrer Schwerter und eindringliche Überredung davon überzeugen, aufzugeben. Die beiden Verwundeten wurden zum [[Seppuku]] gezwungen, und die [[Ronin]] anderer Han, die sich den Verschwörern angeschlossen hatten, wurden an diese übergeben. Tanaka Kawachinosuke und andere, die an kein Han übergeben werden konnten, wurden auf ein Schiff nach Satsuma verbracht, dann an Bord getötet und ihre Leichen ins Meer geworfen.

Von den entsendeten Samurai wird berichtet, dass sie im weiteren Verlauf ihres Lebens ein unglückliches Ende nahmen, der verletzte Shibayama Aijirō soll sogar dem Wahnsinn verfallen sein. Von den überlebenden Verschwörern machten dagegen viele Karriere in der [[Meiji-Regierung]].

Durch die Niederschlagung des Aufstands konnte sich Hisamitsu als Beschützer des Hofs in Kyoto herausstellen, und das Vertrauen der Hofbeamten gewinnen. Er konnte als Beschützer einer kaiserlichen Depesche und eines kaiserlichen Botschafters nach [[Edo]] weiterreisen. Die dort durchgesetzten Maßnahmen zur Stärkung des Kōbu gattai werden auch als [[Bunkyū-Reform]]en bezeichnet.



== Quellen und Anmerkungen ==
<references />

== Weblinks ==
* [http://nihonsi.web.fc2.com/others/isuke/isuke.htm {{lang|ja|寺田屋伊助申立書}}] (Japanisch)

{{Coordinate|NS=34.930222|EW=135.759583|type=landmark|region=JP}}

[[Kategorie:Edo-Zeit]]
[[Kategorie:Kyōto]]
[[Kategorie:1862]]



[[ja:寺田屋事件]]

Hachikō

2010-05-31T06:20:08Z

Was a bee: position

[[Datei:Hachiko.JPG|thumb|upright|Hachikō]]
'''Hachikō''' ([[Japanische Schrift|jap.]] {{lang|ja-Jpan|ハチ公}} oder auch {{lang|ja-Jpan|忠犬ハチ公}} ''chūken hachikō'', ''der treue Hund Hachikō'') war ein berühmter [[Akita (Hund)|Akita-Hund]], der in [[Japan]] noch heute als Inbegriff der [[Treue]] gilt.

== Leben ==
[[File:Hachiko-hakusei.jpg|thumb|upright|Hachikō, präpariert im [[Nationalmuseum der Naturwissenschaften]]]]

Hachikō wurde am 10. November 1923 in [[Odate]] in der [[Präfektur Akita]] geboren. 1924 nahm ihn sein Besitzer, der Universitätsprofessor Hidesaburō Ueno, mit nach [[Tokio]]. Von da an holte der Hund jeden Tag sein Herrchen vom [[Bahnhof Shibuya]] ab.

Als der Professor im Mai 1925 starb, zog seine Witwe aus Tokio fort. Hachikō wurde zu in der Stadt lebenden Verwandten gegeben, riss jedoch von dort aus und kam weiterhin jeden Tag zu einer festen Zeit zum Bahnhof, um auf sein Herrchen zu warten. Schließlich übernahm Kikuzaburo Kobayashi, der frühere Gärtner von Professor Ueno, der in der Nähe des Bahnhofs wohnte, Hachikōs Pflege.

Während Hachikō in den ersten Jahren auf dem Bahnhofsgelände eher als Störenfried betrachtet und nur stillschweigend geduldet wurde, richtete ihm 1928 ein neuer Bahnhofsvorsteher sogar eine kleine Ruhemöglichkeit ein. Im gleichen Jahr erkannte ein früherer Student von Professor Ueno, der eine Forschungsarbeit über Akita-Hunde durchführte, den Hund zufällig wieder. Als er herausfand, dass Hachikō einer von nur noch etwa dreißig reinrassigen Akita-Hunden war, begann er sich näher für Hachikōs Geschichte zu interessieren und schrieb mehrere Artikel darüber. 1932 machte die Veröffentlichung eines dieser Artikel in einer Tokioter Zeitung Hachikō in ganz Japan bekannt, und er wurde schon zu Lebzeiten zum Inbegriff des treuen Hundes. Die Achtung vor Hachikō fand ihren Höhepunkt in der Errichtung einer Bronze[[statue]] an der Westseite des Bahnhofs im Jahr 1934, deren Einweihungszeremonie auch Hachikō beiwohnte.

Als Hachikō am 8. März 1935 tot in einer Straße in Shibuya gefunden wurde<ref name="ReferenceA">[[Kyodo News]]. [http://search.japantimes.co.jp/cgi-bin/nn20090625f1.html ''Hollywood the latest to fall for tale of Hachiko'']. ''[[The Japan Times]]'', June 25, 2009.</ref>, nachdem er neun Jahre lang auf sein Herrchen gewartet hatte, meldeten die Medien landesweit seinen Tod. Als Todesursache wird [[Filariose]] angegeben. Sein Körper befindet sich heute präpariert im [[Nationalmuseum der Naturwissenschaften]] im Tokioter Bezirk [[Ueno (Tokio)|Ueno]].

== Statue und Platz ==
[[Datei:Hachiko200505-4.jpg|thumb|Hachikō-Statue vor dem [[Bahnhof Shibuya]]]]
Während des [[Zweiter Weltkrieg|Zweiten Weltkrieges]] wurde die Hachikō-Statue aufgrund der herrschenden Eisenknappheit eingeschmolzen. Nach dem Krieg wurde Andō Takeshi, Sohn des mittlerweile verstorbenen Erschaffers der Originalstatue, mit der Anfertigung einer neuen Fassung beauftragt, die im August 1948 am früheren Platz aufgestellt wurde. Eine ähnliche Statue steht in der Präfektur Akita vor dem Bahnhof von Ōdate, Hachikōs Geburtsort.

Heute ist die Tokioter Hachikō-Statue ein Treffpunkt für Verabredungen am Bahnhof Shibuya.

Der westliche Bahnhofsausgang, an dem Hachikō immer gewartet hatte, heißt offiziell ''Hachikō Exit''. Er führt auf die [[Diagonalqueren|Diagonalquere]] zwischen der Bahnhofsstraße und der Einkaufsstraße ''Center-gai''.

== Verfilmungen ==

* 1987: Hachiko Monogatari (Japan; Regie [[Seijirō Kōyama]])
* 2009: [[Hachiko – Eine wunderbare Freundschaft]] (''Hachiko: A Dog's Story'') (USA, Regie: [[Lasse Hallström]])

== Siehe auch ==
* [[Argos (Hund)]]
* [[Greyfriars Bobby]]

== Einzelnachweise ==
<references />
== Weblinks ==
{{Commonscat|Hachiko|Hachikō}}

{{Coordinate |NS=35/39/32.6/N |EW=139/42/02.1/E |type=landmark |region=JP-13}}

[[Kategorie:Japanische Kultur]]
[[Kategorie:Shibuya]]
[[Kategorie:Individueller Haushund]]
[[Kategorie:Tier (Bildende Kunst)|Hund]]

[[ar:هاتشيكو]]
[[bg:Хачико]]
[[ca:Hachikō]]
[[en:Hachikō]]
[[es:Hachikō]]
[[fi:Hachikō]]
[[fr:Hachikō]]
[[id:Hachikō]]
[[it:Hachikō]]
[[ja:忠犬ハチ公]]
[[ko:충견 하치]]
[[nl:Haichiko]]
[[no:Hachikō]]
[[pl:Hachikō]]
[[pt:Hachiko]]
[[ru:Хатико]]
[[sah:Һатико]]
[[sv:Hachikō]]
[[th:ฮะจิโค]]
[[uk:Хатіко]]
[[vi:Hachikō]]
[[zh:忠犬八公]]

Shin’ya Yamanaka

2010-05-05T13:05:17Z

Was a bee: +image

[[File:Shinya Yamanaka.jpg|thumb|Shin’ya Yamanaka (2009)。]]
'''Shin’ya Yamanaka''' ([[Japanische Schrift|jap.]], {{lang|ja-Hani|山中伸弥}}, ''Yamanaka Shin’ya''; * [[1962]] in der [[Präfektur Ōsaka]]) ist ein [[japan]]ischer [[Arzt]] und [[Stammzelle]]nforscher. Er ist Professor am Institute for Frontier Medical Sciences ({{lang|ja-Hani|再生医科学研究所}}, ''Saisei Ikagaku Kenkyūjo'') an der [[Universität Kyōto]].

1987 schloss er sein Medizinstudium an der [[Universität Kōbe]] ab, 1993 promovierte er an der [[Städtische Universität Ōsaka|Städtischen Universität Ōsaka]]. Danach absolvierte er seine Assistenzzeit in der orthopädischen Chirurgie am [[National Osaka Hospital]] und war als Postdoktorand am [[Gladstone Institute of Cardiovascular Disease]] in San Francisco. 2006 gelang es seinem Team und ihm, [[induzierte pluripotente Stammzellen]] (iPS-Zellen), [[pluripotent]]e Stammzellen, aus [[Fibroblast|Bindegewebszellen]] von [[Hausmaus|Mäusen]] zu erzeugen <ref>Takahashi K, Okita K, Nakagawa M, Yamanaka S.: Induction of pluripotent stem cells from fibroblast cultures. Nat Protoc. 2007;2(12):3081-9 </ref>. 2007 gelang ihnen der gleiche Erfolg mit menschlichen Bindegewebszellen <ref>Nakagawa M, Koyanagi M, Tanabe K, Takahashi K, Ichisaka T, Aoi T, Okita K, Mochiduki Y, Takizawa N, Yamanaka S: Generation of induced pluripotent stem cells without Myc from mouse and human fibroblasts. Nat Biotechnol. 2008 Jan;26(1):101-6.
</ref>. Für diese künstliche Herstellung von Stammzellen erhielt er im November 2007 den [[Meyenburg-Preis]] vom [[DKFZ]]. 2008 wurde Yamanaka gemeinsam mit [[Hans Robert Schöler|Hans R. Schöler]] und [[Irving L. Weissman]] mit dem [[Robert-Koch-Preis]] ausgezeichnet, sowie gemeinsam mit [[Ian Wilmut]] und [[Keith Campbell (Biologe)|Keith Campbell]] mit dem [[Shaw Prize]]. 2009 erhielt er gemeinsam mit [[John Gurdon]] den [[Albert Lasker Award for Basic Medical Research]].

== Einzelnachweise ==
<references/>

== Weblinks ==
* http://frontier.kyoto-u.ac.jp/rc02/kyojuE.html
* Martin Fackler: "[http://www.nytimes.com/2007/12/11/science/11prof.html?pagewanted=all Risk Taking Is in His Genes]", in: ''[[The New York Times]]'', 11. Dezember 2007.

{{DEFAULTSORT:Yamanaka, Shinya}}
[[Kategorie:Mediziner (21. Jahrhundert)]]
[[Kategorie:Mediziner (20. Jahrhundert)]]
[[Kategorie:Hochschullehrer (Kyōto)]]
[[Kategorie:Robert-Koch-Preisträger]]
[[Kategorie:Japaner]]
[[Kategorie:Geboren 1962]]
[[Kategorie:Mann]]

{{Personendaten
|NAME=Yamanaka, Shin’ya
|ALTERNATIVNAMEN=山中伸弥 (japanisch)
|KURZBESCHREIBUNG=[[Japan|japanischer]] [[Arzt]]
|GEBURTSDATUM=1962
|GEBURTSORT=[[Präfektur Ōsaka]]
|STERBEDATUM=
|STERBEORT=
}}

[[en:Shinya Yamanaka]]
[[es:Shin'ya Yamanaka]]
[[fr:Shinya Yamanaka]]
[[he:שיניה יאמאנקה]]
[[ja:山中伸弥]]
[[ru:Яманака, Синъя]]
[[zh:山中伸彌]]

Mary (Gedankenexperiment)

2010-02-20T11:24:34Z

Was a bee: /* Weblinks */ +CommonsCat

'''Marys Zimmer''' ist ein philosophisches [[Gedankenexperiment]], das
[[Frank Cameron Jackson|Frank Jackson]] 1982 in seinem Artikel ''Epiphenomenal Qualia'' vorgestellt und 1986 in seiner Abhandlung ''What Mary Didn't Know'' erweitert hat.
Das Argument, das durch dieses Gedankenexperiment untermauert werden soll, wird häufig als das '''Wissensargument''' gegen den [[Physikalismus]] bezeichnet, also gegen die Ansicht, dass alles Existente, auch Geistiges, rein physisch ist.

== Das Gedankenexperiment ==
Das Gedankenexperiment wurde von Frank Jackson ursprünglich wie folgt
formuliert:
{| align="center"
!
! width="30px" |
!
|-
|bgcolor="#e7e7e7"|
:„Mary is a brilliant scientist who is, for whatever reason, forced to investigate the world from a black and white room via a black and white television monitor. She specializes in the neurophysiology of vision and acquires, let us suppose, all the physical information there is to obtain about what goes on when we see ripe tomatoes, or the sky, and use terms like ‘red’, ‘blue’, and so on. She discovers, for example, just which wavelength combinations from the sky stimulate the retina, and exactly how this produces via the central nervous system the contraction of the vocal chords and expulsion of air from the lungs that results in the uttering of the sentence ‘The sky is blue’. [...] What will happen when Mary is released from her black and white room or is given a color television monitor? Will she learn anything or not?“
|
|
:„Mary ist eine brillante Wissenschaftlerin, die, aus welchen Gründen auch immer, gezwungen ist, die Welt von einem schwarzweißen Raum aus mithilfe eines schwarzweißen Fernsehmonitors zu untersuchen. Sie spezialisiert sich auf die Neurophysiologie des Sehens und eignet sich, wie wir annehmen wollen, alle physikalischen Informationen an, die verfügbar sind, über das, was passiert, wenn wir reife Tomaten oder den Himmel sehen, und Begriffe wie ‚rot’, ‚blau’, usw. benutzen. Sie entdeckt zum Beispiel, welche vom Himmel ausgehenden Wellenlängen-Kombinationen genau die Netzhaut stimulieren, und wie genau dies mithilfe des zentralen Nervensystems ein Zusammenziehen der Stimmbänder und Ausstoßen von Luft aus der Lunge hervorruft, das zur Äußerung des Satzes ‚Der Himmel ist blau’ führt. [...] Was wird passieren, wenn Mary aus ihrem schwarzweißen Raum gelassen wird oder wenn man ihr einen Farbfernseher gibt? Wird sie etwas lernen oder nicht?“'' ([[#Literatur|Lit.]]: Jackson 1982, S. 130)
|}

Mit anderen Worten, stellen wir uns eine Wissenschaftlerin vor, die alles weiß, was es in der Wissenschaft der Farbwahrnehmung zu wissen gibt, die aber nie Farbe ''erlebt'' hat. Die interessante Frage, die Jackson aufwirft lautet: Lernt diese Wissenschaftlerin etwas Neues, wenn sie zum ersten Mal eine Farbwahrnehmung außerhalb ihres schwarzweißen Gefängnisses hat?

== Folgerungen ==
Sollte Mary etwas neues lernen, wenn sie ihre erste Farbwahrnehmung hat, so hat dies zwei wichtige Folgerungen: Die Existenz von phänomenalen (geistig erlebten), qualitativen Eigenschaften, Aspekten oder Bewusstseinsgehalten, die man nur ''erleben'' kann, sogenannte [[Qualia]]. Da Qualia so eng mit geistigem Erleben zusammenhängen und gerade nicht auf physikalische Erklärungen reduzierbar sind (sonst würde Marys optische Spezialisierung ausreichen, um Farben „wirklich zu kennen“), ist dies außerdem ein Argument für die Existenz von Mentalem (genauer für ''Wissen von mentalen Fakten'') und damit gegen den Physikalismus (das manchmal sog. ''Wissensargument'').

=== Qualia ===
Erstens existieren, wenn Mary etwas Neues lernt nach einem Farberlebnis, Qualia (die subjektiven, qualitativen Eigenschaften von Erlebnissen). Wenn wir das Gedankenexperiment für gültig halten, so glauben wir, dass Mary etwas gewinnt - dass sie Wissen über eine bestimmte [[Entität (Philosophie)|Entität]] erwirbt, das sie vorher nicht besaß. Dieses Wissen, so argumentiert Jackson, ist Wissen von den Qualia des Rotsehens. Deswegen müsste anerkannt werden, dass Qualia reale Eigenschaften sind, da es einen Unterschied zwischen einer Person gibt, die Zugang zu einer bestimmten Qualia hat und einer, die nicht über diesen Zugang verfügt.

=== Das Wissensargument ===
Zweitens ist, falls Mary etwas neues lernt nach einem Farberlebnis, der [[Physikalismus]] falsch. Besonders ist das Wissensargument ein Angriff auf die Behauptung der Physikalisten, dass eine physikalische Erklärung von mentalen Zuständen vollständig sei. Mary mag alles über die Farbwahrnehmung wissen, was die Wissenschaft darüber wissen kann, aber weiß sie, ''wie es ist'' die Farbe Rot zu sehen, wenn sie nie diese Farbe gesehen hat? Jackson behauptet, dass sie durch Erleben etwas neues lernt und somit, dass der [[Physikalismus]] falsch ist.

{| align="center"
!
! width="30px" |
!
|-
|bgcolor="#e7e7e7"|
:„It seems just obvious that she will learn something about the world and our visual experience of it. But then is it inescapable that her previous knowledge was incomplete. But she had all the physical information. Ergo there is more to have than that, and Physicalism is false.“
|
|
:„Es scheint offensichtlich zu sein, dass sie etwas neues über die Welt und unser visuelles Erleben dieser lernen wird. Aber dann ist es unausweichlich, dass ihr vorheriges Wissen unvollständig war. Aber sie besaß alle physikalischen Informationen. Somit gibt es mehr, als nur diese zu besitzen, und der Physikalismus ist falsch.“'' ([[#Literatur|Lit.]]: Jackson 1982, S. 130)
|}

Es ist aber wichtig zu bemerken, dass in Jacksons Artikel Physikalismus die ''erkenntnistheoretische'' Doktrin bezeichnet, nach der alles Wissen ''Wissen über physikalische Fakten'' ist, und nicht die metaphysische Doktrin, nach der alle Dinge physikalische Dinge sind.

== Reaktionen ==
=== Frank Jackson ===
Frank Jackson selbst unterstützte anfangs die antiphysikalistischen Folgerungen des Gedankenexperiments von Marys Zimmer. Jackson glaubte an die vollständige Erklärungskraft der [[Physiologie]], daran dass all unser Verhalten von irgendwelchen physikalischen Kräften verursacht ist. Das Gedankenexperiment scheint dagegen die Existenz von Qualia, nicht-physikalischen geistigen Entitäten, zu zeigen. Wenn also, so argumentierte Jackson, dies beides wahr ist, so ist der [[Epiphänomenalismus]] wahr, d.h. mentale Zustände werden durch physikalische Zustände verursacht, diese haben aber umgekehrt keinen kausalen Einfluss auf die physikalische Welt. ([[#Literatur|Lit.]]: Jackson 1982 & 1986)

Als er das Gedankenexperiment entwarf, war Jackson also Epiphänomenalist. Später lehnte er den Epiphänomenalismus dagegen ab. ([[#Literatur|Lit.]]: Jackson 2003) Dies liegt, wie er erörtert, daran, dass Mary „Wow“ sagt, wenn sie das erste Mal Rot sieht, weswegen es Marys Qualia sein müsse, die sie „Wow“ sagen lässt. Dies widerspricht dem Epiphänomenalismus. Da das Gedankenexperiment von Marys Zimmer diesen Widerspruch hervorruft, müsse etwas an ihm falsch sein. Dieser Standpunkt wird häufig als „‚there must be a reply‘ reply“ („‚es muss eine Erwiderung geben‘-Erwiderung“) bezeichnet.

Am Ende von ''Mind and Illusion'' (2003) schlägt Jackson vor, dass nur unter falschen Annahmen bezüglich Sinneswahrnehmungen folgt, dass Mary neues Wissen erwirbt. Mit der korrekten Theorie, nämlich einer [[Qualia#Repr.C3.A4sentationalistische_Strategien|repräsentationalistischen]], folge dies nicht. Nur wenn Repräsentationalismus angenommen wird, kann außerdem die überzeugendste Reaktion auf das Beispiel entwickelt werden: die u.a. von Nemirow und D. Lewis vorgeschlagene, dass Mary eine neue Fähigkeit (ability) erwirbt. Damit lässt sich der Physikalismus aufrecht erhalten.

=== Daniel Dennett ===
Der Philosoph [[Daniel Dennett]] bezeichnet das Gedankenexperiment von Mary als eine „intuition pump“, als ein Gedankenexperiment, das einfach zu verstehen und intuitiv eingänglich ist und uns dazu ermutigt seine Voraussetzungen allzu leichtfertig misszuverstehen und einfach unserer Intuition zu verfallen, dass der Ausgang des Gedankenexperiments „offensichtlich“ der ist, dass Mary etwas neues lernen wird bei ihrem ersten Farbexperiment. In seiner Monographie „Consciousness explained“ schreibt Dennett hierzu:

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:„The crucial premise is that ‚She has ''all'' the physical information.‘ That is not readily imaginable, so no one bothers. They just imagine that she knows lots and lots — perhaps they imagine that she knows everything that anyone knows ''today'' about the neurophysiology of color vision. But that's just a drop in the bucket, and it's not suprising that Mary would learn something if ''that'' were all she knew.“
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:„Die ausschlaggebende Prämisse ist, dass ‚sie ''alle'' physikalischen Informationen hat‘. Das lässt sich nicht leicht vorstellen, weswegen niemand zögert. Sie stellen sich einfach vor, dass sie sehr viel weiß - vielleicht stellen sie sich vor, dass sie alles weiß, was ''heute'' überhaupt irgendjemand über die Neurophysiologie des Farbsehens weiß. Aber das ist nur ein Tropfen auf dem heißen Stein und es ist nicht überraschend, dass Mary etwas neues lernen würde, wenn ''das'' alles wäre, was sie wüßte.“'' ([[#Literatur|Lit.]]: Dennett 1991, S. 399)
|}

Wir dürfen also, so Dennett, von unserem heutigen Wissen und aus unserer Not bei der Schließung der [[Erklärungslücke]], nicht abschätzig auf das Wissen von Mary schließen. Wir können uns im Moment nicht vorstellen, wie ein solches Wissen aussieht, aber wenn wir Mary wirklich zubilligen alles zu wissen, was verfügbar sein kann an physikalischen Wissen, so dürfen wir uns dabei jemanden, der absolut alles besitzt, was es gibt, nicht als jemanden vorstellen, der einfach „nur“ verdammt reich ist. Dennett tritt entschieden dagegen ein, dass es „offensichtlich“ sei, dass Mary bei ihrer ersten Farbwahrnehmung etwas neues lernt; dies würde einem von der Art suggeriert, wie das Gedankenexperiment in der Regel präsentiert werde. Er schlägt dem Betrachter stattdessen vor, sich vorzustellen, wie Mary nach ihrer Freilassung eine gelbe und eine blaue Banane präsentiert wird, um sie damit zu testen, und dass sie diesen Test mit Bravour besteht. Dabei ist weniger wichtig, wie sie dies im Detail tut, sondern nur, dass sie es tut. Dieser alternative Ausgang des Experiments, so Dennett, würde zwar nicht beweisen, dass Mary nichts neues lernt, aber dass der üblich nahegelegte Ausgang des Experiments nicht notwendig zeigen würde, dass sie etwas neues lernen müsse. Für Dennett ist Jacksons Gedankenexperiment daher ein

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:„classic provoker of Philosophers' Syndrome: mistaking a failure of imagination for insight into necessity.“
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:„klassischer Hervorrufer des Syndroms der Philosophen: das Verwechseln einer Unfähigkeit, sich etwas vorzustellen, mit der Einsicht in Notwendigkeit.“'' ([[#Literatur|Lit.]]: Dennett 1991, S. 401)
|}

Diese Position wurde von Dennett auch in „What RoboMary Knows“ ([[#Literatur|Lit.]]: Dennett 2003) dargestellt.

Die Debatte, die durch dieses Gedankenexperiment ausgelöst wurde, war zuletzt Inhalt einer Sammlung von Essays - ''There's Something About Mary'' (2004) - mit Erwiderungen führender Philosophen, wie [[Daniel Dennett]], [[David Kellogg Lewis|David Lewis]], and [[Paul Churchland]].

== Siehe auch ==
* [[Philosophie des Geistes]]
* [[Dualismus (Philosophie)]]
* [[Funktionalismus (Philosophie)]]

== Literatur ==
* [[Daniel Dennett]]: ''Consciousness Explained'', Little Brown and Co, Boston 1991, ISBN 0316180653.
* [[Daniel Dennett]]: ''What RoboMary Knows''. In: Torin Alter (Hrsg.) ''Knowledge Argument'', 2003. [http://ase.tufts.edu/cogstud/papers/RoboMaryfinal.htm Online-Version]
* [[Frank Jackson]]: ''Epiphenomenal Qualia''. In: ''Philosophical Quarterly'' 32, 1982, S. 127-136. [http://members.aol.com/NeoNoetics/Mary.html Online-Version]
* [[Frank Jackson]]: ''What Mary Didn't Know''. In: ''Journal of Philosophy'' 83, 1986, S. 291-295.
* Peter J. Ludlow, Yujin Nagasawa und Daniel Stoljar (Hrsg.). ''There’s something about Mary: essays on phenomenal consciousness and Frank Jackson’s knowledge argument'', MIT Press, Cambridge (Massachusetts) 2004, ISBN 0262621894 (paperback), ISBN 0262122723 (hardcover).

== Weblinks ==
* {{SEP|http://plato.stanford.edu/entries/qualia-knowledge/|Qualia: The Knowledge Argument|[[Martine Nida-Rümelin]]}}
* {{IEP|http://www.iep.utm.edu/k/know-arg.htm|The Knowledge Argument Against Physicalism|Torin Alter}}
* [[David Chalmers]]: [http://consc.net/mindpapers/1.3#.1.3a The Knowledge Argument], Bibliographie, in: MindPapers
{{Commonscat|Mary's room}}

[[Kategorie:Philosophie des Geistes]]
[[Kategorie:Gedankenexperiment]]

[[en:Mary's room]]
[[et:Mary tuba]]
[[ja:マリーの部屋]]

Gyrus parahippocampalis

2010-02-19T13:42:48Z

Was a bee: /* Additional images */ +2 images

{{Infobox Anatomy |
Name = Parahippocampal gyrus |
Latin = gyrus parahippocampalis |
GraySubject = |
GrayPage = |
Image = Human brainstem anterior view 2 description.JPG |
Caption = Human brainstem anterior view (Gyrus parahippocampalis is #7, near center right.) |
Image2 = Hippocampus (brain).jpg |
Caption2 = Parahippocampal gyrus labeled at bottom center. |
System = |
Precursor = |
MeshName = Parahippocampal+Gyrus |
MeshNumber = A08.186.211.577.710 |
NeuroLex = Parahippocampal gyrus
| NeuroLexID = birnlex_807 |
DorlandsPre = g_13 |
DorlandsSuf = 14816442 |
}}
The '''parahippocampal gyrus''' is a [[grey matter]] [[cerebral cortex|cortical]] region of the [[brain]] that surrounds the [[hippocampus]]. This region plays an important role in [[memory]] [[Encoding (memory)|encoding]] and retrieval.

It has been involved in some cases of hippocampal sclerosis.<ref name="pmid14595469">{{cite journal |author=Ferreira NF, de Oliveira V, Amaral L, Mendonça R, Lima SS |title=Analysis of parahippocampal gyrus in 115 patients with hippocampal sclerosis |journal=Arq Neuropsiquiatr |volume=61 |issue=3B |pages=707–11 |year=2003 |month=September |pmid=14595469 |doi= |url=http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0004-282X2003000500001&lng=en&nrm=iso&tlng=en}}</ref>

Asymmetry has been observed in [[schizophrenia]].<ref name="pmid10618011">{{cite journal |author=McDonald B, Highley JR, Walker MA, ''et al.'' |title=Anomalous asymmetry of fusiform and parahippocampal gyrus gray matter in schizophrenia: A postmortem study |journal=Am J Psychiatry |volume=157 |issue=1 |pages=40–7 |year=2000 |month=January |pmid=10618011 |doi= |url=http://ajp.psychiatryonline.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10618011}}</ref>

==Divisions==
The anterior part of the gyrus includes the [[perirhinal cortex|perirhinal]] and [[entorhinal]] cortices{{Citation needed|date=December 2009}}.

The term '''parahippocampal cortex''' is used to refer to an area that encompasses both the [[posterior parahippocampal gyrus]] and the medial portion of the [[fusiform gyrus]].

==Function==
===Scene recognition===
The '''parahippocampal place area''' (PPA) is a subregion of the parahippocampal cortex that plays an important role in the encoding and [[recognition]] of scenes (rather than faces or objects). [[fMRI]] studies indicate that this region of the brain becomes highly active when human subjects view topographical scene stimuli such as images of landscapes, cityscapes, or rooms (i.e. images of "places"). The region was first described by [[Russell Epstein]] (currently at the University of Pennsylvania) and [[Nancy Kanwisher]] (currently at MIT) in 1998,<ref name="urlA cortical representation of the local visual environment : Abstract : Nature">{{cite web |url=http://www.nature.com/nature/journal/v392/n6676/abs/392598a0.html |title=A cortical representation of the local visual environment : Abstract : Nature |format= |work= |accessdate=2009-11-03}}</ref> see also other similar reports by [[Geoffrey Aguirre]]<ref name="urlThe Parahippocampus Subserves Topographical Learning in Man -- Aguirre et al. 6 (6): 823 -- Cerebral Cortex">{{cite web |url=http://cercor.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/6/6/823 |title=The Parahippocampus Subserves Topographical Learning in Man -- Aguirre et al. 6 (6): 823 -- Cerebral Cortex |format= |work= |accessdate=2009-11-03}}</ref><ref name="urlNeuron - An Area within Human Ventral Cortex Sensitive to “Building” Stimuli">{{cite web |url=http://www.neuron.org/content/article/abstract?uid=PIIS0896627300805462 |title=Neuron - An Area within Human Ventral Cortex Sensitive to “Building” Stimuli |format= |work= |accessdate=2009-11-03}}</ref> and [[Alumit Ishai]].<ref name="urlDistributed representation of objects in the human ventral visual pathway — PNAS">{{cite web |url=http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/96/16/9379?maxtoshow=&HITS=10&hits=10&RESULTFORMAT=&fulltext=Ishai&searchid=1&FIRSTINDEX=0&resourcetype=HWCI |title=Distributed representation of objects in the human ventral visual pathway — PNAS |format= |work= |accessdate=2009-11-03}}</ref>

Damage to the PPA (for example, due to stroke) often leads to a syndrome in which patients cannot visually recognize scenes even though they can recognize the individual objects in the scenes (such as people, furniture, etc.). The PPA is often considered the complement of the [[fusiform face area]] (FFA), a nearby cortical region that responds strongly whenever faces are viewed, and which is believed to be important for face recognition.

===Social context===
Additional research has increased the probability that the right parahippocampal gyrus in particular has functions beyond the contextualizing of visual background. Tests by a California-based group led by Katherine P. Rankin indicate that the lobe may play a crucial role in identifying social context as well, including paralinguistic elements of verbal communication.<ref name="urlKatherine P. Rankin, a Neuropsychologist, Studies Sarcasm - NYTimes.com">{{cite web |url=http://www.nytimes.com/2008/06/03/health/research/03sarc.html?em&ex=1212724800&en=51b0f096761db2f9&ei=5087%0A+ |title=Katherine P. Rankin, a Neuropsychologist, Studies Sarcasm - NYTimes.com |format= |work= |accessdate=2009-11-03}}</ref>

==Additional images==
<gallery>
File:Parahippocampal gyrus animation small.gif|Animation. Parahippocampal gyrus shown red.
File:Gray727 parahippocampal gyrus.png|Medial surface of left cerebral hemisphere. Parahippocampal gyrus shown orange.
Image:Gehirn Frontalschnitt hippocampus.png|Coronal section
Image:Human brain inferior-medial view description.JPG|Human brain inferior-medial view
Image:Gehirn, basal - beschriftet lat.svg|Basal view of a human brain
</gallery>

==References==
{{Reflist|2}}

==External links==
* {{BrainInfo|hier|146}}
* http://www2.umdnj.edu/~neuro/studyaid/Practical2000/Q35.htm
* [http://www.temporal-lobe.com Temporal-lobe.com An interactive diagram of the rat parahippocampal-hippocampal region]

{{Prosencephalon}}
{{Papez circuit}}

[[Category:Cerebrum]]
[[Category:Neuroanatomy]]

{{neuroanatomy-stub}}

[[nl:Parahippocampale cortex]]
[[ja:海馬傍回]]